抗酸菌感染症患者のIFNγ受容体、IL-12受容体遺伝子多型に関する検討
分枝杆菌感染患者IFNγ受体和IL-12受体基因多态性研究
基本信息
- 批准号:11770319
- 负责人:
- 金额:$ 1.09万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
- 财政年份:1999
- 资助国家:日本
- 起止时间:1999 至 2000
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
対象:肺非定型抗酸菌症(以下NTM症)患者14例、結核患者10名(男性12例、女性12例、平均年齢76.1歳)を対象に行った。方法:肺非定型抗酸菌症患者の末梢血よりRNAとgenomic DNAの抽出を行った。また、Interferon γ receptor 1(以下IFNGR1)遺伝子の395番目の塩基,131番目の塩基,ならびに818番目の遺伝子の変異を調べるため、その近傍の塩基配列を中心にprimerを作成した。同様にIL-12 receptor β 1遺伝子に対してもprimerを作成した。RNAよりcDNAを作成し、また抽出したgenomic DNAに対してPCRを行った。その後PCR産物をSuprec-02カラム(宝酒造)にて処理しprimerとdNTPsを除去した。精製後、PCRに用いたprimerを用いてDye Terminator Ready Reaction Mix with amplitaq FS(PerkinElmer Corp.)にて反応させた後,フェノール,クロロホルム処理とエタノール沈殿を行い,auto-sequencer(ABI-PRISM373)を用いて塩基配列を決定した。結果:NTM症ならびに結核症全例におけるIFNGR1遺伝子の395番目の塩基,131番目の塩基,ならびに818番目の遺伝子の変異は認められなかった。IL-12 receptor β 1遺伝子においても過去に報告された遺伝子変異は認められなかった。考察:IFNGR1遺伝子の818番目の遺伝子の変異はNTM症患者におけるHot spotと報告されているものの、今回の検査結果では変異は認められず、過去に報告されているIFNGR1遺伝子変異およびIL-12 receptor β 1遺伝子変異以外に要因が存在する可能性が考えられた。
14 patients with pulmonary atypical acidosis (NTM) and 10 patients with tuberculosis (male 12, female 12, mean age 76.1 years) were investigated. Methods: RNA and genomic DNA were extracted from peripheral blood of patients with pulmonary atypical acid-fast syndrome. In addition, the 395-point base of the Interferon γ receptor 1(hereinafter IFNGR1) gene, the 131-point base, and the 818-point base of the gene were adjusted, and the nearby base arrangement was prepared in the center by the primer. The IL-12 receptor β 1 gene is also responsible for the preparation of the primer. RNA cDNA was extracted and PCR was performed. The PCR product was then processed by Suprec-02 to remove dNTPs. Dye Terminator Ready Reaction Mix with amplitaq FS(PerkinElmer Corp.) After the reaction, the auto-sequencer(ABI-PRISM373) is used to determine the base alignment of the auto-sequencer. Results: IFNGR1 gene was identified in 395 cases of NTM and 818 cases of tuberculosis. IL-12 receptor beta 1 gene is a gene that has been reported in the past. Investigation: IFNGR1 gene 818 gene variant in patients with NTM syndrome reported Hot spot and current investigation results were different from those reported in the past IFNGR1 gene variant and IL-12 receptor β 1 gene variant.
项目成果
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