淡水魚類の遺伝的撹乱実態の解明：環境DNAによる地域集団の多種同時検出技術の開発

阐明淡水鱼的遗传干扰：开发利用环境 DNA 同时检测当地种群中多个物种的技术

• 批准号: 22K14908
• 负责人: 伊藤 玄
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Ryukoku University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K14908/
• 关键词: 環境DNA; 国内外来種; タナゴ亜科魚類; mtDNA; ミナミアカヒレタビラ; 鑑賞魚メダカ; ヤリタナゴ; 遺伝的撹乱; 淡水魚類; 伊勢湾周辺域; 外来種

塩基配列解読時に異なる塩基が偶発的に取り込まれるエラーを除去し、正しい配列を読み取る技術の確立に向けた実験を行った。ブルーギルの組織から抽出したゲノムDNAをサンプルとして、1st PCR時に少ないサイクルでサンプルが増幅する系を確立するため、DNAポリメラーゼ、プライマー除去試薬、PCRのサイクル数、温度、時間の検討を行った。通常より多いサイクル数に設定した2nd PCR後の電気泳動において、各実験系におけるサンプルの増幅の有無を確かめた。その結果、特定の実験系において、目的の位置に増幅した電気泳動像を確認した。次に、環境DNAサンプルを用いて上記の実験系による再現を試みた。電気泳動の結果、上記の実験と同じ位置に増幅した電気泳動像が得られたが、非常に薄かった。シーケンスにおいて良好な結果を得るためには、PCR時の濃度を高める工夫が必要であると考えられた。国内外来種としてどのような魚種がどの地域に分布しているかを明らかにするため、文献調査、標本調査およびDNA分析を行った。これらの調査により、大阪府のミナミアカヒレタビラ、宮城県のヤリタナゴ、岐阜県の観賞魚メダカ類など、新たな地域における国内外来種を発見し、論文として報告した。国内外来種としての移入例が多いイチモンジタナゴを対象に、環境DNA種特異検出法による種内系統を識別可能な検出系の開発を行った。東海地方と近畿地方に分布するイチモンジタナゴの種内系統を一塩基多型（SNP）のジェノタイピングにより可能であることを示し、学会発表を行った。

Salt base assortment solution 読 に when different な る salt base が accidentally 発 に take り 込 ま れ る エ ラ ー を remove し, positive し い match column を 読 み る technology の establish に to け た be 験 を line っ た. ブ ル ー ギ ル の organization か ら spare し た ゲ ノ ム DNA を サ ン プ ル と し て, less 1 st PCR に な い サ イ ク ル で サ ン プ ル が rights of す を る department establish す る た め, DNA ポ リ メ ラ ー ゼ, プ ラ イ マ ー remove 薬, PCR の サ イ ク ル number, temperature, time の 検 line for を っ た. More than usually よ り い サ イ ク ル set several に し た after 2 nd PCR の electric 気 swimming に お い て, all be 験 department に お け る サ ン プ ル の rights of の presence of を か indeed め た. The そ <s:1> results, specific <s:1> experimental system にお て て て, target <s:1> position に amplitude <s:1> た electrical movement image を confirmed the た. The に and environmental DNAサ プ プ を を を are recorded in the に て, and the experimental system による reproducing the を test みた. The results of the electrokinetic motion are recorded above. The <s:1> experiment と and the じ position に increase <s:1> た electrokinetic motion image が is られたが, very に thin じ った った. シ ー ケ ン ス に お い て な good results る を た め に は, PCR の high concentration を め る time が necessary で あ る と exam え ら れ た. Domestic exotic species と し て ど の よ う な species が ど の regional distribution し に て い る か を Ming ら か に す る た め, literature survey, specimen investigation お よ び DNA analysis line を っ た. こ れ ら の survey に よ り, Osaka prefecture の ミ ナ ミ ア カ ヒ レ タ ビ ラ, miyagi 県 の ヤ リ タ ナ ゴ, gifu 県 の 観 watch fish メ ダ カ class な ど, new た な regional に お け る domestic exotic species を 発 し, paper と し て report し た. Domestic exotic species と し て の into cases more than が い イ チ モ ン ジ タ ナ ゴ を like に seaborne, environmental DNA of specific 検 に よ る intraspecific system を recognition may な 検 out started の 発 を line っ た. The east China sea where と kinki に scattered す る イ チ モ ン ジ タ ナ ゴ の intraspecific system を a salt Quito type (SNP) の ジ ェ ノ タ イ ピ ン グ に よ り may で あ る こ と を し, learn 発 table line を っ た.

项目成果

Phylogeographic structure of an endemic lineage of the eight-barbel loach Lefua echigonia around the Suzuka and Yoro Mountains, central Honshu, Japan

日本本州中部铃鹿山和养老山周围八须泥鳅 Lefua echigonia 特有谱系的系统发育地理结构

• DOI: 10.11358/biogeo.24.39
• 发表时间: 2022
• 期刊: Biogeography
• 作者: Gen Ito;Yasunori Koya
• 通讯作者: Yasunori Koya

Records and genetic characteristics of the bitterling <i>Tanakia lanceolata</i> established in the Naruse River system, Miyagi Prefecture, Japan

日本宫城县成濑川水系中苦味<i>Tanakia lanceolata</i>的记录和遗传特征

• DOI: 10.11369/jji.20-24
• 发表时间: 2022
• 期刊: Japanese Journal of Ichthyology
• 作者: 伊藤 玄;旗 薫;北村 淳一;古屋 康則
• 通讯作者: 古屋 康則

USGS(米国)

美国地质调查局（美国）

アカハライモリ渥美種族は生き残れるか？

红腹蝾螈Atsumi物种能否生存？

• 发表时间: 2022
• 作者: SENSURAT-GEN;D. SEYHAN and Y. IWATSUKI;島田知彦・田上正隆・藤谷武史・富永篤・伊藤玄・山田紗友美・出口太一・山中裕樹
• 通讯作者: 島田知彦・田上正隆・藤谷武史・富永篤・伊藤玄・山田紗友美・出口太一・山中裕樹

First record of some aquarium medaka varieties such as “Taigaiko-medaka”, in the field in Gifu Prefecture, Japan

日本岐阜县野外首次记录到一些水族馆青鳉品种，例如“Taigaiko-medaka”

• DOI: 10.20745/izu.16.0_63
• 发表时间: 2022
• 期刊: Izunuma-Uchinuma Wetland Researches
• 作者: 堀江 真子;伊藤 玄
• 通讯作者: 伊藤 玄