腸内細菌によるエピトランスクリプトームの恒常性制御

肠道细菌对表观转录组的稳态控制

• 批准号: 22K15087
• 负责人: 寺嶋 秀騎
• 金额: $ 3万
• 依托单位: Institute of Physical and Chemical Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K15087/
• 关键词: 腸内細菌

宿主の消化管に共生する腸内細菌の乱れは、がん・炎症性腸疾患・アレルギー・肥満など様々な疾患のリスク要因であることが知られている 。したがって、これらの病態の理解や腸内細菌叢を介した治療法の開発を推進するためには、腸内細菌が宿主に与える影響の分子基盤を解明する必要がある。実際に、腸内細菌叢との相互作用により宿主の遺伝子発現は多大な影響を受けることが知られている。しかし、具体的にどの腸内細菌がどのようなシグナルを介して遺伝子発現に影響するのか、詳細な分子機構については未解明の部分が多く残されている。本研究では、通常環境下におけるマウスと腸内細菌を持たない無菌マウスの遺伝子発現をRNA-seqデータから比較解析することにより、腸内細菌からの影響を受ける遺伝子を網羅的に探索した。その結果、腸内細菌の共生により発現が変化する遺伝子群を様々な組織において多数同定することに成功した。特に注目すべきは、無菌マウスと比べて通常環境下のマウスにおいては、I型インターフェロン応答遺伝子群が過剰発現していたことである。この結果から、腸内細菌を介した遺伝子発現制御の具体的な作用点としてインターフェロン経路が候補として示唆された。そこで、インターフェロン応答に重要な役割を果たすことが知られている転写因子であるIrf9を欠損したマウスの腸管上皮からRNAを抽出し、リアルタイムPCR法によって遺伝子発現を確認したところ、顕著なインターフェロン応答遺伝子の発現変動は観察されなかった。そのため、腸内細菌による宿主の遺伝子発現誘導においてはIrf9以外の転写因子が重要な働きを担っていると考えられた。

Intestinal bacterial disturbance in the host's digestive tract, inflammatory bowel disease, obesity, and other diseases It is necessary to understand the pathogenesis of intestinal bacteria and to advance the development of therapeutic methods to understand the molecular basis of their effects on their host and host. In fact, the interaction between intestinal bacterial flora and host gene expression is affected by the interaction between intestinal bacterial flora and host gene expression. The specific intestinal bacteria are affected by the development of the gene, and the detailed molecular structure is not understood. This study aims to explore the effects of intestinal bacteria on the development of RNA-seq genes under normal circumstances. As a result, the symbiosis of intestinal bacteria has been successfully developed in most tissues. Special attention should be paid to the sterility of the virus. As a result, intestinal bacteria are detected and control specific action points and candidate pathways. In addition, the gene expression in the intestinal epithelium was detected by PCR. In addition, the host gene expression of intestinal bacteria is induced by factors other than Irf9.

项目成果

N6-methyladenosine suppresses aberrant interferon responses by regulating A-to-I RNA editing

N6-甲基腺苷通过调节 A-to-I RNA 编辑抑制异常干扰素反应

• 发表时间: 2022
• 作者: Hayato Hirai;Naomichi Takemata;Miki Tamura;Kunihiro Ohta;竹俣直道;竹俣直道;竹俣直道;竹俣直道;竹俣直道;竹俣直道;竹俣直道;竹俣直道;Hideki Terajima
• 通讯作者: Hideki Terajima