B型肝炎ウイルスゲノム挿入の新規検出法を利用したメカニズム解析

使用新的乙型肝炎病毒基因组插入检测方法进行机制分析

基本信息

  • 批准号:
    22K15481
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.91万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
  • 财政年份:
    2022
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2022-04-01 至 2025-03-31
  • 项目状态:
    未结题

项目摘要

B型肝炎ウイルス(HBV)感染による発癌過程には、ウイルスゲノムが宿主ゲノムへ挿入される現象が関与していることが知られる。しかしウイルスゲノムの挿入部位や挿入DNA断片は多様であり、その形成メカニズムはほとんど明らかでない。またHBVゲノム挿入を検出・解析する現行法は、高価で技術的制約があるなどの欠点があり汎用性が未だ低い。そこで本研究ではまず網羅的かつ安価で簡便にHBVのゲノム挿入を検出できる新規手法を確立し、その手法を用いることによりゲノム挿入機構の解明を目指している。他のウイルスゲノム挿入を簡便に検出する新規手法を応用し、まずはHBV肝細胞癌由来細胞株から、既報と一致するHBVゲノム挿入部位が同定できることを示した。さらにHBVを感染させた細胞や肝がん患者検体で新規に発生するゲノム挿入も本法で同定できることを解析した。また現行法のhybrid-capture法での解析結果と比較したところ、本法ではより少ないシーケンス量で同等レベルの解析が可能であることが示唆された。また同定された挿入部位について特異的プライマーを設計し、元のDNAサンプルからキメラゲノムを増幅することで本法の解析精度を評価した。以上の検討により、本法を用いることでHBVゲノム挿入を現行法より安価かつ簡便に検出できると考えられる。今後、本法を用いたゲノム挿入の分子機構解析を進めることで、HBV感染由来の発がんメカニズム解明へ重要な知見が得られると期待できる。
Hepatitis B virus (HBV) infection in the process of cancer development, it must be used to host the disease into the phenomenon of the relationship between The DNA fragments in the DNA fragments are very diverse. In addition, the current law on the detection and analysis of HBV data entry is limited by high technology and has shortcomings, so its general applicability is not limited. This study aims to establish a new method for HBV detection and detection, and to clarify the mechanism of HBV detection. The new method for detecting HBV hepatocellular carcinoma-derived cell lines is simple and easy to use, and the same HBV entry site is reported. HBV infection, cell and liver disease, new rules for development, and analysis of HBV infection The analysis results of the hybrid capture method are compared with those of the current method. The analysis results of the hybrid capture method are compared with those of the current method. The analysis accuracy of the method was evaluated by the design and amplification of DNA fragments. The above discussion, this method is used in the middle, this method is used in the In the future, this method will be used to analyze the molecular structure of HBV infection.

项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
B型肝炎ウイルスゲノム挿入の新規検出法の確立
乙型肝炎病毒基因组插入检测新方法的建立
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    深野 顕人;若江 亨祥;直 亨則;斎藤 益満;豊嶋 孝恵;坪田 昭人;相崎 英樹;松平 崇弘;木村 基;渡士 幸一;杉浦 亙;村松 正道
  • 通讯作者:
    村松 正道
NTCP多量体形成に着目したB型肝炎ウイルス内在化機構の解明
以NTCP多聚体形成为重点阐明乙型肝炎病毒内化机制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    深野顕人;渡士幸一;村松正道
  • 通讯作者:
    村松正道
Amentoflavone inhibits hepatitis B virus infection via the suppression of preS1 binding to host cells
  • DOI:
    10.1111/1348-0421.13064
  • 发表时间:
    2023-03
  • 期刊:
  • 影响因子:
    2.6
  • 作者:
    Chie Aoki-Utsubo;Puguh Indrasetiawan;Kento Fukano;Masami Muramatsu;N. Artanti;M. Hanafi;H. Hotta-
  • 通讯作者:
    Chie Aoki-Utsubo;Puguh Indrasetiawan;Kento Fukano;Masami Muramatsu;N. Artanti;M. Hanafi;H. Hotta-
Establishment of a novel method for analyzing hepatitis B virus DNA integration
乙型肝炎病毒DNA整合分析新方法的建立
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Fukano K;Wakae K;Nao N;Saito M;Toyoshima T;Tsubota A;Aizaki H;Matsudaira T;Kimura M;Watashi K;Sugiura W;Muramatsu M
  • 通讯作者:
    Muramatsu M
B型肝炎ウイルスcccDNAの変異頻度に関わるAPOBEC3ファミリーとUNGの解析
APOBEC3家族及UNG与乙型肝炎病毒cccDNA突变频率相关分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    喜多村 晃一;深野 顕人;Lusheng Que;Yingfang Li;若江 亨祥;村松 正道
  • 通讯作者:
    村松 正道
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  • 通讯作者:
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  • 发表时间:
    2022
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  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    喜多村 晃一;深野 顕人;Lusheng Que;Yingfang Li;若江 亨祥;村松 正道
  • 通讯作者:
    村松 正道
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  • 发表时间:
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  • 影响因子:
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    深野 顕人;Toby PASSIOURA;志村 聡美;佐宗 若奈;森下 了;小笠原 裕樹;田中 靖人;溝上 雅史;Camille SUREAU; 脇田 隆字;菅 裕明;渡士 幸一
  • 通讯作者:
    渡士 幸一
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  • 发表时间:
    2017
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    0
  • 作者:
    深野 顕人;九十田 千子;鈴木 亮介;相崎 英樹;村松 正道;脇田 隆字;小笠原 裕樹;渡士 幸一;渡士 幸一
  • 通讯作者:
    渡士 幸一

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  • 通讯作者:
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知道了