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大腸粘膜下層浸潤癌におけるmicro RNA網羅的解析

结直肠黏膜下浸润癌微小RNA综合分析

基本信息

批准号：
21K15406
负责人：
永塚真
金额：
$ 2.75万
依托单位：
Iwate Medical University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K15406/
关键词：
micro RNA messenger RNA 大腸癌大腸腫瘍

项目摘要

大腸粘膜下層浸潤癌（リンパ節転移例、非転移例）についてパラフィンからRNAを抽出した、いくつかの症例でRNAの抽出に難渋し一部固有筋層浸潤、漿膜下層浸潤症例も症例として追加した。術前化学療法が行われた症例、遺伝性腫瘍症例、免疫染色やMSI解析でMSIが示唆された症例は除外とした。結果としてリンパ節転移例18例, 非転移例21例で解析を行なった。網羅的miRNA解析はaffymetrix GeneChip miRNA Array 4.0を用いた。網羅的mRNA解析はaffymetrix Clario S human assayを用いた。リンパ節転移群と非転移群のmiRNA発現変動の比較はFDR p<0.05かつdelta Fold change>絶対値2を越えるものを抽出することとした。その結果8個のmiRNA (miR-4685-3p, 6754-3p, 6806-3p, 8085など)でup regulationを示した。down regulationを示したものは認めなかった。up regulationを示したmiRNAとmRNAの相互関係をパスウェイ解析で検討した。miRNAでup regulationを示し、down regulationを示したmRNAは7パターンであった（TMEM243とmiR-206, 4685-3p, 6754-3p, METAP1とmiR-4685-39, CAMK4とmiR-8085, TGOLN2とmiR-6806-3p, 8085）。

大网膜下追踪癌（巨噬细胞癌转移病例，非转移病例）的正常细胞提取的RNA被提取出来，巨噬细胞癌转移病例的RNA被提取出来，固定化的一部分有癌细胞被提取出来，网膜下追踪癌转移病例的正常细胞被提取出来。前化学疗法进行荧光定量分析，荧光性疾病病例，免疫染色MSI分析，显示荧光性肿瘤病例除外。结果表明，18例果葡菌病患者发生了非转移性病例，21例非转移性病例发生了解旋性病例。微生物学miRNA解析微生物学GeneChip miRNA Array 4.0应用芯片。用琼脂糖凝胶电泳法分析人的mRNA。Fold change> Fold delta fold change> Fold delta fold delta fold change> Fold delta fold change> Fold delta fold delta Fold change> Fold delta Fold change> Fold delta fold delta fold change> fold delta fold change> fold delta fold苹果8个小RNA（miR-4685- 3 p，6754- 3 p，6806- 3 p，8085寡核苷酸）上调调控基因。下调表示下调后的价格将继续上涨。上调表现为miRNA mRNA的相互作用抑制了mRNA的表达。miRNA上调表达，下调表达miR-207上调表达，下调表达miR-6754 - 3 p（TMEM 243上调miR-206，4685- 3 p，6754- 3 p，METAP 1上调miR-4685-39，CAMK 4上调miR-8085，TGOLN 2下调miR-6806- 3 p，8085）。