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巨細胞性動脈炎の末梢血RNA-seqによる病態病勢関連因子探索と治療最適化の検討

使用外周血 RNA-seq 寻找巨细胞动脉炎的疾病相关因素并优化治疗

基本信息

批准号：
21K16283
负责人：
小林聖未
金额：
$ 2.25万
依托单位：
Tokyo Metropolitan Geriatric Hospital and Institute of Gerontology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K16283/
关键词：
巨細胞性動脈炎トランスクリプトーム解析

项目摘要

高齢者に好発する巨細胞性動脈炎 (Giant cell arteritis; GCA) は、自己免疫学的機序を背景とする大型血管炎である。本研究ではGCAを対象疾患として、全血サンプルのRNA-sequencing（トランスクリプトーム解析）を行い病勢および病態と関連のある遺伝子群を抽出することを主な目的としている。本研究計画について、所属施設の倫理審査委員会に申請を行い、審査・承認を受け、対象例のリクルート、説明・同意文書の取得、臨床データおよび実際の血液サンプルの収集を予定通り遂行中である。初発時/再燃時と病勢安定時、および対照群のトランスクリプトームデータを比較解析することで、病勢を関連のある遺伝子群を抽出することを検討している。解析手法としては、遺伝子ネットワーク推定や機械学習の主要を組み合わせ、複数の手法での検討を予定している。GCAにおいては診断および再燃判断時に有用な血清学的マーカーに乏しいことが現状である。CRPは有用な病勢マーカーの一つではあるが、特異性に乏しく、治療で用いられるトシリズマブ使用下では変動がマスクされるという問題がある。一般的に確定診断として浅側頭動脈の生検、補助診断として側頭動脈超音波検査やpositron emission tomography (PET) が施行されるが、実施可能な施設が限定されていることが現状である。上記の解析によって、より簡易に測定可能なバイオマーカー候補を抽出し、早期診断、再燃予測へ貢献する可能性が期待される。

Giant cell arteritis (GCA) is a common cause of high blood pressure. The purpose of this study is to extract the RNA-sequencing of GCA related diseases and pathologies from whole blood samples. This study plan includes the following aspects: preparation of application by Ethics Committee of affiliated institution, review, acceptance, sample selection, description, obtaining of consent document, clinical investigation, actual collection of blood samples, and preparation and implementation. Initial/reignition time, stable disease, comparative analysis of disease status, correlation of disease status, and extraction of disease status. The analysis method is to determine the main components of machine learning, and the method is to determine the parameters. GCA is useful for diagnosis and reignition. CRP is useful for disease, specific for treatment, and active for treatment. The current situation is that general definitive diagnosis, superficial cranial artery biopsy, supplementary diagnosis, lateral cranial artery ultrasound examination and positron emission tomography (PET) are still available, and practical possibilities are limited. Note the analysis, simple determination, candidate extraction, early diagnosis, reignition prediction and contribution possibilities.