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神経細胞集団のCa輝度変化情報の機械学習による医薬品の痙攣毒性予測法の開発

神経細胞集団のCa輝度変化情報の機械学習による医薬品の痙攣毒性予測法の開発
开发一种利用神经细胞群 Ca 亮度变化信息的机器学习来预测药物惊厥毒性的方法
批准号:
22K17998
负责人:
松田 直毅
金额:
$2.91万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2022-04-01 至 2024-03-31

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项目成果

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本研究では、ハイスループット計測が可能な神経細胞集団のCaイメージング法で得られた輝度変化(1ウエルあたり1つの時系列データ)から、機械学習を用いて、痙攣リスクおよび作用機序予測を可能とする解析法を開発することを目的としている。本年度はヒトiPS細胞由来ニューロンを用いて、MEA計測でデータ取得済みの24種類の痙攣陽性化合物および5種類の陰性対照化合物における用量依存的なデータを取得した。輝度値の時系列データから算出したオシレーションのピーク関連パラメータを用いて機械学習を行い、オシレーションと非オシレーションを分類するオシレーション検出AIを作製した。作製したAIは97%の精度でオシレーションを検出した。次に、AIが検出したピークに基づき算出されたパラメータの主成分解析を行い、陰性化合物の主成分得点に基づく痙攣毒性予測法を開発した。痙攣毒性判定の結果、24つの痙攣陽性化合物のうち23化合物の毒性を検出できたが、5つの陰性化合物のうち2つの陰性化合物が毒性と判定されたため、偽陽性が課題となった。今後は主成分分析に使用するパラメータについて検討するとともに、パラメータを学習した機械学習による痙攣毒性予測法および、作用機序予測法の開発を行う。さらに、阻害剤、リガンド、承認薬等の化合物ライブラリーであるLoPac1280化合物のデータを用いて、開発した痙攣毒性予測法の予測結果の妥当性、および開発した予測法の課題を検証する。
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