高分解能NMRを用いたタンパク質室温燐光寿命の定量的解析

使用高分辨率 NMR 定量分析蛋白质室温磷光寿命

• 批准号: 09740342
• 负责人: 小寺 義男
• 金额: $ 1.28万
• 依托单位: Kitasato University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
• 财政年份: 1997
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1997 至 1998
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-09740342/
• 关键词: タンパク質室温燐光; NMR; タンパク質ゆらぎ; 分子認識; 高分解能NMR; タンパク質揺らぎ

1. 14アミノ酸残基からなるハチ毒Mastoparan-X(MP-X)の室温燐光測定.MP-XはTrpを1つだけ持つペプチドであり,リン脂質のベシクル存在下でαヘリックス様の立体構造をとることがNMR測定により明らかにされている.今回はSDS存在下(100mM)と非存在下でMP-Xの燐光測定を行た.その結果,SDS存在下で時定数約30μ秒で減衰する燐光の検出に成功した.このことはMP-XとSDSミセルとの相互作用によって,Trp周辺の自由度が減少したことを示唆している.今後は燐光測定と同じ条件下でNMRを測定し,Trp近傍の立体構造と燐光寿命の関係について研究する. (1998年10月,日本生物物理学会にて口頭発表)2. 高等植物光化学系IIの水分解に関与する33kDaタンパク質の燐光測定.33kDaタンパク質はチラコイド膜外面と光化学系IIの水分解系の間に位置して,系への水の供給に関与している.測定の結果,燐光寿命が約3msであることがわかった.今後,蛍光スペクトルを測定して,同タンパク質が光化学系内におかれている環境および状態を議論する.3. HIVの粒子形成に関連したタンパク質(NCp8)の部分ペプチドの立体構造解析.アミノ酸29残基のペプチドの立体構造をNMRを用いて決定した.このペプチドは,14残基のzinc finger motifを1つ含んでおり,Zn^<2+>イオンの配位によって一定の立体構造を形成し,ウイルスRNAとの特異的な結合能を持つ.今後,燐光寿命を測定し,Trp周辺の構造ゆらぎについて研究する. (Kodera,Y.et al.(1998)Biochemistry37,17704-17713)

1. 14. Room temperature phosphorescence determination of Mastoparan-X(MP-X).MP-X has a stereostructure in the presence of Trp, Lipid and Lipid. MP-X phosphorescence determination was performed in the presence of SDS (100mM) and in the absence of SDS. As a result, in the presence of SDS, the decay time was about 30μ s and the phosphorescence was successfully detected. The interaction between MP-X and SDS reduces the degree of freedom of the Trp cycle. In the future, NMR measurements under the same conditions for phosphorescence determination will be carried out to study the relationship between the stereo structure and phosphorescence lifetime near Trp. (1998 October, 2003, Japanese Biophysical Society (JBSS)2. The relationship between water decomposition of photochemical system II in higher plants and phosphorescence determination of 33kDa protein is related to the relationship between water supply of photochemical system II and phosphorescence determination of 33 kDa protein. As a result, the phosphorescence lifetime is about 3 ms. In the future, the determination of light quality and the quality of the environment in the photochemical system will be discussed. Analysis of the 3D structure of some selected molecules related to the formation of HIV particles. The stereostructure of amino acid 29 residues was determined by NMR. The 14-residue zinc finger motif contains Zn^<2+>,Zn^<2+>, Zn ^< In the future, the phosphorescence lifetime will be determined, and the structure of Trp will be studied. (Kodera,Y.et al. (1998)Biochemistry37,17704-17713)

项目成果

Yoshio Kodera: "High-resolution solution NMR structure of the minimal active domain of the human immunodeficiency virus type-2 nucleocapsid protein" Biochemistry. 37. 17704-17713 (1998)

Yoshio Kodera：“人类免疫缺陷病毒 2 型核衣壳蛋白最小活性结构域的高分辨率溶液 NMR 结构”生物化学。