蛍光イメージングによる時空間的なゲノムインプリンティング制御機構の解明

利用荧光成像阐明时空基因组印记控制机制

基本信息

  • 批准号:
    22K15084
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.91万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
  • 财政年份:
    2022
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2022-04-01 至 2025-03-31
  • 项目状态:
    未结题

项目摘要

ゲノム刷り込み(ゲノムインプリンティング)領域における時空間的な転写制御機構の研究を行うために、該当領域の可視化のためのプローブ設計およびその予備検証を実施した。まず特定のゲノム領域を5kbの区画に分画し、その領域に対応する最適なDNA配列を抽出した。この分画に対して、最小で20個以上の配列が割り当てられたものを解析対象として採用した。次にこれらの区画ごとで区別するための読み取り配列を付加した。さらに対象領域の遺伝子の転写を可視化するためにイントロン領域に同様のプローブの設計を行なった。これらの配列を用いて、一分子FISH法によってプローブの有用性を検証した。結果として、マウスES細胞においてインプリントを受けるMeg3やH19が片アレルから発現していることを確認した。一方ですべての細胞が片アレルから発現しているわけではなく、両アレルや全く発現していない細胞も観察された。転写バーストによって遺伝子の活性と静止状態が動的に変化している可能性がある。今後は、標的領域のプローブを用いたゲノム相互作用を含む空間配置情報や生細胞を用いた動態解析を行なうことでインプリント遺伝子の転写動態制御機構に迫る予定である。さらにプローブの検出感度を向上させるために、短鎖ヘアピンDNAを用いたHCR FISH法をseqFISH法に応用したHCR seqFISH法を確立した。この方法を用いることでプローブ数を4分の1程度に減らすことが可能になった。対象領域の拡大や検出効率の向上が見込んでいる。また転写動態の派生研究において転写動態を正確かつ簡便に観察可能な技術を開発し、当該内容を2022年12月Nature communications誌に発表した。
In the field of wireless communication, the writing system of time and space is responsible for the research and development of equipment equipment and equipment. For a specific area, the 5kb area painting is divided, the field is divided, the DNA is arranged, and the drawing is drawn. There are more than 20 separate stations and a minimum of more than 20 stations. When you analyze the image, you can use it. For the second time, please choose the matching column "pay plus money". In the field of communication, the system can be used in the same field as in the field of design. One molecule of FISH method is used to determine the usefulness of the drug. Results the results showed that the Meg3 H19 film was successfully detected and confirmed by ES cells. On one side, you can see that the cell is in full view, so that the cell can be observed. Write the possibility that the activity of the static state activity will be affected. In the future, in the field of wireless communication, the user interaction includes the space configuration, the health cell uses the dynamic analysis of the system, and the computer system is forced to determine the number of users. Make sure that the sensitivity is up, the DNA is short, the HCR FISH method is seqFISH, the HCR seqFISH method is correct. The method is used to count 4 points, 1 degree, 4 points, 1 degree, 1 degree, and so on. For example, in the field, the output rate is very high, and the output rate is very high. The research on the derivation of writing dynamics is correct. It is possible to start a technical review when this content is listed in the Nature communications table in December 2022.

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
STREAMING-Tag System: Technology to Enable Visualization of Transcriptional Activity and Subnuclear Localization of Specific Endogenous Genes
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  • DOI:
    10.1007/978-1-0716-2724-2_8
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Ohishi Hiroaki;Ochiai Hiroshi
  • 通讯作者:
    Ochiai Hiroshi
Single-gene imaging elucidates spatiotemporal relationships between transcriptional activity and regulatory factor clustering
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    大石 裕晃;島田 聖瑠;内野 哲志;Jieru Li;佐藤 優子;新谷 学文;大和田 一志;大川 恭行;Pertsinidis Alexandros;山本 卓;木村 宏;落合 博
  • 通讯作者:
    落合 博
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