質量分析装置バイテックMS測定における抗酸菌前処理の検証と同定精度の向上化

验证抗酸菌预处理并提高质谱仪 Vitec MS 测量中的识别精度

• 批准号: 16H00650
• 负责人: 渡 智久
• 金额: $ 0.36万
• 依托单位: Asahikawa Medical College
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
• 财政年份: 2016
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2016 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16H00650/
• 关键词: 抗酸菌同定; MALDI-TOFMS; バイテックMS

2016年後期にシスメックスビオメリュー社から抗酸菌用前処理キットが販売された。キットの組成は我々が開発途中であった前処理法とほぼ同様であるが、ジルコニアビーズではなく、ガラスビーズであった。同定成績を標準菌株9株、臨床分離株80株に対して検証した。前培養に用いたMiddlebrook7H11と小川培地ごとの同定率は、標準菌株はそれぞれ100%であった。同じく、臨床分離株は全体では90.0%(72/80)と91.3%(73/80)、M. bovisBCGは両培地で100%(2/2)、M. aviumが100%(30/30)と96.7%(29/30)、M. intracellulareは87.5%(14/16)と100%(6/16)であった。さらに、M. kansasiiは両培地とも100%(6/6)、M. gordonaeも両培地ともに80%(8/10)、M. abscessusが75%(3/4)と100%(4/4)、M. kansasii/M. gastriは両培地ともに100%(9/9)であった。Tapman法でM. lentiflavumがM. intracellulareに誤同定を示した2株は正しく同定できた。また、前処理後M. bovisBCGは、小川培地8週間、MGIT培地6週間の培養で菌の発育陰性で菌の死菌化を確認した。本前処理法は同定率が高く、簡便なことから日常検査での有用性が示された。DDHでM. scroflaceumとなった3株は同定不能となった。しかし、本検討で標準菌株の測定では同定できたことから、DDHの誤同定の可能性がある。この3株はrpoB、hsp65、16SrRNA遺伝子の塩基配列を決定し、BLAST解析したが菌名を明らかにできなかった。よって、本研究で菌名を確定できなかったが、今後追加試験で他の遺伝子も解析し、VMSデータベースの登録、同定性能の向上を確認する。

In the latter part of 2016, we will discuss the use of acid-fast bacteria in the community. The train is organized to make sure that we have the same understanding and understanding as we do on the way to the airport. There were 9 standard strains and 80 bed isolates. Before using Middlebrook7H11, Ogawa Peidi, the same rate and standard strains were used to determine the same rate. The total number of isolates isolated from the same bed was 90.0% (72max 80), 91.3% (73max 80), 100% (2pm 2), 96.7% (29max 30), 87.5% (14max 16), 100% (6max 16), respectively, for M. bovisBCG and M. avium isolates. 100% (6 kansasii), 80% (8pm 10), 75% (3pm 4), 100% (4max 4), 100%, 100%, 100%, 100%, 100%, 8, 10, 8, 10, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 5, 10, 10, 10, 8, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 5, 5, 5, 5, 5, 5, 5, 8, 8, 10, 8, 10, 8, 10, 10, 8, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, Tapman method, M. lentiflavum, M. intracellulare error test showed that 2 strains were positive and positive. After treatment, M. bovisBCG, Ogawa Peidi 8, and MGIT 6, the culture of bacteria, the death of bacteria, and the confirmation of bacterialization. The former theory and method agree that the rate is high, convenient, daily, useful and useful. The three strains of DDH M. scroflaceum virus were determined to be unable to treat each other. This standard strain is determined by the same standard strain, the same as the standard strain, the same as the standard strain. Three strains of rpoB, hsp65 and 16SrRNA were sequenced and analyzed by BLAST. The name of the fungus was identified. In this study, the name of the fungus was confirmed, and then a further analysis was added, VMS was added, and the same performance was confirmed.