课题基金 / 基金详情

Elucidation of genome stability mechanisms involved in the establishment of allopolyploid species.

Elucidation of genome stability mechanisms involved in the establishment of allopolyploid species.
阐明异源多倍体物种建立中涉及的基因组稳定性机制。
批准号:
22K15161
负责人:
岡田 萌子
金额:
$2.91万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2022-04-01 至 2025-03-31

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
ゲノム分化と倍数性進化は、多くの動植物で一般的にみられる現象で、種分化と適応進化の原動力である。多くの倍数体植物では、倍数体化後に特定のゲノムにのみ変異が蓄積する。ムギ類のゲノムも、倍数体化後も安定な「軸ゲノム」と、変異しやすい「可変ゲノム」に分けられるが、ゲノム安定性を決める分子基盤は未解明である。さらに、軸ゲノム同士の組合せをもつ4倍体野生種は、自然界には存在しない。そこで本研究では、「ゲノム安定性の違いは異質倍数体種成立に影響するのか」という核心的「問い」を通じて、異質倍数性進化の分子基盤解明を目指す。上記の目的を達成するために、今年度はゲノム配列決定と栽培実験を行った。・ゲノム配列の変化を調査するためには参照ゲノム配列が必要であるが、ムギ類野生種の参照ゲノム配列は多くが未解読である。今年度はUゲノムについて、PacBioロングリードシーケンスとHi-C解析によるゲノム配列決定を進めた。・Uゲノム種とMゲノム種、Uゲノム種とDゲノム種の交配実験を行った。
英文摘要
ゲノム分化と倍数性進化は、多くの動植物で一般的にみられる現象で、種分化と適応進化の原動力である。多くの倍数体植物では、倍数体化後に特定のゲノムにのみ変異が蓄積する。ムギ類のゲノムも、倍数体化後も安定な「軸ゲノム」と、変異しやすい「可変ゲノム」に分けられるが、ゲノム安定性を決める分子基盤は未解明である。さらに、軸ゲノム同士の組合せをもつ4倍体野生種は、自然界には存在しない。そこで本研究では、「ゲノム安定性の違いは異質倍数体種成立に影響するのか」という核心的「問い」を通じて、異質倍数性進化の分子基盤解明を目指す。上記の目的を達成するために、今年度はゲノム配列決定と栽培実験を行った。・ゲノム配列の変化を調査するためには参照ゲノム配列が必要であるが、ムギ類野生種の参照ゲノム配列は多くが未解読である。今年度はUゲノムについて、PacBioロングリードシーケンスとHi-C解析によるゲノム配列決定を進めた。・Uゲノム種とMゲノム種、Uゲノム種とDゲノム種の交配実験を行った。
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会议论文
Allopolyploid Evolution in Wheat and its Relatives Revealed by De Novo Genome Assemblies.
从头基因组组装揭示了小麦及其近缘种的异源多倍体进化。
DOI: --
发表时间: 2022
期刊:
影响因子: --
作者: [M. Okada, K. Yoshida, K.K. Shimizu.]
通讯作者: K.K. Shimizu.
Homoeologous gene expression analysis of wheat cultivars and sunthetic hexaploid wheats as an example of cold response.
小麦品种和六倍体小麦的同源基因表达分析,以冷响应为例。
DOI: --
发表时间: 2022
期刊:
影响因子: --
作者: [M. Okada, J. Sun, T. Tameshige, M. Hatakeyama, R. Shimizu-Inatsugi, S. Takumi, J. Sese, K. K. Shimizu,]
通讯作者: K. K. Shimizu,
進化生態学研究所/University of Zurich(スイス)
进化生态学研究所/苏黎世大学(瑞士)
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Effects of allopolyploidization on homoeologous gene expression changes and environmental response in hexaploid wheat.
异源多倍化对六倍体小麦同源基因表达变化和环境响应的影响。
DOI: --
发表时间: 2023
期刊:
影响因子: --
作者: [M. Okada, J. Sun, T. Tameshige, M. Hatakeyama, R. Shimizu-Inatsugi, S. Takumi, J. Sese, K. K. Shimizu.]
通讯作者: K. K. Shimizu.
コムギ近縁ゲノム種における新規種間雑種生育不全遺伝子の同定と機能解析
  • 批准号:
    20J11239
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额:
    $1.47万
  • 财政年份:
    2020
  • 负责人:
    岡田 萌子
  • 依托单位:
海外基金