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淡水魚類の遺伝的撹乱実態の解明：環境DNAによる地域集団の多種同時検出技術の開発

阐明淡水鱼的遗传干扰：开发利用环境 DNA 同时检测当地种群中多个物种的技术

基本信息

批准号：
22K14908
负责人：
伊藤玄
金额：
$ 2.91万
依托单位：
Ryukoku University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

项目摘要

塩基配列解読時に異なる塩基が偶発的に取り込まれるエラーを除去し、正しい配列を読み取る技術の確立に向けた実験を行った。ブルーギルの組織から抽出したゲノムDNAをサンプルとして、1st PCR時に少ないサイクルでサンプルが増幅する系を確立するため、DNAポリメラーゼ、プライマー除去試薬、PCRのサイクル数、温度、時間の検討を行った。通常より多いサイクル数に設定した2nd PCR後の電気泳動において、各実験系におけるサンプルの増幅の有無を確かめた。その結果、特定の実験系において、目的の位置に増幅した電気泳動像を確認した。次に、環境DNAサンプルを用いて上記の実験系による再現を試みた。電気泳動の結果、上記の実験と同じ位置に増幅した電気泳動像が得られたが、非常に薄かった。シーケンスにおいて良好な結果を得るためには、PCR時の濃度を高める工夫が必要であると考えられた。国内外来種としてどのような魚種がどの地域に分布しているかを明らかにするため、文献調査、標本調査およびDNA分析を行った。これらの調査により、大阪府のミナミアカヒレタビラ、宮城県のヤリタナゴ、岐阜県の観賞魚メダカ類など、新たな地域における国内外来種を発見し、論文として報告した。国内外来種としての移入例が多いイチモンジタナゴを対象に、環境DNA種特異検出法による種内系統を識別可能な検出系の開発を行った。東海地方と近畿地方に分布するイチモンジタナゴの種内系統を一塩基多型（SNP）のジェノタイピングにより可能であることを示し、学会発表を行った。

In the case of the base alignment, the base alignment should be removed and the alignment should be established. DNA extraction and amplification in 1st PCR, DNA extraction and amplification in 1st PCR, PCR and amplification in 1st PCR Usually, the number of samples is set to 2nd PCR, and the amplitude of each sample is determined. The result, the specific system, the target position and the amplitude of the electrokinetic image are confirmed. The second, the environmental DNA, the third, the fourth. The results of the electro-migration were recorded at the same position and the electro-migration images were very thin. Good results, high concentrations, and time required for PCR The geographical distribution of exotic species in China, literature survey, Li survey and DNA analysis were carried out. This paper reports the discovery of exotic species in Osaka Prefecture, Miyagi Prefecture, Gifu Prefecture, and New Territories. The development of intraspecific systems for identification of potential alien species is discussed in this paper. In the East China Sea, the distribution of the local population is similar to that of the local population. The distribution of the local population is similar to that of the local population.