カイコ断片染色体を利用した人工染色体作製と断片染色体脱落率決定因子の同定

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研究材料として使用するカイコm201系統について、パルスフィールド電気泳動にて断片染色体の存在を確認した。また、パルスフィールド電気泳動にて分離した断片染色体が存在するゲルの領域を切り出して、断片染色体のみを分離した。当初はこのパルスフィールド電気泳動にて断片染色体を単離・使用する予定であったが、フローサイトメーターにて染色体を分離し断片染色体を単離することを試みた。変更理由としては、より染色体をインタクトな状態で取得することができると考えられるためであり、近年ヒトやマウスの細胞を実験材料としてフローサイトメーターにて内在染色体を分離したという報告がなされている。その報告を参考にカイコ断片染色体の分離を試みた。しかしながら、カイコ染色体のサイズが小さく、他の生物で行われている条件では、うまく染色体を分離することができなかった。そこで、染色体を分離するサンプルの検討やDNA染色方法の検討を行った。条件検討としては、着実に進んでいるものの、最終的な条件決定までには至っていない。また、フローサイトメーターによる断片染色体の分離と並行して、断片染色体の配列決定実験のために、由来が同じであるm201系統とm203系統について既にゲノム配列が判明しているp50系統とのバッククロスを実施した。今後は、このバッククロス系統のゲノムをNGSにて解析することによって、断片染色体の配列を明らかにする予定である。