もやもや病の末梢血細胞DNAメチル化解析による発病機序の解明

背景と目的：もやもや病は内頚動脈終末部の進行性狭窄をきたす原因不明の脳血管疾患である。近年、疾患感受性遺伝子RNF213が同定されたが、RNF213単独では疾患発症に至らないことや、疾患の不均一性も説明できないことが判明しており、炎症や免疫など何らかの修飾因子の存在が想定されている。miRNAともに重要なエピゲノム機構であるDNAメチル化解析にて、もやもや病特有のDNAメチル化状態、それにより制御される遺伝子や生物学的機能を分析し、発症機序の解明につなげることを目的とする。方法：既に集積している患者200名、健常者200名以上の血液サンプルを用いて、RNF213遺伝子型解析を実施し、変異型と野生型の患者、健常者を層別化し、それぞれpilot cohortとして抽出する。マイクロアレイ（Illumina infinium Human MethylationEPIC Bead- Chip）を用いて全ゲノムメチル化データを取得し、比較解析、パスウェイ解析を実施する。患者と健常者の単純比較に加え、変異型患者と変異型非発症者の比較によって、RNF213とメチル化状態がどのように発症に関与するかを明らかにできる可能性がある。さらに、多数コホートにてpyrosequencingによるvalidationを行い、疾患発症に寄与するメチル化部位を特定する。実績：RNF213遺伝子解析が終了し、変異型と野生型の患者の層別化が完了した。

背景と目的：もやもや病は内頚動脈終末部の進行性狭窄をきたす原因不明の脳血管疾患である。近年、疾患感受性遺伝子RNF213が同定されたが、RNF213単独では疾患発症に至らないことや、疾患の不均一性も説明できないことが判明しており、炎症や免疫など何らかの修飾因子の存在が想定されている。miRNAともに重要なエピゲノム機構であるDNAメチル化解析にて、もやもや病特有のDNAメチル化状態、それにより制御される遺伝子や生物学的機能を分析し、発症機序の解明につなげることを目的とする。方法：既に集積している患者200名、健常者200名以上の血液サンプルを用いて、RNF213遺伝子型解析を実施し、変異型と野生型の患者、健常者を層別化し、それぞれpilot cohortとして抽出する。マイクロアレイ（Illumina infinium Human MethylationEPIC Bead- Chip）を用いて全ゲノムメチル化データを取得し、比較解析、パスウェイ解析を実施する。患者と健常者の単純比較に加え、変異型患者と変異型非発症者の比較によって、RNF213とメチル化状態がどのように発症に関与するかを明らかにできる可能性がある。さらに、多数コホートにてpyrosequencingによるvalidationを行い、疾患発症に寄与するメチル化部位を特定する。実績：RNF213遺伝子解析が終了し、変異型と野生型の患者の層別化が完了した。