氷温でのタンパク質構造変化と進化工学による高機能化因子の関連
氷温でのタンパク質構造変化と進化工学による高機能化因子の関連
批准号:
11780469
负责人:
田村 厚夫
金额:
$1.34万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
财政年份:
1999
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1999 至 2000
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タンパク質として、プロテアーゼの1種サチライシンを用いて、低温での高機能化を進化工学の手法を用いて果たした。具体的には、まず、サチライシンの遺伝子を出発点として、error-prone PCR法という手法で、ランダムに遺伝子DNAに変異を生じさせた。変異確率は、第1回目の集団では、アミノ酸変異として平均2.7個、第2回目の集団では平均1.0個の割合で起こった。第1集団については、サチライシンを単離、精製し、酵素反応速度のパラメーターを分光測定によって求め、活性上昇率が10℃において、3%であることを見い出した。上昇率が高くないのは、変異が多いにもかかわらず、サンプリング数(4万個)が少ないためであると見積ることができたので、第2集団から選び出すことにした。この結果、野生型に比べ明らかに高速に活性が出現するものが約10種、特に2倍以上高速なものが2種得られた。また、高活性体の中で、共通する位置に変異があるものが複数得られ、これら「ホットスポット」を同定することができた。現在これら高活性体の酵素反応速度パラメーターの定量測定を行っている。一方、サチライシンの一部とアミノ酸配列の相同性のあるタンパク質POIA1について、その立体構造を核磁気共鳴法を用いて決定した。また、構造の基本単位であるαヘリックス構造やβシート構造についての構造生物学的な基礎研究を各種測定法を用いて行った。この結果、長くつらなったβシート構造の意義、分光学的な測定法の開発などに成功した。
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X.Huang: "Formation of the single-layer β-sheet of Borrelia burgdorferi OspA in the absence of the Cterminal cappping globular domain"J.Mol.Biol.. (発表予定). (2001)
X.Huang:“在没有 C 末端加帽球状结构域的情况下伯氏疏螺旋体 OspA 的单层 β-折叠的形成”J.Mol.Biol..(待提交)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Hiroaki Sasakawa: "Secondary stuctures and structural fluctuation in a dimeric protein,Streptomyces subtilisin inhibitor"J.Biochem,. 126. 859-865 (1999)
Hiroaki Sasakawa:“二聚体蛋白的二级结构和结构波动,链霉菌枯草杆菌蛋白酶抑制剂”J.Biochem,。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Atsuo Tamura: "Cold denaturation and foldeng/unfolding of a protein at low temperature in Excerpta Medica ICS"ELSEVIER,Amsterdam. 7 (1999)
Atsuo Tamura:“医学摘录 ICS 中蛋白质在低温下的冷变性和折叠/解折叠”ELSEVIER,阿姆斯特丹。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Hiroaki Sasakawa: "Backbone 1H,13C,and 15N resonance assignments of Strepromyces subtilisin inhibitor"J.Biomol.NMR,. 14. 285-286 (1999)
Hiroaki Sasakawa:“链霉菌枯草杆菌蛋白酶抑制剂的主链 1H、13C 和 15N 共振分配”J.Biomol.NMR,。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Keisuke Tominaga: "Spectroscopic application of THz radiation generated by ultrashot pulses -Static far infrared absorption measurements in condensed phases"Advances in Multiphoton Processes and Spectoroscopy,. (印刷中). (2000)
Keisuke Tominaga:“超射脉冲产生的太赫兹辐射的光谱应用 - 凝聚相中的静态远红外吸收测量”多光子过程和光谱学的进展(2000 年出版)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 8 条
タンパク質分子と集合体の機能化デザイン
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批准号:18031026
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$7.81万
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财政年份:2006
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负责人:田村 厚夫
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依托单位:
小型タンパク質の構造形成能を左右する必要十分条件の探索
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批准号:13780534
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$1.34万
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财政年份:2001
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负责人:田村 厚夫
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依托单位:
リアルタイム測定によるタンパク質折りたたみ機構の高空間分解能解析
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批准号:09780608
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1997
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负责人:田村 厚夫
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依托单位:
Osmolyteを利用したタンパク質の折りたたみ機構の解析
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批准号:08272218
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1996
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负责人:田村 厚夫
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依托单位:
Osmolyteを利用したタンパク質の折りたたみ機構の解析
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批准号:08272218
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1996
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负责人:田村 厚夫
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依托单位:
海外基金