DNA損傷応答時に相同組換え修復が担うゲノム安定化機構の解明

阐明DNA损伤反应过程中同源重组修复发挥的基因组稳定机制

• 批准号: 22K18036
• 负责人: 藤田 侑里香
• 金额: $ 3万
• 依托单位: Osaka University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K18036/
• 关键词: 相同組換え; DNA損傷; 染色体; がん

本年度はHR関連因子、特に正と負に制御する因子のそれぞれの機能や関係性を明らかにすることを主眼において、作製済みの変異体細胞の解析を中心に行った。また、変異体解析が困難な遺伝子については、siRNA処理により遺伝子を欠損させた後の細胞の、RAD51の局在やDNA損傷の蓄積状況など、表現型解析を行なった。今後タンパク間の相互作用などを検証していく予定である。合わせて、HR因子が機能するDNA複製期（S期）に特に焦点を当て、S期の染色像からS期を前期・中期・後期に分類し、各HR因子の変異体・欠損細胞でRAD51等、HRやDNA複製に関与する因子についてを免疫染色で検証した結果、因子によって主に機能するphaseが異なる可能性が確認された。ただし本年度の検討では各分類における細胞の絶対数に偏りがあることやDNA損傷有無における差異まで比較することができなかったため、来年度以降は細胞の同調やFACSソーティング等を活用して再現性を確認する。さらに、HR関連因子が機能する染色体上の特異性をゲノムワイドに検証するため、RAD51のChIP-seqの条件検討を実施した。RAD51は染色体上における局在が一時的であること等から初回のChIP-seqでは十分なピーク検出は困難であったが、細胞数やリード数などの条件等を行なった結果、DNA損傷下においてRAD51のピークを検出することができ、未処理群と比較してRAD51の結合量及び局在場所に顕著な差異が確認された。この結果を受けて、再現性の確認及び種類の異なる薬剤処理を実施後にChIP-seqを追加実施済みで、現在解析を行っている。

This year, the HR system is responsible for the monitoring and control factors. This year, we are able to make sure that the main eye is in the center of the system. In terms of body analysis, data analysis, siRNA analysis, and analysis. In the future, we need to know how to interact with each other. In the DNA replication phase (S phase), the specific focus of DNA replication (S phase), S phase staining, the classification of pre-and mid-middle phase of S phase, the subcellular RAD51 of all HR factors, the DNA replication of HR and the immuno-staining results of HR factor were compared, and the host machine of phase was able to confirm the results of immunostaining results. For the current year, the number of cells in each category is different from that of the DNA. There are significant differences between the two groups. In the coming year, there are significant differences between the two groups, and in the coming year, there are significant differences in the number of people in each category. In the current year, there are significant differences in the number of people in each category, such as the number of people in each category. The specific genes on the chromosomes were detected by HR gene and RAD51 chip-seq conditionals. For the first time on the chromosome of the RAD51, it is very important for the ChIP-seq to analyze the results of the test, such as the number of cells, the condition of the number of cells, and the condition of the number of cells. the results of the DNA, the results of the RAD51, the results of the group comparison and the confirmation of the results obtained by the local office. As a result, the ChIP-seq added additional information after the application, re-confirmation and application of the information system, and now we are analyzing the data.