テロワールを構成する内的要因：ブドウ樹内マイクロバイオームの品種および地域間解析

本研究では、「ブドウ樹は独自の共生微生物叢（樹内マイクロフローラ）を有している」という仮説を検証するため、ブドウ樹内におけるブドウ樹内マイクロフローラの解析を行った。日本国内の11のブドウ園から4つの品種（シャルドネ、ピノ・ノワール、カベルネ・ソーヴィニヨン、甲州）の新梢（新しく生えてきた枝）をそれぞれ採取した。これらから、細菌叢の16S rRNA遺伝子（V3-V4領域）を抽出し、次世代シーケンス解析により合計7,019,600個のアンプリコン配列（46,642～285,003個／新梢）と1,305個の細菌OTUが得られた。得られたデータをもとに、多様性の評価を行った。新梢において、新梢の成長促進期には品種に関係なくガンマプロテオバクテリアが優勢であり、果実成熟開始期にはアルファプロテオバクテリアとオキシフォトバクテリアが優勢であった。甲州とピノ・ノワールの新梢における樹内マイクロフローラは、ブドウの産地に関係なく、類似していた。一方、シャルドネとカベルネ・ソーヴィニヨンの細菌叢は、ブドウ栽培地域間で多様性が見られた。アルファ多様性評価では、甲州の新梢はピノ・ノワール、シャルドネ、カベルネ・ソーヴィニヨンよりも相対的に内生菌微生物群の多様性が高く、新梢成長促進期のでは果実成熟開始期のものよりも樹内マイクロフローラの多様性が高いことがわかった。多次元尺度分析では、甲州の新梢における樹内マイクロフローラは他の品種と異なることが示された。これらのことから、ブドウの新梢における内生菌の微生物相は品種によって異なること、同じ品種であってもブドウの産地によって微生物相は概ね異なること、新梢の成長段階によって樹内マイクロフローラが変動することが示唆された。以上の内容は、Scientific Reportsにて掲載されている。

本研究では、「ブドウ樹は独自の共生微生物叢（樹内マイクロフローラ）を有している」という仮説を検証するため、ブドウ樹内におけるブドウ樹内マイクロフローラの解析を行った。日本国内の11のブドウ園から4つの品種（シャルドネ、ピノ・ノワール、カベルネ・ソーヴィニヨン、甲州）の新梢（新しく生えてきた枝）をそれぞれ採取した。これらから、細菌叢の16S rRNA遺伝子（V3-V4領域）を抽出し、次世代シーケンス解析により合計7,019,600個のアンプリコン配列（46,642～285,003個／新梢）と1,305個の細菌OTUが得られた。得られたデータをもとに、多様性の評価を行った。新梢において、新梢の成長促進期には品種に関係なくガンマプロテオバクテリアが優勢であり、果実成熟開始期にはアルファプロテオバクテリアとオキシフォトバクテリアが優勢であった。甲州とピノ・ノワールの新梢における樹内マイクロフローラは、ブドウの産地に関係なく、類似していた。一方、シャルドネとカベルネ・ソーヴィニヨンの細菌叢は、ブドウ栽培地域間で多様性が見られた。アルファ多様性評価では、甲州の新梢はピノ・ノワール、シャルドネ、カベルネ・ソーヴィニヨンよりも相対的に内生菌微生物群の多様性が高く、新梢成長促進期のでは果実成熟開始期のものよりも樹内マイクロフローラの多様性が高いことがわかった。多次元尺度分析では、甲州の新梢における樹内マイクロフローラは他の品種と異なることが示された。これらのことから、ブドウの新梢における内生菌の微生物相は品種によって異なること、同じ品種であってもブドウの産地によって微生物相は概ね異なること、新梢の成長段階によって樹内マイクロフローラが変動することが示唆された。以上の内容は、Scientific Reportsにて掲載されている。