权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

一細胞毎の網羅的遺伝子発現解析によるLAM病態の解明と治療標的同定の試み

通过对每个细胞的全面基因表达分析来阐明 LAM 病理学并识别治疗靶点

基本信息

批准号：
22K16200
负责人：
関本康人
金额：
$ 2.91万
依托单位：
Juntendo University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2023-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K16200/
关键词：
シングルセル解析リンパ脈管筋腫症結節性硬化症 scRNA-seq

项目摘要

2022年度に2例のLAM患者肺、3例のLCC、2例の正常肺に対してscRNA-seq及びCAGE解析を行った。まず、LAM肺のscRNA-seqでは、正常肺との比較で正常肺には認めない細胞集団を認めた。同細胞集団は既報のLAM細胞と遺伝子発現の特性が非常に似通っており、我々の実験系においてscRNA-seqでLAM肺の解析が高い精度をもって行えていることが証明された。ただし、肺全体に占めるLAM細胞の比率は1%程度と非常に低くLAM肺の結果のみではLAM細胞の詳細な遺伝子発現上の分類は困難であった。また、LAM患者の乳糜胸水から採取されたLCCについては3例とも、解析された細胞のうち60％程度がLAM細胞に合致する遺伝子発現パターンを有していた。LCCの解析で得られたLAM細胞は遺伝子発現パターンから8つに分類可能であった。これは既報のLAM肺のscRNA-seq等に比して10倍以上の細胞数が解析可能であったことで得られた結果と考えられた。

In 2022, に2 cases of <s:1> LAM patients' lungs, 3 cases of <s:1> LCC, and 2 cases of <s:1> normal lungs に performed った on <s:1> て RNA-seq and びCAGE analysis を. Youdaoplaceholder0, LAM lung <s:1> scRNA-seqでを, and normal lung と <s:1> comparison で normal lung にに recognizes めな <s:1> cell clusters を recognize めた. With cell set 団は to both の LAM cell と posthumous son 伝発の now features が very に like tong っており, I 々の be 験 department において scRNA - seq で LAM, lung の parsing が high precision いをもって line えていることが prove された. ただし, lung accounted for the entire にめる LAM cell のとは 1% degree is very low にく LAM, lung の results のみでは LAM cell の detailed な heritage 伝 son の classification は発 now difficulties であった. また, LAM patients の chylothorax water から take された LCC については 3 cases とも, parse された cells のうち 60% degree がに LAM cells close to する heritage 伝 son 発 now パターンを have していた. LCC <s:1> analysis で results in られたLAM cell <s:1> remains 伝, パタ <s:1> <s:1> らら8 にに classification possible であった. これは at both の LAM, lung の scRNA - seq に than して 10 times more の cell number が parsing may であったことで have られた results と exam えられた.