ヒメ目魚類の進化にみる深海への適応過程:分子系統樹に基づく新たな解釈

膜翅目鱼类进化中的深海适应过程：基于分子系统发育树的新解释

• 批准号: 09740644
• 负责人: 宮 正樹
• 金额: $ 1.28万
• 依托单位: Natural History Museum and Institute, Chiba
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
• 财政年份: 1997
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1997 至 1998
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-09740644/
• 关键词: 分子系統学; 種分化; 深海性魚類; ミトコンドリアDNA; 生物地理学; 適応; ヒメ目

昨年度に解析を行った7種に加えてさらに14種の全DNAを常法により抽出し,ミトコンドリアDNAの12Sならびに16SリボゾームRNAをコードする2つの異なる領域からなるおよそ1000bpをPCR法により増幅しダイレクトシークエンスを行った.予備的な系統解析を行った結果,これら2つの遺伝子から得られる情報量では,計21種の系統関係を明らかにするのに十分ではないことがわかった.そこで,Long PCRとユニバーサルプライマーの新たな開発によるヒメ目魚類のミトコンドリアゲノム解読を試みた.その結果,きわめて短時間のうちにゲノムの全塩基配列を決定することが可能になり,その第一段階として13科のゲノムの全塩基配列の決定を試みた.ヒメ目のミトコンドリアゲノムは通常の脊椎動物と同じ遺伝子組成で,遺伝子の配置変動は観察されなかった.計13科のゲノムのデータをもとに,さまざまな角度から系統関係を再構築したところ,タンパク質をコードする13遺伝子に加えてtRNA遺伝子計22個をつなげた.計およそ13,000bpからなる大規摸なデータセットが系統解析にきわめて有効であることが判明した.この系統樹から,ヒメ目魚類では並行的に何回にもわたって深海への適応進化が起こったことが示唆された.

In the year of last year, the bank issued a total of 14 full-DNA normal methods for extraction, and the DNA system 12s was used to determine the accuracy of the 16s RNA system. In the field, the 1000bp method was used to determine the accuracy of the 1000bp method. According to the results of the system analysis results of the equipment, a total of 21 system systems have been reported, and the results are very high. This is the first time for Long PCR to start a new program. This is not true. This is not the case. According to the results of the test, it is decided that the full base configuration will be affected in a short period of time, and the first paragraph will determine whether the full base will be successful. In general, the spinal motion is the same as that of the child, and the child is configured to monitor the health of the child. A total of 13 schools were divided into two groups, namely, the system, the system, and the tRNA, totaling 22 per cent. You need to know that there is a problem in the analysis of the system. There are many problems in the 13000bp system analysis. With the development of the system system and the parallel operation of the system, there is an indication of how the deep-sea environment is improving.