DNA構造多型同定による、不整脈原性右室心筋症の新たな遺伝的背景の解明

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本研究は、ロングリードシークエンス (LRS) やMultiplex Ligation-dependent Probe Amplification (MLPA) 法を用いてデスモソーム関連遺伝子のSVsをスクリーニングすることにより、今まで不明であった不整脈原性右室心筋症（ARVC）患者の遺伝的背景を明らかにすることを目的とする。R4年度は、ショートリードによるターゲットシークエンスでは原因遺伝子変異が同定されなかったARVC発端者63人を対象に、MLPA法を用いてPKP2及び他のデスモソーム関連遺伝子の一部のエクソンについて、欠失・重複の有無をスクリーニングした。結果は、1名がPKP2エクソン8-14の欠失を有していた。本症例は症状を伴う心室性不整脈を発症しており、PKP2変異症例の特徴と合致していた。家系解析は現在施行中である。なお153名の中に既知のPKP2全エクソン欠失症例（Sonoda K, Europace 2017) が1名含まれているため、153人中2名(1.3%)がPKP2の欠失を有していたことになる。続いて、DSG2のSVsをスクリーニングするために、ロングリードシークエンサーであるのナノポアシークエンサーを使用し、ターゲットシークエンス用のCas9プローブを設計した。オフターゲット等の問題によりCas9プローブ調整に時間を要したが、DSG2遺伝子全体をカバーできるようなCas9プローブの設計が完了した。R5年度はこのCas9プローブを用い、62人を対象にDSG2のSVsをスクリーニングを完了する予定である。