頭頚部扁平上皮癌化学放射線治療における口腔内・腸内細菌叢の統合解析と病態の理解

头颈鳞状细胞癌放化疗中口腔和肠道微生物群的综合分析及病理学理解

• 批准号: 22K15833
• 负责人: 榎田 智弘
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: National Cancer Center Japan
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K15833/
• 关键词: Microbiome; 化学放射線治療; 頭頸部癌; 微生物叢解析

本研究の目的は、頭頸部扁平上皮癌患者に対して実施される化学放射線治療(抗がん剤と放射線治療の同時併用療法)の経過を通して口腔および腸内細菌叢を詳細に解析することにより、治療に随伴する有害事象や治療効果に与える影響を考察し、特に放射線治療分野での細菌叢解析の意義を検証することである。各種シークエンス技術の発展により、従来培養不可能な菌の検出まで可能となり、新たな菌種の発見や培養法での検出では得られなかった詳細な細菌叢解析が可能になってきたが、本研究では、上記治療に際して治療開始前および治療完了後を含む複数回渡り収取される検体について同解析を行うことで、細菌叢の微細な変化の同定やその臨床的意義についての考察を可能とする体制とした。ここでは、存在する細菌の遺伝子機能をより正確に推定し、真菌やウィルスといった同領域での解析が未だ不十分と考えられる微生物についても解析対象とすることが可能なショットガンゲノムシークエンスを採用した。並行して、微生物叢形成に重要な影響を与えると考えられる口腔内状況（齲歯や歯周病、一般的な衛生状況など)や胃粘膜保護剤、整腸剤/プロバイオティクス、抗菌剤/抗真菌剤の使用状況についても詳細に情報を収集する体制を整理し、これらと診療録ベースで収集される有害事象（感染症、放射線性粘膜炎、肺臓炎等）と治療効果（初期奏効、無病再発期間、全生存、その後に免疫チェックポイント阻害剤使用者はその奏効も含む）との関連性を上記微生物叢の特徴や推移を軸にして解析できるよう整えた。また、これら症例の対照となる健常者コホートとして、東北メディカル・メガバンク機構が唾液・歯垢等の生体試料を収集保管し、更に16Sリボソームによる口腔内細菌叢解析が行われた約1000人の同データについてアクセス、比較できる体制を構築した。

The aim of this study was to analyze in detail the passage of chemoradiotherapy (concurrent therapy) to patients with squamous cell carcinoma of the head and neck, including oral and intestinal bacterial flora. The development of a variety of culture techniques, including the development of impossible strains, the development of new strains, the development of culture methods, the development of detailed analysis of bacterial flora, the development of new strains, the development of new strains, the development, the development of new strains, the detailed analysis of bacterial flora, the development of new strains The micro-differentiation and identification of bacterial flora and its clinical significance are investigated in detail. The function of the gene of bacteria is correctly estimated, and the analysis of fungi in the same field is not very accurate. The analysis of microorganisms in the same field is possible. Parallel, microbial community formation important influence on oral cavity (Dental caries, general hygiene conditions, etc.), gastric mucosa protective agents, intestinal cleansing agents, antibacterial agents/antifungal agents, detailed information collection system, medical records, collection of harmful events (infections, radioactive mucositis, pneumonia, etc.), and therapeutic effects (Initial stage, disease-free recurrence period, complete survival, post-immune response, post-immune response) In addition, the system for analyzing bacterial flora in the oral cavity was established by collecting and storing biological samples such as saliva and dental dirt in the Tohoku region, and analyzing the same sample from about 1000 people.