人工知能のバイオシミュレーションによる膵癌細胞機能の解明と個別化療法への応用

利用人工智能生物模拟阐明胰腺癌细胞功能及其在个性化治疗中的应用

• 批准号: 21K15961
• 负责人: 向井 俊太郎
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Tokyo Medical University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K15961/
• 关键词: 膵癌; メタボローム解析; 人工知能; オミックス解析; ゲノム解析; オミックス

これまで従来の方法より正確に定量出来るCE-TOFMSという新規技術によって唾液メタボローム解析（代謝物の網羅的解析）の研究を行い、膵癌に特徴的なバイオマーカーを発見し、早期診断への有用性を報告してきた。本研究では、この技術を応用し、癌組織を用いたゲノム解析と同様に、個別化医療への可能性について考え本研究を企画・立案した。具体的には、臨床組織検体のゲノム解析と唾液・血液検体のメタボローム解析によって得られる情報と臨床情報を、人工知能（AI）を用いてオミックスとして統合化することにより、癌細胞をコンピュータ上でシミュレーション化し、膵癌に対する化学療法（抗癌剤治療）の感受性を評価することの実現性を検証する予定である。本年度は、膵癌の摘出された手術組織検体やEUS-FNBにて採取された組織を採取し、採取された組織検体をプレシジョン・メディスン開発研究センターにてRNA-seqによるトランスクリプトーム解析から癌の生物学的特徴を診断する。および治療開始前に同一患者の唾液と血液を採取して、キャピラリー電気泳動質量分析装置（CE-TOFMS）を用いた分析方法で網羅的に代謝産物を測定する予定であった。そのため、検体採取の具体的な方法や採取した検体の保存場所等の研究を開始するための準備を進めてきた。いつでも開始できる状態ではあるが、臨床で検体採取するに際し、医学倫理委員会への承認が必要であり、その申請を行っているが承認が得られていない。COIなどの問題もあり調整に難渋しており、研究計画自体の変更も余儀なくされている。

こ れ ま で 従 to の way よ り に quantitative out correct る CE - TOFMS と い う new rules technology に よ っ て saliva メ タ ボ ロ ー ム parsing (metabolites の snare parsing) の を い, に Cui carcinoma of 徴 な バ イ オ マ ー カ ー を 発 し, early diagnosis へ の usefulness を report し て き た. This study で は, こ の technology を 応 with し, cancerous tissue を with い た ゲ ノ ム parsing と with others に, individualized medical へ の possibility に つ い て え test, this research を enterprise case, し た. Specific に は, clinical tissue 検 の ゲ ノ ム parsing と saliva, blood 検 body の メ タ ボ ロ ー ム parsing に よ っ て have ら れ る intelligence と clinical, artificial intelligence を capacity (AI) を い て オ ミ ッ ク ス と し て identity change す る こ と に よ り, cancer cells を コ ン ピ ュ ー タ on で シ ミ ュ レ ー シ ョ ン し, Cui carcinoma に す seaborne る chemotherapy (anti-cancer tonic Treatment: <s:1> sensitivity を assessment 価する と と と <s:1> materiality を検 syndrome する determination である. は, Cui cancer this year の pick out さ れ た operation organization 検 body や EUS - FNB に て take さ れ た groups を し, adopting さ れ た organization 検 body を プ レ シ ジ ョ ン · メ デ ィ ス ン open 発 research セ ン タ ー に て RNA - seq に よ る ト ラ ン ス ク リ プ ト ー ム parsing か ら の cancer biology, 徴 を diagnosis す る. お よ び に before the start of treatment in patients with the same の saliva と blood を take し て, キ ャ ピ ラ リ ー electric 気 swimming quality analysis device (CE - TOFMS) を with い た analysis で snare を に metabolites determination す る designated で あ っ た. そ の た め, 検 の specific な methods や take し た 検 body の save places の research を start す る た め の prepare を into め て き た. い つ で も began で き る state で は あ る が, clinical で 検 body take す る に interstate し, medical ethics committee へ の admitted が necessary で あ り, そ の line application を っ て い る が recognise が ら れ て い な い. COIな <e:1> <s:1> problems <e:1> あ <e:1> adjustment に difficulty 渋 てお てお <e:1>, research plan self-<s:1> change <s:1> remainder なくされて る る.