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HCVを基盤としたRNAウイルス変異動態の数理モデル化

基于HCV的RNA病毒突变动力学数学模型

基本信息

批准号：
22K15472
负责人：
上田優輝
金额：
$ 2.91万
依托单位：
Okayama University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K15472/
关键词：
C型肝炎ウイルスゲノム長期複製 HCV 数理モデル RNAウイルス変異動態

项目摘要

C型肝炎ウイルス(HCV)は、肝臓内での長期的なウイルスの感染・増殖によってウイルスゲノムに遺伝子変異が蓄積することが薬剤耐性変異や治癒後の肝発癌の原因と考えられる。しかしながら、HCV持続感染系の長期的な維持は難しく、構造領域の欠損などが頻繁に起こってしまうため遺伝子変異蓄積の多様性にアプローチした研究はあまりなされていない。本研究では、HCVの細胞内複製モデルを10年以上に渡り継代培養し、HCVゲノムを第3世代ロングリードシークエンサで長期的な変異動態の詳細を明らかにするだけでなく、そのデータを数理モデル化し、新型コロナウイルスなどを含めたRNAウイルス進化モデルへの応用を目指している。本年度の研究では、我々が樹立し、12年間継代培養を続けていた2系統のHCV細胞内複製モデル(sO細胞と50-1細胞)についての継代培養を継続し、培養期間が13年に到達した。13年継代細胞においても細胞内HCVのmRNA複製レベルは樹立時と比較して高いレベルを維持しており、細胞増殖能については12年目の細胞より亢進していることがわかった。サンガー法による簡易的なシークエンス解析からは、HCVゲノム領域に欠損は認められず、ウェスタンブロット解析においてもウイルスタンパク質の発現が全て認められた。

Hepatitis C virus infection (HCV), chronic hepatitis C infection, chronic hepatitis C infection, chronic hepatitis C, hepatitis C. In recent years, HCV is responsible for the maintenance of infection for a long period of time. In the field of infection, there are significant changes in the number of children in the field of infection. In this study, HCV intracellular replication has been used for more than 10 years, and HCV has been used for more than 10 years. The third generation has been used in the third generation. This study is based on the results of this study. In this study, we have been in the process of intracellular replication for more than 10 years, including the third generation, the third generation, the third generation and the third generation. In this year's research program, our laboratory has been established in the past 12 years, and the HCV system has been successfully developed in the past 12 years. The sO cell size is 50-1 cells, and the incubation period has been reached in 13 years. In 13-year-old cell cycle, the time of HCV replication in the cell was higher than that in the cell, and the cell cycle was higher than that in the cell. the cell cycle was higher than that in the cell, and the cell cycle was increased after 12 years. In the first place, there is a shortage of information in the field of HCV, and there is a shortage of information in the field of the law.