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Development of non-invasive biomarker to detect colorectal cancer using urinary long non-coding RNA

开发利用尿长非编码RNA检测结直肠癌的非侵入性生物标志物

基本信息

批准号：
21K15956
负责人：
岩崎弘靖
金额：
$ 2.91万
依托单位：
Nagoya City University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K15956/
关键词：
バイオマーカー lncRNA 尿大腸癌

项目摘要

尿中long noncoding RNA(lncRNA)をパネル化することによる大腸癌診断バイオマーカーの樹立を目指して研究を進めている。前回の報告のように、尿検体を用いた網羅的解析がうまくいかなかったため、組織検体（FFPE）を用いたRNAシークエンスの結果から、lncRNA候補をピックアップし、PCRにて尿検体においても検出可能であることの確認を行った。しかしながら、なかなかうまく検出できる因子がなく、多数の因子を試すこととなり、予定より時間を要した。それでもいくつか尿中で検出可能なlncRNAを抽出し、トレーニングコホートでの定量PCRを行った。それらの因子もPCRでの抽出がやや不安定であり、トレーニングコホート全体で検証すると、検出がうまくいかない、あるいは健常者と大腸癌症例を比較し有意な差が得られない等の理由にて、検体を無駄に消費するリスクがあったため、トレーニングコホートの一部を（40例ほど）ディスカバリーコホートとして、そこでの大腸癌症例と健常者間での発現の差を検証した。その結果、発現の差がありそうな3因子を現在トレーニングコホート全体を用いて定量PCRを進めている状況である。ただ、これらの因子がバイオマーカーとして有用でないと判明したときに備え、更なる因子を網羅的解析の結果から抽出し、プライマーを設計、そのPCRでの検出の安定性の検証も並行して行っている。今後トレーニングコホートでバイオマーカーが樹立できれば、バリデーションコホートにおいても検証していく予定である。

The development of urinary long noncoding RNA(lncRNA) in the diagnosis of colorectal cancer Previous reports, urine samples, use of the network analysis, tissue samples (FFPE), use of RNA, use of the results, lncRNA candidates, PCR, urine samples, use of the network analysis, confirmation. The factors of the majority of the factors are the factors of the given time. The detection of RNA in urine is possible, and quantitative PCR is possible. The factors of PCR were extracted from all samples, and the results were compared with those of colorectal cancer. The factors of PCR were not stable, and the results of PCR were negative. The difference between the occurrence of colorectal cancer and normal colorectal cancer cases is examined. The results of quantitative PCR are different from those of quantitative PCR. The analysis results of the factors included in the analysis were extracted, designed, and tested for stability by PCR. In the future, the price of goods will be determined according to the price of goods.