Genomic and epigenomic analysis of dedifferentiated liposarcoma

去分化脂肪肉瘤的基因组和表观基因组分析

• 批准号: 21K15601
• 负责人: 浅野 尚文
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Keio University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2026-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K15601/
• 关键词: 脂肪肉腫; 脱分化; ゲノム解析; クローン進化; メチル化解析; エピゲノム解析

脱分化型脂肪肉腫は、染色体12q13-15領域の高度増幅を特徴とし、高分化（以下、WD）成分と非脂肪性の増悪である脱分化（以下、DD）成分によって構成された軟部腫瘍である。一般に、12q13-15増幅を有するWD成分中に、脱分化を引き起こす新たな異常を獲得したクローンが発生し、DD成分が形成されると考えられているが、脱分化の明確なトリガーは解明されていない。我々は多領域解析を行うことで、そのクローン進化を推定した。3症例の脱分化型脂肪肉腫を対象として、10サンプルずつ腫瘍組織検体を採取し、1）ゲノム（全エクソームシーケンス）、2）エピゲノム（DNAメチル化アレイ）の多領域解析を実施した。1）各症例内の全サンプルに共通した体細胞遺伝子異常（変異＋コピー数異常）は12q13-15高度増幅を含む4、26、2個だったのに対し、同一成分（WDまたはDD）内の全サンプルに共通した遺伝子異常は、WDで27、0、12個、DDで55、26、81個であった。3例中2例においては、全サンプルに共通するものが極めて少なく、WD成分とDD成分が早期に枝分かれするクローン進化が推定された。2）WD成分は全症例において正常脂肪と類似したDNAメチル化パターンを有していたが、DD成分は症例間で傾向が異なり、症例特異的な脱メチル化が広い領域で生じていることが明らかとなった。また、メチル化パターンから予測された系統樹は、遺伝子異常から予測された系統樹と類似していた。本研究によって、一部の脱分化型脂肪肉腫においてはWD成分とDD成分が腫瘍形成の初期に分岐し、別々のクローン進化を遂げていることが明らかになった。また、脂肪分化・形成に関連する遺伝子の発現及びDNAメチル化パターンから、脱分化にDNAメチル化異常が寄与している可能性が示唆された。

The components of dedifferentiated fatty meat, chromosomal 12q13-15, highly differentiated (below, WD), non-fatty and dedifferentiated (below, DD) are characterized by high amplitude, high differentiation, and high differentiation. In general and 12q13-15, there are some ingredients in WD, dedifferentiation leads to the introduction of new ingredients, the formation of DD components, and the formation of dedifferentiation. We have made a multi-domain analysis of how to improve the presumption and improve the presumption. In 3 cases, dedifferentiated adipose tissue samples were collected, tissue samples were collected from 10% fat tissue samples, 1) full fat fat tissue samples were collected, and 2) multi-domain analysis was performed in 3 cases of dedifferentiated fatty meat disease (DNA). 1) the high amplitude of 12q13-15 contains 4, 26, 2 WD DD, WD 27, 0, 12, DD55, 26, 81 in each case. Among the 3 cases, 2 cases were diagnosed as having no symptoms, 2 cases were diagnosed as the whole family, and the components of WD and DD were not found in the early stage. 2) the category of "normal fat" of WD components is similar to that of "DNA syndrome", "normal fat", "normal fat". Please tell me that your system is similar to that of your system. In this study, the components of a dedifferentiated fat meat WD were divided in the early stages of the formation of bifurcation, and the results showed that there were significant differences in the components of the DD. The differentiation of fat, the formation of fat, the formation of fat, and the possibility of DNA differentiation and dedifferentiation are often sent to the possibility of differentiation.

项目成果

Intratumor Heterogeneity and Clonal Evolution of Dedifferentiated Liposarcoma.

去分化脂肪肉瘤的瘤内异质性和克隆进化。

• 发表时间: 2022
• 作者: Tetsuya Sekita;Naofumi Asano;Takashi Kubo;Hirohiko Totsuka;Sachiyo Mitani;Akihiko Yoshida;Eisuke Kobayashi;Akira Kawai;Morio Matsumoto;Masaya Nakamura;Robert Nakayama;Hitoshi Ichikawa
• 通讯作者: Hitoshi Ichikawa

多領域ゲノム解析による脱分化型脂肪肉腫クロー ン進化の検討

通过多区域基因组分析检查去分化脂肪肉瘤克隆进化

• 发表时间: 2022
• 作者: 関田哲也;浅野尚文
• 通讯作者: 浅野尚文

脱分化型脂肪肉腫のクローン進化

去分化脂肪肉瘤的克隆进化

• 发表时间: 2022
• 作者: 関田哲也;浅野尚文
• 通讯作者: 浅野尚文