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地域住民における腸管への口腔細菌異所性定着とそのリスク因子の解明

当地居民肠道口腔细菌异位定植及其危险因素分析

基本信息

批准号：
22K17269
负责人：
影山伸哉
金额：
$ 3万
依托单位：
Kyushu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本年度は、唾液検体ならびに便検体のマイクロバイオーム解析を行った。唾液検体、便検体からのDNA抽出はすでに完了しており、まずはPCR法を用いて採取した検体に含まれる16S rRNA遺伝子の全長を網羅的に増幅した。プライマーにはサンプル識別用の8塩基のタグ配列を付与した8Fと1492Rを使用した。ロングリードシークエンサーのPacBio Sequel IIを用いて、得られた増幅断片の塩基配列を解読し、各検体に含まれる細菌構成を明らかにした。この解析手法では細菌の識別に用いる16S rRNA遺伝子の可変領域（V1-V9領域）の塩基配列が全て解読されるため、遺伝子の相同性の高い細菌についても高解像度に識別することが可能となる。そのため、口腔マイクロバイオームと腸管マイクロバイオームから検出された細菌が同一細菌かどうかをより高精度に検証できる。得られた塩基配列を解析した結果、唾液マイクロバイオームと腸管マイクロバイオームが大きく異なる細菌構成を示す一方、StreptococcusやVeillonellaは口腔と腸管から共通して検出されることが明らかとなった。また、これらの細菌は一部の対象者の腸管マイクロバイオームにおいて高い比率を占めていた。これらの結果より、口腔細菌が腸管まで到達していることが示唆された。現在はさらなる解析を継続中である。

This year, 検, saliva 検, ならびに, 検, <s:1>, <s:1>, ロバ, <s:1>, <s:1>, ム, ム analysis of を lines った. Saliva 検, then 検からの DNA extraction はすでに finished しており, まずをは PCR method with いて take したに検 derivatives containing まれる traces of 16 s rRNA 伝 son over のをに raised of snare した. プライマーにはサンプル identification with 8 salt base ののタグ match column を give した 8 f と 1492 r をした. ロングリードシークエンサーの PacBio Sequel II を with いて, られた rights of fragment の salt base with column を solution 読し, each 検に containing まれる bacteria constitute を Ming らかにした. この parsing technique でのは bacteria identification に with いる traces of 16 s rRNA の伝 can - field (V1) - V9 field の salt base with column がて solution all 読されるため, but 伝の identity の high い bacteria についても high resolution に recognition することが may となる. そのため, oral マイクロバイオームと insufflate マイクロバイオームから検 out されたが the same bacteria かどうかをより high-precision に検 card できる. Have to られた salt base with column を parsing した results, saliva マイクロバイオームと insufflate マイクロバイオームが big きく different なるを shown す side, Streptococcus bacteria や Veillonella は oral と insufflate から common して検 out されることが Ming らかとなった. The ratio of また, めてれられら <s:1> bacteria in the intestinal tract of a certain <s:1> target is high, and the ratio of をムにおててを accounts for めてたたた. The results of <s:1> れられらよよ, oral bacteria が intestinal まで reach るてるるとがとが indicating された. Now さらなるさらなる parses である in を継続.