MALDI-TOF MS(質量分析器)による黒色真菌迅速同定

使用MALDI-TOF MS（质谱仪）快速鉴定黑真菌

• 批准号: 22K16271
• 负责人: 二ッ谷 剛俊
• 金额: $ 1.08万
• 依托单位: Kanazawa Medical University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K16271/
• 关键词: MALDI-TOF MS; 黒色真菌; Exophiala; 質量分析

黒色真菌症は稀であるが、皮膚のみでなく全身に播種し致死的であることから発展途上国を中心に世界中で問題となっている。黒色真菌症は菌種により治療法が異なり迅速に菌種を同定することが重要であるが、菌種同定は専門性が高く、時間を要する点が問題であった。質量分析器（MALDI-TOF MS）を用いた菌種同定法は迅速・簡便であり、すでに細菌同定に実用化されている。本研究は、MALDI-TOF MSを用いて黒色真菌の迅速同定を確立するものである。黒色真菌症の中でも頻度の高いExophiala属を対象としてMALDI-TOF MSの有用性を検討した。現在販売されているライブラリ(データベース)には黒色真菌の登録がほぼない状態であることから、基準となる菌株を登録しin-houseライブラリを作成した。検査の前処理法としては、現在使用されているMALDI-TOF MSで糸状菌同定する際の前処理方法は繁雑で時間を要することから、斜面培地で造成したコロニーを直接利用する前処理法と、コロニーを触接検査する最も迅速な方法を比較検討した。従来の方法と比較し、検査結果のスコアは前者の方が後者に比べて従来法との差が少なく、実臨床に適していると考えた。この前処理法を使用して、当施設に同定依頼となったExophiala属をMALDI-TOF MSで検査を行った。照合するデータベースは従来のライブラリに加え、上記の新たに登録したin-houseライブラリを使用した。結果として、30/31株で最もスコアの高い菌種は遺伝子同定の菌種と一致した。MALDI-TOF MSのライブラリの充実と前処理法の工夫により、Exophiala属については同定が可能であると示唆された。

Black fungus is rare, skin is rare, whole body is rare, death is rare, development is rare, world is rare, problems are rare. Black fungus species, treatment methods, rapid identification of species, identification of species, identification of Mass Analyzer (MALDI-TOF MS) is a rapid and simple method for identification of bacteria. In this study, MALDI-TOF MS was used to establish the rapid identification of black fungi. The high frequency of black fungal infection and the usefulness of MALDI-TOF MS are discussed. Now, the registration of black fungi is made by in-house classification. The pre-treatment method of MALDI-TOF MS is the most rapid method to detect the bacteria in the process of identification. The results of the study are compared with the results of the previous study, and the differences between the two methods are less than those between the two methods. This pre-processing method is used to determine the same parameters as the MALDI-TOF MS test. In the light of the above, we can add some new entries to the list. The results showed that 30/31 strains were the most common strains. MALDI-TOF MS is the most accurate and accurate method of calculation.

项目成果

MALDI-TOF MS(質量分析器)による黒色真菌迅速同定

使用MALDI-TOF MS（质谱仪）快速鉴定黑真菌

• 发表时间: 2022
• 作者: Tanaka Yuka;Ito Takamichi;Tanegashima Keiko;Tsuji Gaku;Nakahara Makiko;Nakahara Takeshi;二ッ谷 剛，村 竜輝，安澤 数史，望月 隆，清水 晶，飯沼 由嗣
• 通讯作者: 二ッ谷 剛，村 竜輝，安澤 数史，望月 隆，清水 晶，飯沼 由嗣