ピロリン酸依存性プロテインキナーゼの探索とその構造機能解析

焦磷酸依赖性蛋白激酶的寻找及其结构和功能分析

• 批准号: 22K14825
• 负责人: 永田 隆平
• 金额: $ 2.33万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K14825/
• 关键词: ピロリン酸; キナーゼ

タンパク質のリン酸化は、キナーゼがATPから基質タンパク質へとリン酸基を受け渡すことで起こる。この反応は、細胞内でのシグナル伝達などに関わる重要な生体反応の一つである。一方、糖代謝などではATPでなくピロリン酸（PPi）をリン酸基供与体に用いるキナーゼが見つかっている。そこで本研究では、申請者が考案した探索方法によってゲノム情報からPPi依存性プロテインキナーゼを見つけ出し、その機能や反応機構を明らかにすることを目指す。本年度は、申請者が見つけたPPi依存性プロテインキナーゼの候補遺伝子TmHKの機能解析と他候補のin silicoスクリーニングによる探索を行った。TmHKは自己リン酸化を行うヒスチジンキナーゼであることから、機能解析はTmHKのリン酸化状態を電気泳動法によって分析することで行った。リン酸基に特異的に結合する試薬Phos-tag（E. Kinoshita, et al., Proteomics, 2008）を電気泳動のゲルに加えることで、目的酵素のリン酸化状態と非リン酸化状態を分離することを試みた。酵素反応における温度・時間・基質濃度などの反応条件や、泳動時のPhos-tag濃度やアクリルアミド濃度を検討することで、リン酸化されたTmHKを検出することに成功した。しかし、TmHKはATP, ADP, PPiをリン酸基供与体に用いた場合、ATPがあるときだけリン酸化され、予想に反してATP依存性であることがわかった。次に、他の候補のin silicoスクリーニングによる探索を行った。ここではスクリプトを自作することで一部の作業を自動化でき、大規模なスクリーニングを可能にした。今後、ここで確立した方法を様々な生物種に適応することで、目的酵素を効率的に探したいと考えている。

The substance is acidified, the ATP is removed, and the acid group is removed. This is an important biological reaction. One side, sugar metabolism, ATP, PPi, PPi This study aims to explore ways for applicants to examine cases, including information on PPi dependencies, information on functions, and information on reaction mechanisms. This year, the applicant has seen the PPi dependency list, the candidate list, the function analysis of TmHK, and the exploration of the candidate list. TmHK's Acidification Process The Phos-tag (E. Kinoshita, et al., Proteomics, 2008). Enzyme reaction temperature, time, substrate concentration, reaction conditions, Phos-tag concentration, pH, pH, TmHK concentration, etc. TmHK ATP, ADP, PPi acid base supply and body use in the case of ATP, ATP dependence. Next, his candidate in silicone search, search, search. This is the first time that a job has been automated, and it is possible to automate a job on a large scale. In the future, we will establish methods for the identification of biological species and target enzymes.