B細胞リンパ腫発症に関わるenhancer RNAの探索

寻找参与 B 细胞淋巴瘤发展的增强子 RNA

• 批准号: 21K15598
• 负责人: 森 甚一
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Iryo Sosei University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K15598/
• 关键词: エンハンサーRNA; スーパーエンハンサー; B細胞リンパ腫

生命活動に必須の大規模かつ動的な遺伝子発現調整には、ゲノム上の非タンパクコード領域に存在するエンハンサーの集合領域、スーパーエンハンサー（SE）が重要であり、その機能発現において、SEより転写される非タンパクコードRNAであるエンハンサーRNA(eRNA)が必要であることが最近明らかとなっている。このSE/eRNA系の破綻ががんを引き起こすことを支持する知見が近年集積されつつあるが、それを明確に証明した報告はこれまでにない。我々は、血液悪性腫瘍の一種であるB細胞性リンパ腫の発症に関連する新規eRNAを同定し、かつその性状・機能を解析することを目的として本研究を実施した。SEの公開データベースを用いて、複数のB細胞リンパ腫細胞株に共通して存在するＳＥを複数特定した。その中から、Ｂ細胞リンパ腫において発現が亢進している既知の遺伝子Ａの近傍に位置するＳＥを同定した。Ｂ細胞リンパ腫細胞株Ｒａｊｉ細胞を用いて、そのＳＥ上から転写されるeRNAを同定した。Raji細胞をベースに、ゲノム編集技術を用いて、そのeRNAをコードするゲノム領域を欠失した細胞株を樹立した。予想どおり、改変細胞株においては、遺伝子Ａの発現が低下しており、eRNAが遺伝子Aの発現を制御していることが示唆された。また、この改変細胞株が親株と比較し、細胞の増殖が低下していることを見出した。さらに、免疫不全マウスにこの改変細胞株を移植したところ、形成される腫瘍サイズは親株と比較して著しく小さかった。以上の結果から、このeRNAがB細胞リンパ腫の腫瘍形成にとって重要なエレメントであることが示唆された。

Life activities require large-scale changes in the development of gene expression regulation, the existence of non-standard domain, the existence of set domain, the existence of non-standard domain (SE) is important, the functional development of non-standard RNA(eRNA) is necessary. The flaws in the SE/eRNA system have been identified in recent years. The purpose of this study is to identify and analyze the characteristics and functions of eRNA, a new type of B cell sex tumor The use of SE's public digital events enables multiple SEs to be identified that exist in common in multiple B cell lines. In addition, B cell proliferation is also observed in the vicinity of the known gene A. B cell line Raji cells were used to identify eRNA in the same way. Raji cells need to be programmed in order to establish cell lines. The expression of eRNA gene A was inhibited by the decrease of eRNA gene A expression in cell lines. The growth of the modified cell line is lower than that of the parent cell line. In addition, the immune system is not perfect. The above results show that eRNA plays an important role in the formation of tumors in B cells.

项目成果

B細胞リンパ腫発症に関わるエンハンサーRNAの探索

寻找参与 B 细胞淋巴瘤发展的增强子 RNA

• 发表时间: 2021
• 作者: Tetsuya Sekita;Naofumi Asano;Takashi Kubo;Hirohiko Totsuka;Sachiyo Mitani;Akihiko Yoshida;Eisuke Kobayashi;Akira Kawai;Morio Matsumoto;Masaya Nakamura;Robert Nakayama;Hitoshi Ichikawa;鵜沼春菜，志田隆史，植田真白，小林崇平，星野忠次，松下一之．;森 甚一
• 通讯作者: 森 甚一