耐性遺伝子を指標とした微生物資源からの新規薬剤シーズの探索

以抗性基因为指标从微生物资源中寻找新药种子

• 批准号: 22K15305
• 负责人: 堤 隼馬
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Kitasato University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K15305/
• 关键词: 天然物; 耐性遺伝子; ゲノムマイニング

近年の微生物ゲノム配列解読により、微生物は実際に取得されている数以上の天然物の生産能力を有していることが明らかになってきた。そのため、ゲノムデータを利用した天然物探索も盛んに行われるようになった。しかし、ゲノムベースが膨大であることもあり、探索標的の選定に工夫が必要で、労力もかかるため、効率的かつ有効にデータを利用した天然物探索は行うことができていない。本研究ではゲノムデータベースに登録されているゲノムデータの中から、耐性遺伝子を指標に天然物の生合成遺伝子クラスター (BGC) を探索することを目的とした。探索には網羅的に様々な標的BGCを探索するため、目的の耐性遺伝子を含むBGCを自動で探索プログラミングを構築し、効率的かつ網羅的にゲノムベース探索を行う。

In recent years, microbial ゲ の ノ ム match column solution 読 に よ り, microbial は be interstate に obtain さ れ て い る number above の を natural things の production capacity have し て い る こ と が Ming ら か に な っ て き た. Youdaoplaceholder0 そ ため, ゲノムデ そ タを タを using <s:1> natural substances to explore んに and われるようになった. し か し, ゲ ノ ム ベ ー ス が swelled で あ る こ と も あ り, explore the underlying の に selected time が necessary で, 労 も か か る た め, sharper rate か つ have sharper に デ ー タ を using し た line natural things to explore は う こ と が で き て い な い. This study で は ゲ ノ ム デ ー タ ベ ー ス に login さ れ て い る ゲ ノ ム デ ー タ の in か ら に natural things, patience but 伝 を index の biosynthesis heritage 伝 son ク ラ ス タ ー (BGC) を explore す る こ と を purpose と し た. Explore に は snare of に others 々 な mark BGC を explore す る た め, objective の patience but 伝 を containing む BGC を automatic で explore プ ロ グ ラ ミ ン グ を build し, sharper rate か つ snare of に ゲ ノ ム ベ ー ス explore う を line.

项目成果

SELECTIVE ISOLATION OF RARE ACTINOMYCETES USING AGAR MEDIUM CONTAINING LYSOZYME AND SEARCH FOR NOVEL BIOACTIVE COMPOUNDS

利用含溶菌酶的琼脂培养基选择性分离稀有放线菌并寻找新型生物活性化合物

• 发表时间: 2023
• 作者: Yuta Awano;Hiroki Kanto;Akira Take;Yuta Kikuchi;Aoi Kimishima;Hayama Tsutsumi;Masato Iwatsuki;Yukihiro Asami;Yuki Inahashi
• 通讯作者: Yuki Inahashi

Insights into the structure?activity relationship of a type III secretion system inhibitor, aurodox

深入了解 III 型分泌系统抑制剂 aurodox 的构效关系

• DOI: 10.1016/j.bmcl.2022.128779
• 发表时间: 2022
• 期刊: Bioorganic &amp; Medicinal Chemistry Letters
• 作者: Kimishima Aoi;Hagimoto Daichi;Honsho Masako;Watanabe Yoshihiro;Iwatsuki Masato;Tsutsumi Hayama;Inahashi Yuki;Naher Kamrun;Sakai Kazunari;Kuwae Asaomi;Abe Akio;Asami Yukihiro
• 通讯作者: Asami Yukihiro

希少放線菌を対象とした二次代謝産物生合成能力の網羅的解析および新規天然物の探索

稀有放线菌次生代谢产物生物合成能力综合分析及天然产物寻找

• 发表时间: 2023
• 作者: 菊池 雄太;渡邊 善洋;川口 彩乃;堤 隼馬;伊藤 翔;岩月 正人;稲橋 佑起
• 通讯作者: 稲橋 佑起

Lysozyme添加寒天培地により分離される放線菌の網羅的解析

添加溶菌酶的琼脂培养基上分离的放线菌的综合分析

• 发表时间: 2022
• 作者: 粟野 友太;菅藤 裕貴;武 晃;菊池 雄太;君嶋 葵;堤 隼馬;岩月 正人;浅見 行弘;稲橋 佑起
• 通讯作者: 稲橋 佑起

希少放線菌を対象とした二次代謝産物生合成能力の網羅的解析

稀有放线菌次生代谢产物生物合成能力综合分析

• 发表时间: 2022
• 作者: 菊池 雄太;堤 隼馬;稲橋 佑起
• 通讯作者: 稲橋 佑起