日米における非アルコール性脂肪性肝炎のゲノム網羅的DNAメチル化解析

日本和美国非酒精性脂肪性肝炎的全基因组 DNA 甲基化分析

• 批准号: 22K15415
• 负责人: 藏本 純子
• 金额: $ 3万
• 依托单位: Keio University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K15415/
• 关键词: 非アルコール性脂肪性肝炎; 非アルコール性脂肪性肝炎由来肝細胞がん; 非アルコール性脂肪性肝炎由来肝発がん; DNAメチル化異常; メチローム解析; ゲノム網羅的DNAメチル化解析; 肝細胞がん; コンパニオン診断マーカー

①対象症例：先行研究で,日本人の非アルコール性脂肪性肝炎(NASH)症例91例, NASH由来肝細胞がん症例22例,正常肝組織36検体を得ていた.米国のユタ大学ハンツマンがん研究所より, 米国人のNASH症例20例, NASH由来肝細胞がん症例11例のFFPE組織の供与を受けた.②対象症例のメチローム解析：日本人の症例については,凍結組織切片からフェノール・クロロホルム法と透析によりDNAを抽出し,Infinium Methylation450 BeadChip (Illumina社)によりメチローム解析をおこなっていた.米国のFFPE組織については,NASH症例の肝組織,　NASH由来肝細胞がん症例のがん組織および非がん肝組織からGeneRead DNA FFPE Kit(QIAGEN社)を用いてgenomic DNAを抽出し, 日本人同様にメチローム解析をおこなった.③解析結果：すでに取得済の日本のメチロームデータと②で新たに得られた米国のメチロームデータを主成分分析に供した. その結果, NASHは正常肝組織と明らかに異なるDNAメチル化プロファイルを示し, NASHの中でも米国人検体と日本人検体は異なる傾向が伺えた. そこで, NASHにおけるDNAメチル化異常がNASH由来肝細胞がんに継承され、そのDNAメチル化異常が発現異常に帰結する可能性のある候補がん関連遺伝子を, 日米の症例でそれぞれ同定した. 日米に共通してB3GNT3・MOSC1・FUT4遺伝子が同定され, これらの遺伝子のDNAメチル化異常のNASH由来肝発がん過程への普遍的な寄与が示唆された. 他方で, 日米間で異なるDNAメチル化状態を示すNASH由来肝細胞がん関連遺伝子が複数同定され, 人種・生活習慣の相違に基づくと見られる, NASH由来肝細胞がん発生過程の分子基盤の多様性が明らかになった.

1There were 91 cases of non-infectious steatohepatitis (NASH), 22 cases of NASH and 36 cases of normal liver tissue in Japanese. There were 20 cases of NASH's disease and 11 cases of NASH hepatocytosis in the United States, and 11 cases of FFPE tissue supply and recipient. 2. Analysis of the symptoms of the disease: the Japanese case of the disease is characterized by constipation, and the tissue sections of the disease show signs of convulsion. the tissue sections of the patients show signs of infection, and the method of dialysis is used to dialyze the symptoms of DNA. Infinium Methylation450 BeadChip (Illumina news agency). I don't know what to do. The FFPE tissue of the United States, the liver tissue of the case of NASH, the case of liver cytopathia of NASH, the tissue tissue of the liver tissue, the GeneRead DNA FFPE Kit (QIAGEN news agency), and the extraction of the liver tissue from the normal liver tissue (QIAGEN). The Japanese have the same knowledge as the Japanese. 3 the results of the analysis: the results of the analysis show that the principal component analysis is available in the United States. The results showed that in the normal liver group of NASH, it was shown that there was no significant difference between the normal liver group and the normal liver group. In the normal liver group, the DNA group showed that the American and Japanese people in the NASH group were not in the same condition. NASH, NASH, DNA, NASH, DNA, DNA, liver, liver, In Japan and rice, there is a general agreement between B3GNT3 MOSC1 and FUT4, and it is common to send and instigate a message in the course of the process of NASH. Other methods, day-to-day DNA changes indicate that the complex number of NASH is the same, human life is related to each other, and NASH is derived from the molecular basis of the process of liver cancer.