DNA構造多型同定による、不整脈原性右室心筋症の新たな遺伝的背景の解明

通过鉴定DNA结构多态性阐明致心律失常性右心室心肌病的新遗传背景

基本信息

批准号：
22K16157
负责人：
園田桂子
金额：
$ 3万
依托单位：
National Cardiovascular Center Research Institute
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

项目摘要

本研究は、ロングリードシークエンス (LRS) やMultiplex Ligation-dependent Probe Amplification (MLPA) 法を用いてデスモソーム関連遺伝子のSVsをスクリーニングすることにより、今まで不明であった不整脈原性右室心筋症（ARVC）患者の遺伝的背景を明らかにすることを目的とする。R4年度は、ショートリードによるターゲットシークエンスでは原因遺伝子変異が同定されなかったARVC発端者63人を対象に、MLPA法を用いてPKP2及び他のデスモソーム関連遺伝子の一部のエクソンについて、欠失・重複の有無をスクリーニングした。結果は、1名がPKP2エクソン8-14の欠失を有していた。本症例は症状を伴う心室性不整脈を発症しており、PKP2変異症例の特徴と合致していた。家系解析は現在施行中である。なお153名の中に既知のPKP2全エクソン欠失症例（Sonoda K, Europace 2017) が1名含まれているため、153人中2名(1.3%)がPKP2の欠失を有していたことになる。続いて、DSG2のSVsをスクリーニングするために、ロングリードシークエンサーであるのナノポアシークエンサーを使用し、ターゲットシークエンス用のCas9プローブを設計した。オフターゲット等の問題によりCas9プローブ調整に時間を要したが、DSG2遺伝子全体をカバーできるようなCas9プローブの設計が完了した。R5年度はこのCas9プローブを用い、62人を対象にDSG2のSVsをスクリーニングを完了する予定である。

这项研究旨在通过使用长阅读序列（LRS）和多重结扎依赖性依赖性探针扩增（MLPA）方法筛选与脱木体相关基因的SV来阐明先前未知患者的遗传背景（ARVC）。在第4财年，在目标序列中未鉴定出63个ARVC概率，其因子序列中未在目标序列中鉴定出对PKP2的某些外显子的缺失或重复，并使用MLPA方法进行了缺失或重复。结果表明，一个人删除了PKP2外显子8-14。该病例出现症状性心律不齐，与PKP2突变病例的特征一致。家庭分析目前正在进行中。此外，在153例患者中，PKP2总外显子缺失（Sonoda K，Europace 2017）的一种已知案例，这意味着153例患者中有2例（1.3％）患有PKP2缺失。随后，为了筛选DSG2中的SVS，使用纳米孔序列（长读序列器）为目标序列设计了CAS9探针。尽管由于诸如定位之类的问题，可以调整CAS9探测器，但可以完成覆盖整个DSG2基因的CAS9探针的设计。在R5财年，我们计划使用此CAS9探针在62名患者中对DSG2 SV进行筛查。

项目成果

期刊论文数量（3）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

The pathogenic variants in PKP2 are associated with high risk of lethal ventricular arrhythmia in Japanese ARVC patients

PKP2 的致病性变异与日本 ARVC 患者致命性室性心律失常的高风险相关

DOI：
发表时间：
2023
期刊：
影响因子：
0
作者：
Keiko Sonoda;Satoshi Nagase;Takeshi Aiba;Koichi Kato;Megumi Fukuyama;Noriko Kikuchi;Tsuyoshi Shiga;Kengo Kusano;Minoru Horie and Seiko Ohno
通讯作者：
Minoru Horie and Seiko Ohno

不整脈原性右室心筋症の遺伝的背景が関与する臨床像と予後

致心律失常性右心室心肌病遗传背景相关的临床特征及预后