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Elucidation of genome stability mechanisms involved in the establishment of allopolyploid species.

阐明异源多倍体物种建立中涉及的基因组稳定性机制。

基本信息

批准号：
22K15161
负责人：
岡田萌子
金额：
$ 2.91万
依托单位：
Yokohama City University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

项目摘要

ゲノム分化と倍数性進化は、多くの動植物で一般的にみられる現象で、種分化と適応進化の原動力である。多くの倍数体植物では、倍数体化後に特定のゲノムにのみ変異が蓄積する。ムギ類のゲノムも、倍数体化後も安定な「軸ゲノム」と、変異しやすい「可変ゲノム」に分けられるが、ゲノム安定性を決める分子基盤は未解明である。さらに、軸ゲノム同士の組合せをもつ4倍体野生種は、自然界には存在しない。そこで本研究では、「ゲノム安定性の違いは異質倍数体種成立に影響するのか」という核心的「問い」を通じて、異質倍数性進化の分子基盤解明を目指す。上記の目的を達成するために、今年度はゲノム配列決定と栽培実験を行った。・ゲノム配列の変化を調査するためには参照ゲノム配列が必要であるが、ムギ類野生種の参照ゲノム配列は多くが未解読である。今年度はUゲノムについて、PacBioロングリードシーケンスとHi-C解析によるゲノム配列決定を進めた。・Uゲノム種とMゲノム種、Uゲノム種とDゲノム種の交配実験を行った。

Differentiation and ploidy evolution are the common phenomena of many animals and plants, and species differentiation and adaptive evolution are the driving force behind them. Many ploidy plant では, ploidy に specific のゲノムにのみ変different and accumulation する.ムギ级のゲノムも, multiplexed もstable な "axial ゲノム" と, 変different しやすい "can変ゲノム』に分けられるが, ゲノムstability をdetermine めるThe molecular base is not yet clear.さらに, axial ゲノム同士のcombination せをもつ tetraploid wild species は, natural には existing しない.そこでThis research is based on "The influence of stability and stability of heteroploid species establishment" and "Ask" at the core of という. The above-mentioned goals have been achieved, and this year's crop allocation has been decided and the cultivation will be carried out.・It is necessary to refer to the survey of the change of the arrangement of the arrangement The あるが and ムギ-like wild species are referred to the ゲノム arrangement and the unsolved 読である. This year's はUゲノムについて, PacBio ロングリードシーケンスとHi-C analysis によるゲノム arrangement decision was made.・Uゲノムkind and Mゲノムkind, Uゲノムkind and Dゲノムkind of matingの験を行った.