微生物のコロニー形成可否を決定する因子の解明

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寒天平板培養は、自然環境中の微生物を分離する手法として最も一般的で簡便な手法である。しかし、寒天培地上の環境と自然環境には大きな乖離があり、コロニー形成能を持たない多くの微生物を取り逃してしまう。微生物の寒天培地上での生育可否を決める要因を解明し培養方法を改良することで、新奇微生物の取得や新たな微生物機能の発見につながるという考えのもと研究を進めた。本研究では大腸菌を主な研究材料としてコロニー形成能を司る遺伝子を明らかにし、寒天平板培養でより多くの微生物を取得する手法開発に役立てることを目指した。大腸菌変異株ライブラリを作製し、その中からコロニー形成能に欠陥がある細胞を取得することを計画した。当初予定していた変異菌株の1細胞単離手法では細胞へのダメージが大きく、多くの細胞が死滅あるいは増殖不可能状態に陥るという問題が生じた。そこで、一細胞分離手法の見直しをはかり、いくつかの目的菌株を取得することに成功した。得られた菌株の変異挿入箇所も特定でき、コロニー形成能を司る遺伝子の候補がピックアップできた。