高スピン5配位型ヘムタンパク質の新規設計と合成
高スピン5配位型ヘムタンパク質の新規設計と合成
批准号:
09780616
负责人:
磯貝 泰弘
金额:
$1.28万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
财政年份:
1997
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1997 至 1998
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分子状酸素を安定に結合する、完全に人工的なヘムタンパク質をつくることを目的とし、構造予測で用いられる3D-ID法を応用して、153アミノ酸残基からなる新規人工グロビンの設計を行った。この人工グロビン(Designed Globin、DG)のアミノ酸配列がコンピューター上、ターゲットとした骨格構造と矛盾がないことをを確かめた後、これをコードする合成遺伝子を大腸菌内で発現させ、目的とするタンパク質を得た。DGは水溶性で、低タンパク質濃度・非変性条件下でモノマーとして存在した。円偏光2色性とX線溶液散乱による構造解析の結果、DGは、天然のアポミオグロビンと同様のヘリックス含量(61%)と分子の外形(回転半径20Å)を示した。さらに、DGは、その回転半径の減少を伴って、1分子あたり1つのヘムを結合した(K_d=0.08μM)。可視光吸収および共鳴ラマンによる分光学的解析の結果、結合ヘムは、酸化型(鉄3価)で2つのヒスチジンが軸配位している低スピン6配位型であることが示された。一方、還元型(鉄2価)は、低スピン6配位型と高スピン5配位型の混合状態にあった。しかし還元型ヘム-DGを酸素と混合すると結合ヘムは速やかに酸化され、ミオグロビンにみられるような安定な酸素化型を検出できなかった。さらに、NMR測定の結果、DGは、天然のタンパク質にみられるような側鎖レベルでの構造の単一性を欠いていることが明らかとなった。以上の結果は、天然タンパク質のアミノ酸配列には、主鎖の骨格構造とともに側鎖構造もコードされており、分子状酸素との結合のような生物学的機能を設計するためには、主鎖構造ばかりでなく側鎖構造を考慮に入れた設計法が必要であることを示す。
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科研奖励(0)
会议论文
A.Nasuda-Kouyama, M.Nakata, T.Iizuka, Y.Isogai: "Mehcanisms of Nitroso-compound-induced inhibition of superoxide generation in neutrophils : Fluorescence quenching of perylene by nitroso-compounds in membrane fractions of NB" J.Biochem.122. 550-555 (1997)
A.Nasuda-Kouyama、M.Nakata、T.Iizuka、Y.Isogai:“亚硝基化合物诱导抑制中性粒细胞超氧化物生成的机制:NB 膜组分中亚硝基化合物对苝的荧光猝灭” J.Biochem
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
M.Nakata, A.Nasuda, Y.Isogai, S.Kanegasaki, T.Iizuka: "Effect of aromarn nitroso-compounds on superotide generating activity in neutrophis" J.Biochem.122. 188-192 (1997)
M.Nakata、A.Nasuda、Y.Isogai、S.Kanegasaki、T.Iizuka:“芳香亚硝基化合物对中性粒细胞超肽生成活性的影响”J.Biochem.122。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
M.Ota, Y.Isogai, K.Nishikawa: "Structural requirement of highly-conserved residues in globins" FEBS Lett.415. 129-133 (1997)
M.Ota、Y.Isogai、K.Nishikawa:“球蛋白中高度保守残基的结构要求”FEBS Lett.415。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
人工タンパク質のデザインとフォールディング
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批准号:16041246
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$5.44万
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财政年份:2004
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负责人:磯貝 泰弘
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依托单位:
創るアプローチによる実験的ゲノム科学
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批准号:13202072
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$1.92万
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财政年份:2001
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负责人:磯貝 泰弘
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依托单位:
グロビンフォールドのdenovo分子設計
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批准号:10157230
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$0.83万
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财政年份:1998
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负责人:磯貝 泰弘
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依托单位:
分子状酸素の一電子還元を触媒するb型シトクロームの構造と機能
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批准号:06808067
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1994
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负责人:磯貝 泰弘
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依托单位:
食細胞のb型シトクロームによる酸素還元のメカニズム
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批准号:04858048
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1992
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负责人:磯貝 泰弘
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依托单位:
食細胞における活性酸素生成機構の解明(新しい無細胞系の確立とその利用)
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批准号:03858057
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.45万
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财政年份:1991
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负责人:磯貝 泰弘
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依托单位:
高等植物の葉緑体における酸素発生系の構造
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批准号:63790242
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1988
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负责人:磯貝 泰弘
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依托单位:
海外基金