遺伝性骨髄不全症候群に対する網羅的プロテオミクス解析

遗传性骨髓衰竭综合征的综合蛋白质组学分析

• 批准号: 22K15601
• 负责人: 若松 学
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K15601/
• 关键词: 網羅的プロテオーム解析; 遺伝性骨髄不全症候群; SDS; プロテオミクス解析

遺伝性骨髄不全症候群（IBMFS）は、先天的な遺伝子変異が原因で造血不全を呈する症候群であり、様々な疾患を包括する。IBMFSの一病型であるシュワッハマン・ダイアモンド症候群（SDS）は、乳幼児期より膵外分泌異常、血球減少、骨格異常を特徴として発症し、一部の症例が骨髄異形成症候群（MDS）、および急性骨髄性白血病（AML）へ進展する。MDS/AMLを発症した症例の予後は極めて不良であり、他のIBMFSとの鑑別が必要不可欠である。SDSの原因遺伝子として約90%の症例でSBDS遺伝子変異を認めるが、SBDS遺伝子には非常に相同性が高い偽遺伝子（SBDSP1）が存在し、通常の次世代シーケンサーによる遺伝子解析では十分な感度で変異を同定することが難しく、見逃される症例が存在する。このような背景から遺伝子解析以外の臨床検査技術による迅速かつ簡便な診断検査の構築が望まれている。本研究では、最新鋭の高深度網羅的プロテオーム解析をIBMFS症例（n = 60）に対して実施した。結果として、従来型のプロテオーム解析では同定することが難しいキナーゼ、転写因子、リン酸化タンパク質などの微量タンパク質を含む、約8,000種類のタンパク質の同定・定量を行うことが可能であった。各々のIBMFS疾患の中で、有意に発現増加、もしくは減少するマーカータンパク質を抽出し、網羅的遺伝子解析の結果と比較した。プロテオーム解析解析を用いることで、マッピングエラーのために遺伝学的解析のみでは、確定診断することが難しい症例を同定することが可能であった。プロテオーム解析による網羅的タンパク質定量は、これまでの遺伝子解析を補完する解析技術として、迅速で低コストな診断システムとなりえると考えられた。

Inherited Bone Deficiency Syndrome (IBMFS) is an inherited disease that includes multiple causes of hematopoiesis deficiency. IBMFS is characterized by early onset of eccrine abnormalities, cytopenia, and skeletal abnormalities, and in some cases by progression of osteogenesis syndrome (MDS), acute osteoblastic leukemia (AML), and leukemia. MDS/AML is the most common cause of disease. SBDS gene diversity is recognized in approximately 90% of cases, SBDS gene diversity is very common in SBDS gene diversity, SBDSP1 gene diversity is present in most cases, and SBDS gene diversity is very common in most cases. This background analysis is expected to provide a rapid and easy way to construct diagnostic tests other than gene analysis. This study was conducted on the latest high-depth network analysis of IBMFS cases (n = 60). The results show that the analysis of the different types of compounds is not stable, the factors are written, the quality of the compounds is determined, and the quality of the compounds is determined. About 8,000 kinds of compounds are determined. The results of analysis of IBMFS disease, intentional increase, decrease, quality extraction and net mutation were compared. The diagnosis of the disease is possible. The quality of the product is determined by the analysis technique and the rapid diagnosis method.

项目成果

遺伝性骨髄不全症候群に対するプロテオミクス解析による診断検査

使用蛋白质组学分析进行遗传性骨髓衰竭综合征的诊断测试

• 发表时间: 2022
• 作者: Nogami Ayako;Sasaki Koji;若松 学
• 通讯作者: 若松 学