口腔がん関連長鎖非コードRNAによるIFN応答の意義と応用

长链非编码RNA对干扰素反应与口腔癌相关的意义和应用

• 批准号: 22K17188
• 负责人: 畠中 柚衣
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Sapporo Medical University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K17188/
• 关键词: 口腔がん; 長鎖noncoding RNA; DLEU1; インターフェロン応答

口腔がん細胞におけるDLEU1の分子機能を明らかにするため、口腔がん細胞株を用いてDLEU1をsiRNAでノックダウンし、遺伝子発現をマイクロアレイ解析し、ヒストン修飾をクロマチン免疫沈降シークエンス(ChIP-seq)で解析した。ヒストン修飾は、転写活性化マーカーであるヒストンH3リジン4トリメチル化(H3K4me3)と、ヒストンH3リジン27アセチル化(H3K27ac)を解析対象とした。ChIP-seq解析の結果、DLEU1ノックダウンによりゲノムワイドなH3K27acレベルの低下を認めた。H3K27acレベルが変化した遺伝子を抽出し、Gene Ontology解析およびPathway解析を行った結果、インターフェロン応答や免疫応答に関わる遺伝子が有意にエンリッチしていることが明らかとなった。IFIT1、IFITM1、IFI6など代表的なインターフェロン応答遺伝子を選択し、H3K27acレベルをChIP-qPCRで再検証した結果、DLEU1ノックダウンによる低下が確認された。また遺伝子発現マイクロアレイの結果をGene Set Enrichment Analysisで解析した結果からも、DLEU1ノックダウンによりインターフェロン応答に関わる遺伝子セットの有意な発現低下が確認された。これらの結果は、複数の口腔がん細胞株を用いた定量RT-PCRからも確認された。さらにDLEU1ノックダウンによりINFAR1やIFNGR2などインターフェロン受容体の発現が抑制されることを定量RT-PCRから明らかにした。以上の結果から、DLEU1が口腔がん細胞のインターフェロン応答を活性化することを明らかにした。

The molecular function of DLEU1 in oral cells was clarified, and DLEU1 siRNA was used in oral cell lines. The expression of DLEU1 mRNA was analyzed by PCR, and the modification of DLEU1 mRNA by ChIP-seq was analyzed. H3K4me3, H3K27ac, H3K27ac, H37ac, H3K27ac, H37ac, H3 ChIP-seq analysis results, DLEU1 H3K27ac gene extraction, Gene Ontology analysis and Pathway analysis results, Gene Ontology analysis and Immune Response analysis results IFIT1, IFIM 1, IFI6, H3K27ac, ChIP-qPCR, DLEU1, DLEU1, DLEU 2, DLEU 3, DLEU 4, DLEU 5, DLEU 6, DLEU 7, DLEU 8, DLEU 9, DLEU 10, DLEU The results of Gene Set Enrichment Analysis were analyzed. The results of Gene Set Enrichment Analysis were analyzed. The results of Gene Set Enrichment Analysis were confirmed. These results were confirmed by quantitative RT-PCR in multiple oral cell lines. DLEU1, INFAR1, IFNGR2, IFNGR1, IFNGR2, IFNGR2, IFNGR1, IFNGR2, IFNGR2, IFNGR1, IFR2, IFNGR2, IFR3, IFR2, IFR3, IFR As a result, DLEU1 was activated in the oral cavity.

项目成果

CXCL12 is expressed by skeletal muscle cells in tongue oral squamous cell carcinoma.

CXCL12由舌头口服鳞状细胞癌中的骨骼肌细胞表达。

• DOI: 10.1002/cam4.5392
• 发表时间: 2023-03
• 期刊: Cancer medicine
• 影响因子: 4

腫瘍間質のAEBP1は頭頚部扁平上皮がんの進展を促進する

肿瘤基质中的AEBP1促进头颈鳞状细胞癌的进展

• 发表时间: 2022
• 作者: Sudo Gota;Aoki Hironori;Yamamoto Eiichiro;Takasawa Akira;Niinuma Takeshi;Yoshido Ayano;Kitajima Hiroshi;Yorozu Akira;Kubo Toshiyuki;Harada Taku;Ishiguro Kazuya;Kai Masahiro;Katanuma Akio;Yamano Hiro‐o;Osanai Makoto;Nakase Hiroshi;Suzuki Hiromu;萬顕，関口翔平，高澤啓，山本英一郎，新沼猛，北嶋洋志，甲斐正広，小山内誠，宮崎晃亘，高野賢一，鈴木拓．;関口翔平，萬顕，岡崎史佳，山本英一郎，新沼猛，高澤啓，須藤豪太，畠中柚衣，吉戸文乃，北嶋洋志，甲斐正広，小山内誠，廣橋良彦，小島隆，宮崎晃亘，鈴木拓．
• 通讯作者: 関口翔平，萬顕，岡崎史佳，山本英一郎，新沼猛，高澤啓，須藤豪太，畠中柚衣，吉戸文乃，北嶋洋志，甲斐正広，小山内誠，廣橋良彦，小島隆，宮崎晃亘，鈴木拓．