単一細胞オミクスを用いる老化に伴う骨格筋再生機能低下メカニズムの解明
利用单细胞组学阐明与衰老相关的骨骼肌再生功能下降的机制
基本信息
- 批准号:22K17802
- 负责人:
- 金额:$ 2.91万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
- 财政年份:2022
- 资助国家:日本
- 起止时间:2022-04-01 至 2024-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
骨格筋の健全性維持のためには、組織損傷時に幹細胞が適切に活性化・増殖・分化され、組織が再生されなければならない。老化により再生機能が低下する一方で、筋分化に機能するヒストンバリアントがクロマチン構造に蓄積されることが知られているが、その原因はいまだ不明である。本研究では、機能する時期が異なる複数のヒストンバリアントの老化によるクロマチン構造への取り込みの変化に着目し、これらの変化が再生にもたらす影響とそのメカニズムの解明を目的とする。このとき、数理モデルを構築し、老化による再生能力低下の原因となる因子を同定するとともに、その制御メカニズムを解明する。マウスは寿命が短く加齢による老化の進行が急速なため、骨格筋老化の原因が、加齢により再生機能が低下したことにあるのか、DNA損傷等により細胞周期が停止した老化細胞にあるのか、区別が難しい。他方で、長寿命である樹木は基本的に加齢とともに老化は進行しないと考えられており、落葉樹では季節変化に応じて開葉と葉の老化が生じる。このように樹木では、加齢の影響を考慮する必要がないため、その組織である葉の生成と老化の制御メカニズムは理解しやすいと考えられる。そこで研究計画を見直し、加齢を考慮しない環境要因に対する遺伝子発現応答の数理モデルの構築を試みた。本年度は、異なる緯度に生育するソメイヨシノの芽と葉の一年間を通したトランスクリプトデータの網羅的な解析を行った。芽のサンプルに対し、異なる環境と季節を特徴づけるいくつかの遺伝子発現プロファイルを同定するとともに、それらが温度変化によって説明できることを明らかにした。この研究成果は、第70回日本生態学会仙台大会(オンライン開催)で英語による口頭発表を行った。この内容は現在、論文を執筆中であり、国際誌への投稿を予定している。
Skeletal muscle の sanity maintain の た め に は, tissue damage に stem cells が appropriate に activeness, raised colonization, differentiation さ れ, organization が regeneration さ れ な け れ ば な ら な い. Low aging に よ り regeneration function が す で る party, muscle differentiation に functional す る ヒ ス ト ン バ リ ア ン ト が ク ロ マ チ ン tectonic に accumulation さ れ る こ と が know ら れ て い る が, そ の reason は い ま だ unknown で あ る. This study で す は, function が る period different な る plural の ヒ ス ト ン バ リ ア ン ト の aging に よ る ク ロ マ チ ン tectonic へ の take り 込 み の - に the mesh し, こ れ ら の variations change が regeneration に も た ら す influence と そ の メ カ ニ ズ ム の interpret を purpose と す る. こ の と き, mathematical モ デ ル を build し, aging に よ る の reasons for low regeneration と な る factor を with fixed す る と と も に, そ の suppression メ カ ニ ズ ム を interpret す る. マ ウ ス は が short life く plus 齢 に よ る to が rapid aging の な た め, skeletal muscle ageing が の reasons, plus 齢 に よ り low regeneration function が し た こ と に あ る の か, such as DNA damage に よ り cell cycle が stop し た senescent cells に あ る の か, difference between が し い. Fang で, long-life で あ る は basic に trees add 齢 と と も に は for aging し な い と exam え ら れ て お り, deciduous trees で は seasonal variations change に 応 じ て open leaf と leaf aging の が じ る. こ の よ う に trees で は, 齢 の influence を consider す る necessary が な い た め, そ の organization で あ る leaf の generated と aging の suppression メ カ ニ ズ ム は understand し や す い と exam え ら れ る. そ こ で research projects を see straight し, plus 齢 を consider し な い environment by に す seaborne る posthumous son 伝 発 応 now answer の mathematical モ デ ル の build を try み た. は this year, different な る latitude に fertility す る ソ メ イ ヨ シ ノ の と leaves の year を tong し た ト ラ ン ス ク リ プ ト デ ー タ の snare な resolution を line っ た. Bud の サ ン プ ル に し seaborne, different な る environment と season を 徴 づ け る い く つ か の posthumous son 伝 発 now プ ロ フ ァ イ ル を with fixed す る と と も に, そ れ ら が temperature variations change に よ っ て illustrate で き る こ と を Ming ら か に し た. The research results of による, the 70th Sendai Conference of the Ecological Society of Japan (ラ ラ ラ で to be held) で English による oral presentation を line った. The content of <s:1> <s:1> is currently, the paper is being written at を であ であ, and the journal of international studies へ is being submitted to を and approved by て る る る.
项目成果
期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Latitudinal variation of molecular phenology reveals the regulatory mechanism of bud dormancy
分子物候的纬度变化揭示芽休眠的调控机制
- DOI:
- 发表时间:2023
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Atsuko M. KUWAKADO;Masaaki SHIMIZU;Keiko KITAMURA;Qingmin HAN;Akiko SATAKE
- 通讯作者:Akiko SATAKE
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桑門 温子其他文献
Journal of Japanese Biochemical Society
日本生物化学会杂志
- DOI:
- 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
原田 哲仁;小松 哲郎;前原 一満;近藤 友佳理;田中 かおり;桑門 温子;佐藤 優子;木村 宏;林 克彦;小野 悠介;竹本 龍也;胡桃坂 仁志;大川 恭行;原田 哲仁,大川 恭行 - 通讯作者:
原田 哲仁,大川 恭行
ヒストンH3バリアントの選択的取り込みによる組織特異的な遺伝子発現制御
通过选择性掺入组蛋白 H3 变体进行组织特异性基因表达调控
- DOI:
- 发表时间:
2019 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
原田 哲仁;小松 哲郎;前原 一満;近藤 友佳理;田中 かおり;桑門 温子;佐藤 優子;木村 宏;林 克彦;小野 悠介;竹本 龍也;胡桃坂 仁志;大川 恭行 - 通讯作者:
大川 恭行
骨格筋研究のための最先端解析技術.
骨骼肌研究的尖端分析技术。
- DOI:
- 发表时间:
2020 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
原田 哲仁;小松 哲郎;前原 一満;近藤 友佳理;田中 かおり;桑門 温子;佐藤 優子;木村 宏;林 克彦;小野 悠介;竹本 龍也;胡桃坂 仁志;大川 恭行;原田 哲仁,大川 恭行;大川 恭行,原田 哲仁,前原 一満;原田 哲仁,大川 恭行 - 通讯作者:
原田 哲仁,大川 恭行
シングルセルでのエピゲノム情報の計測技術.
测量单细胞表观基因组信息的技术。
- DOI:
- 发表时间:
2020 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
原田 哲仁;小松 哲郎;前原 一満;近藤 友佳理;田中 かおり;桑門 温子;佐藤 優子;木村 宏;林 克彦;小野 悠介;竹本 龍也;胡桃坂 仁志;大川 恭行;原田 哲仁,大川 恭行;大川 恭行,原田 哲仁,前原 一満;原田 哲仁,大川 恭行;原田 哲仁,大川 恭行 - 通讯作者:
原田 哲仁,大川 恭行
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