日米における非アルコール性脂肪性肝炎のゲノム網羅的DNAメチル化解析

日本和美国非酒精性脂肪性肝炎的全基因组 DNA 甲基化分析

• 批准号: 22K15415
• 负责人: 藏本 純子
• 金额: $ 3万
• 依托单位: Keio University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K15415/
• 关键词: 非アルコール性脂肪性肝炎; 非アルコール性脂肪性肝炎由来肝細胞がん; 非アルコール性脂肪性肝炎由来肝発がん; DNAメチル化異常; メチローム解析; ゲノム網羅的DNAメチル化解析; 肝細胞がん; コンパニオン診断マーカー

①対象症例：先行研究で,日本人の非アルコール性脂肪性肝炎(NASH)症例91例, NASH由来肝細胞がん症例22例,正常肝組織36検体を得ていた.米国のユタ大学ハンツマンがん研究所より, 米国人のNASH症例20例, NASH由来肝細胞がん症例11例のFFPE組織の供与を受けた.②対象症例のメチローム解析：日本人の症例については,凍結組織切片からフェノール・クロロホルム法と透析によりDNAを抽出し,Infinium Methylation450 BeadChip (Illumina社)によりメチローム解析をおこなっていた.米国のFFPE組織については,NASH症例の肝組織,　NASH由来肝細胞がん症例のがん組織および非がん肝組織からGeneRead DNA FFPE Kit(QIAGEN社)を用いてgenomic DNAを抽出し, 日本人同様にメチローム解析をおこなった.③解析結果：すでに取得済の日本のメチロームデータと②で新たに得られた米国のメチロームデータを主成分分析に供した. その結果, NASHは正常肝組織と明らかに異なるDNAメチル化プロファイルを示し, NASHの中でも米国人検体と日本人検体は異なる傾向が伺えた. そこで, NASHにおけるDNAメチル化異常がNASH由来肝細胞がんに継承され、そのDNAメチル化異常が発現異常に帰結する可能性のある候補がん関連遺伝子を, 日米の症例でそれぞれ同定した. 日米に共通してB3GNT3・MOSC1・FUT4遺伝子が同定され, これらの遺伝子のDNAメチル化異常のNASH由来肝発がん過程への普遍的な寄与が示唆された. 他方で, 日米間で異なるDNAメチル化状態を示すNASH由来肝細胞がん関連遺伝子が複数同定され, 人種・生活習慣の相違に基づくと見られる, NASH由来肝細胞がん発生過程の分子基盤の多様性が明らかになった.

① Symptom cases: A pilot study of 91 cases of Japanese non-American steatohepatitis (NASH). There were 22 cases of hepatocellular disease caused by NASH, and 36 cases of normal liver tissue were obtained. The Institute of Biotechnology of the University of the United States, 20 cases of NASH in the United States, Analysis of 11 cases of hepatocellular disease originating from NASH: Donor and recipient of FFPE tissue. ② Analysis of cases of NASH syndrome: Japanese disease Example: frozen tissue section, frozen tissue section, クロロホルム method, dialysis, DNA extraction, Infinium Methylation450 BeadChip (Illumina Company) Analysis of the FFPE organization of the United States, NA Liver tissue of SH cases, liver cells from NASH cases, tissue of cases of NASH, non-liver tissue, GeneRead DNA FFPE Kit (QIAGEN) is used to extract genomic DNA. Japanese 同様にメチロームanalytic をおこなった.③Analysis result: すでにobtained済の日本のメチロームデータと②で新たに得られた米国のメチロームデータを Principal component analysisにsupplyした.そのRESULTS, NASH is a normal liver tissue that is different from the original DNA, and is a normal liver tissue, and NASH is a normal liver tissue.そこで, NASH, DNA abnormality, NASH origin, liver cells, liver cells,のDNA chemical abnormality が発 に帰 knot する possibility のある candidate がんrelated legacy を, The symptoms of Japanese rice are the same as those of Japan. Japanese and American common してB3GNT3・MOSC1・FUT4 伝子が同定され, The origin of NASH, the abnormality of DNA transformation, and the process of liver disease are common. The state of DNA transformation between Japan and the United States shows that NASH originates from liver cells and is related to the plurality of the same thing. The race and lifestyle are inconsistent with each other. NASH originates from the polymorphism of the molecular basis of the liver cell growth process.