遺伝性骨髄不全症候群に対する網羅的プロテオミクス解析

遗传性骨髓衰竭综合征的综合蛋白质组学分析

• 批准号: 22K15601
• 负责人: 若松 学
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K15601/
• 关键词: 網羅的プロテオーム解析; 遺伝性骨髄不全症候群; SDS; プロテオミクス解析

遺伝性骨髄不全症候群（IBMFS）は、先天的な遺伝子変異が原因で造血不全を呈する症候群であり、様々な疾患を包括する。IBMFSの一病型であるシュワッハマン・ダイアモンド症候群（SDS）は、乳幼児期より膵外分泌異常、血球減少、骨格異常を特徴として発症し、一部の症例が骨髄異形成症候群（MDS）、および急性骨髄性白血病（AML）へ進展する。MDS/AMLを発症した症例の予後は極めて不良であり、他のIBMFSとの鑑別が必要不可欠である。SDSの原因遺伝子として約90%の症例でSBDS遺伝子変異を認めるが、SBDS遺伝子には非常に相同性が高い偽遺伝子（SBDSP1）が存在し、通常の次世代シーケンサーによる遺伝子解析では十分な感度で変異を同定することが難しく、見逃される症例が存在する。このような背景から遺伝子解析以外の臨床検査技術による迅速かつ簡便な診断検査の構築が望まれている。本研究では、最新鋭の高深度網羅的プロテオーム解析をIBMFS症例（n = 60）に対して実施した。結果として、従来型のプロテオーム解析では同定することが難しいキナーゼ、転写因子、リン酸化タンパク質などの微量タンパク質を含む、約8,000種類のタンパク質の同定・定量を行うことが可能であった。各々のIBMFS疾患の中で、有意に発現増加、もしくは減少するマーカータンパク質を抽出し、網羅的遺伝子解析の結果と比較した。プロテオーム解析解析を用いることで、マッピングエラーのために遺伝学的解析のみでは、確定診断することが難しい症例を同定することが可能であった。プロテオーム解析による網羅的タンパク質定量は、これまでの遺伝子解析を補完する解析技術として、迅速で低コストな診断システムとなりえると考えられた。

遗传性骨髓衰竭综合征（IBMFS）是一种综合征，其中造血衰竭是由先天性基因突变引起的，并包括多种疾病。 Schwachmann Diamond综合征（SDS）是一种IBMFS的形式，是从婴儿期发展的，其特征是外分泌胰腺疾病，细胞质和骨骼异常，有些情况发展为骨髓异常综合征（MDS）和急性骨髓性白血病（Aml）。开发MDS/AML的病例的预后非常差，将其与其他IBMF区分开是至关重要的。在大约90％的病例中观察到SBDS基因突变是SDS的致命基因，但是SBDS基因中有一个具有极高同源性的伪代（SBDSP1），并且很难使用正常的下一代测序剂，并且在某些情况下，很难识别出具有足够敏感性的突变。鉴于此背景，需要使用临床测试技术快速而简单的诊断测试，而不是遗传分析。在这项研究中，对IBMFS病例进行了最先进的，高深，全面的蛋白质组学分析（n = 60）。结果，可以识别和量化大约8,000种蛋白质，包括痕量蛋白，例如激酶，转录因子和磷酸化蛋白，这些蛋白很难使用常规蛋白质组分析。提取了每种IBMFS疾病中显着增加或降低表达的标记蛋白，并将其与全面的遗传分析结果进行了比较。通过使用蛋白质组分析，可以鉴定出由于映射误差而仅使用遗传分析进行明确诊断的病例。使用蛋白质组分析的综合蛋白质定量被认为是一种快速，低成本的诊断系统，作为一种补充以前的遗传分析的分析技术。

项目成果

遺伝性骨髄不全症候群に対するプロテオミクス解析による診断検査

使用蛋白质组学分析进行遗传性骨髓衰竭综合征的诊断测试

• 发表时间: 2022
• 作者: Nogami Ayako;Sasaki Koji;若松 学
• 通讯作者: 若松 学