微小乳頭状肺腺癌の分子基盤の解明　-空間的遺伝子発現解析によるアプローチ-

阐明微乳头状肺腺癌的分子基础-使用空间基因表达分析的方法-

基本信息

批准号：
22K15410
负责人：
小池千尋
金额：
$ 2.91万
依托单位：
Yokohama City University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

项目摘要

EGFR変異を持つ肺腺癌（以下、EGFR肺腺癌）には、急速に進行し、また極めて予後不良な一群が存在する。研究代表者は、これまでに、EGFR肺腺癌の組織学的予後因子が微小乳頭状亜型であることを突き止め、また、微小乳頭状亜型成分をマイクロダイセクション法を用いて、他の亜型と分けて採取し、網羅的分子解析を行うことで、微小乳頭状亜型に特有の分子異状を同定することに成功している。しかし、一方で、今までの実験では、カバーガラスのない顕微鏡観察下の分取で判別精度が低い、分解能が低く亜型成分を網羅的に分取するのが難しい、長時間の作業でRNAが劣化する、などの問題点がある。そこで、本課題では問題点を解決すべく空間的発現解析法（VisiumTM: 組織切片上で約55μm格子毎の位置情報を保持しながら網羅的発現解析を行う革新的技術）を取り入れ、同一腫瘍内の多様な亜型成分の遺伝子発現特性を比較し、置換型から微小乳頭状亜型に至る多段階的な進展過程の分子基盤を追求する。当該年度は、外科的切除されたEGFR変異を有する肺腺癌4症例のFFPEを用いて、空間的発現解析（VisiumTM）を行った。①低悪性度の肺胞置換型亜型成分と、②低乳頭状の増殖を示すpattern Lepidic with low papillary structure (LEPL)、③高悪性度の微小乳頭状亜型成分　の遺伝子発現量を比較したところ、①と②の間では100程度から数千の遺伝子で発現量の変化が起こり、一方②から③の間では多くて数十の変化しか起きていないことが分かった。今後はこれらの遺伝子変動の、マスターレギュレーション候補の遺伝子について、免疫組織化学的に、さらに症例数を増やして検討を行う。

携带EGFR突变的肺腺癌（以下简称EGFR肺腺癌）发生在一个快速进步的群体中，预后非常差。主要研究者先前已经发现，EGFR肺腺癌的组织学预后因素是一种微毛细血管亚型，并且还成功地鉴定出通过微毛细管亚型分别从微含量亚型分析中，并使用其他亚统计分析方法，并通过收集微毛细管组件来成功地鉴定出分子异常。但是，以前的实验存在问题，例如在没有盖玻片的显微镜下排列，低分辨率，收集亚型组件的难度以及在长时间工作中的RNA降解时，诸如辨别精度较低。因此，在该主题中，为了解决问题，我们结合了空间表达分析方法（visiumtm：一种创新技术，在组织部分上进行全面表达分析，同时保留大约55μm晶格的位置信息），并比较在同一子类别中的基因表达特征，并比较跨tumore的基因表达特性，并与分子型中的各种替代特征相比，微毛细管亚型。在今年，使用四例肺腺癌和手术切除的EGFR突变的FFPE进行空间表达分析（VISUIM™）。当比较1）低度肺泡替补亚型成分的基因表达水平时，2）表现出低乳头状结构（LEPL）的模式鳞张，表现出低乳头状增殖，3）高级别的微毛皮亚型成分，我们发现1至2之间的表达水平在1和2之间发生了变化，而在100至数千个基因之间发生了变化。将来，我们将通过免疫组织化学数量增加病例数来研究这些基因变化的候选基因。