一細胞毎の網羅的遺伝子発現解析によるLAM病態の解明と治療標的同定の試み

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2022年度に2例のLAM患者肺、3例のLCC、2例の正常肺に対してscRNA-seq及びCAGE解析を行った。まず、LAM肺のscRNA-seqでは、正常肺との比較で正常肺には認めない細胞集団を認めた。同細胞集団は既報のLAM細胞と遺伝子発現の特性が非常に似通っており、我々の実験系においてscRNA-seqでLAM肺の解析が高い精度をもって行えていることが証明された。ただし、肺全体に占めるLAM細胞の比率は1%程度と非常に低くLAM肺の結果のみではLAM細胞の詳細な遺伝子発現上の分類は困難であった。また、LAM患者の乳糜胸水から採取されたLCCについては3例とも、解析された細胞のうち60％程度がLAM細胞に合致する遺伝子発現パターンを有していた。LCCの解析で得られたLAM細胞は遺伝子発現パターンから8つに分類可能であった。これは既報のLAM肺のscRNA-seq等に比して10倍以上の細胞数が解析可能であったことで得られた結果と考えられた。