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微小乳頭状肺腺癌の分子基盤の解明　-空間的遺伝子発現解析によるアプローチ-

阐明微乳头状肺腺癌的分子基础-使用空间基因表达分析的方法-

基本信息

批准号：
22K15410
负责人：
小池千尋
金额：
$ 2.91万
依托单位：
Yokohama City University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

项目摘要

EGFR変異を持つ肺腺癌（以下、EGFR肺腺癌）には、急速に進行し、また極めて予後不良な一群が存在する。研究代表者は、これまでに、EGFR肺腺癌の組織学的予後因子が微小乳頭状亜型であることを突き止め、また、微小乳頭状亜型成分をマイクロダイセクション法を用いて、他の亜型と分けて採取し、網羅的分子解析を行うことで、微小乳頭状亜型に特有の分子異状を同定することに成功している。しかし、一方で、今までの実験では、カバーガラスのない顕微鏡観察下の分取で判別精度が低い、分解能が低く亜型成分を網羅的に分取するのが難しい、長時間の作業でRNAが劣化する、などの問題点がある。そこで、本課題では問題点を解決すべく空間的発現解析法（VisiumTM: 組織切片上で約55μm格子毎の位置情報を保持しながら網羅的発現解析を行う革新的技術）を取り入れ、同一腫瘍内の多様な亜型成分の遺伝子発現特性を比較し、置換型から微小乳頭状亜型に至る多段階的な進展過程の分子基盤を追求する。当該年度は、外科的切除されたEGFR変異を有する肺腺癌4症例のFFPEを用いて、空間的発現解析（VisiumTM）を行った。①低悪性度の肺胞置換型亜型成分と、②低乳頭状の増殖を示すpattern Lepidic with low papillary structure (LEPL)、③高悪性度の微小乳頭状亜型成分　の遺伝子発現量を比較したところ、①と②の間では100程度から数千の遺伝子で発現量の変化が起こり、一方②から③の間では多くて数十の変化しか起きていないことが分かった。今後はこれらの遺伝子変動の、マスターレギュレーション候補の遺伝子について、免疫組織化学的に、さらに症例数を増やして検討を行う。

EGFR variant is persistent in lung adenocarcinoma (hereinafter referred to as EGFR lung adenocarcinoma), but it is rapidly progressing and extremely poor in the future. The authors of this study successfully identified micropapillary tumor specific molecular abnormalities in EGFR lung adenocarcinoma by using the micropapillary tumor analysis method. The accuracy of discrimination under microscope observation is low, the resolution energy is low, and the separation of low-type components is difficult. RNA degradation occurs during long-term operation. The problem of this subject is to solve the problem of spatial analysis (VisiumTM: innovative technology for the analysis of spatial analysis of the position of each cell on a tissue section). To compare the genetic characteristics of multiple types of components in the same tumor, to pursue the molecular matrix of the multi-stage progression process from replacement type to micropapillary type. During the year, surgical resection of EGFR was performed in 4 cases of lung adenocarcinoma, and spatial analysis (VisiumTM) was performed. (1) lung cell replacement type component with low degree,(2) low papillary growth pattern Lepidic with low papillary structure (LEPL),(3) micropapillary type component with high degree,(1) interval of 100 degrees,(2) variation of thousands of Lepidic generation amount,(3) interval of dozens of Lepidic with low papillary structure (LEPL),(4) variation of thousands of Lepidic generation amount. In the future, we will continue to investigate the changes in the expression of these genes, and the changes in the expression of these genes.