COL4A5遺伝子におけるNon-Glyミスセンス変異の病態発症機序解明

COL4A5基因Non-Gly错义突变病理机制的阐明

• 批准号: 22K16218
• 负责人: 青砥 悠哉
• 金额: $ 3万
• 依托单位: Kobe University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K16218/
• 关键词: COL4A5; non-Gly変異; スプライシング; 三次元構造解析; Proline; Hydroxyproline; COL4A5遺伝子; アルポート症候群; Non-Glycine ミスセンス変異

自件例と既報の疾患データベースであるHuman Gene Mutation Database(HGMD)に登録されている変異から、COL4A5遺伝子のCollagenousドメイン内に存在するnon-Gly変異を計43変異抽出し、その中から病的変異として信頼性の高い21変異を対象変異として解析を行った。まず、対象変異に対して、自件例では患者血液から抽出したゲノムDNAを用いて、HGMDに登録されている変異はMutagenesisにより対象変異をコントロール検体に導入し、それぞれをminigene constructを用いて解析を行った。結果、21変異中、9変異でスプライシング異常が発症機序に関与していることを明らかにした。次に、スプライシング異常が否定的な変異の特徴を確認した所、12変異中、6変異はProline(Pro)のミスセンス変異であり、全てがY位に位置していた。Collagenousドメインでは、Gly-X-Y(X, Yは何らかのアミノ酸)とGlyが規則正しく3つ毎に規則正しく繰り返し位置し、Y位にProが位置する場合は、翻訳後修飾によりProがHydroxyproline(Hyp)に置換され、Collagen蛋白の安定性に寄与していると報告されている。そのため、三次元構造解析を行いHypの機能を評価した。結果、ProはHypに翻訳後修飾されることで、Collagen分子の安定性に寄与していることを確認した。続いて、Y位に位置するProが置換されたミスセンス変異でも三次元構造解析を行ったが、3つの変異では安定性に異常をきたしたが、1つの変異では安定性に影響を認めなかった。その他、2変異がCollagenousドメインでGlycin(Gly)が規則正しく3塩基毎に繰り返さないinterrupted domain内の変異であった。

For example, the Human Gene Mutation Database(HGMD) registers non-Gly variants in the COL4A5 gene Collagenous database, and analyzes non-Gly variants in the disease variant. For example, if the patient's blood is extracted, the DNA will be used. If the patient's blood is used, the DNA will be used. The results showed that 21 cases were different, 9 cases were different, and 9 cases were different. Next, the abnormal position is negative, the different characteristics are confirmed, 12 different, 6 different Proline(Pro) is different, and all Y positions are confirmed. Collagen protein stability report: Gly-X-Y(X, Y), Gly-Y (X, Y), Gly-Pro (Y), Gly-X-Y(X, Y), Gly-Pro (Y), Gly-Pro (Y), Gly-X-Y (X, Y), Gly-Pro (Y), Gly-X-Y (X, Y), Gly-Pro (Y). A review of Hyp's functions in the analysis of three-dimensional structures The results showed that the stability of Collagen molecule was confirmed by the modification of Pro and Hyp. The position of the Y position is different from that of the Y position, and the stability of the Y position is different from that of the Y position. He, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 10, 1

项目成果

The pathogenicity assessment of non-glycine missense variants in COL4A5 triple-helical region

COL4A5三螺旋区非甘氨酸错义变异的致病性评估

• 发表时间: 2022
• 作者: TAKANOBU IIJIMA;KAZUYA FUJIHARA;MAYUKO H. YAMADA;MASAHIKO YAMAMOTO;TAEKO OSAWA;YASUHIRO MATSUBAYASHI;TAKAAKI SATO;YUTA YAGUCHI;MIDORI IWANAGA;TAKAHO YAMADA;SATORU KODAMA;HIROHITO SONE;青砥悠哉
• 通讯作者: 青砥悠哉