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ゲノム構成要素としての転移因子の組み換え機構解析のためのバキュロウイルスの利用

利用杆状病毒分析转座元件作为基因组成分的重组机制

基本信息

批准号：
13876077
负责人：
前川秀彰
金额：
$ 1.22万
依托单位：
National Institute of Infectious Diseases
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2001
资助国家：
日本
起止时间：
2001 至 2002
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-13876077/
关键词：
レトロトランスポゾン R1Bm R2Bm BMC1 LINE1 カイコ逆転写酵素エンドヌクレアーゼ

项目摘要

レトロトランスポゾンは転移因子として分類されているが、キイロショウジョウバエのテロメアにおける末端保護配列という新たな機能を獲得したように、染色体の重要な構成要素として位置付けることが出来る。また、最近、これらの転移因子様配列が修復に関係している報告が出てきており、この視点からも、ゲノムへのそれらの挿入機構を解析することは、染色体そのものの成り立ちを探る上で重要な意味をもつ。そのためにバキュロウイルスに組み込んだ効率の良い解析系を使用したカイコnon-LTR型レトロトランスポゾンBMC1の挿入機構の解析進めることにした。この解析系を利用してリボゾーマルDNAクラスターに特異的に挿入されているレトロトランスポゾンR2Bmを解析した結果、エンドヌクレアーゼと逆転写酵素のORFを一つしか持たないR2Bmは、Target Primed Revers Transcription(TPRT)反応により3'末端は挿入できるが、5'末端は挿入できなかった。そこで将来的にも利用範囲の広いgag様配列を含むORF1とエンドヌクレアーゼと逆転写酵素を含むORF2をもつBMC1を候補に選んだ。われわれが単離した配列はORF1を含まなかったので、ORF1及びORF2を含む配列をPCR法により構築し、バキュロウイルスへの組み込みを進めている。コードしている配列が確かに目的のペプチドに変換されるかを昨年検証し、エンドヌクレアーゼ・ドメインをクローン化し大腸菌中でペプチドを生成しそのアミノ酸配列をGCマス・スペクトロメーターで解析し目的のペプチドを確認した。ORF1を持つモデルとしてリポゾーマルDNA特異的に挿入が起こるR1BmについてもPCR法でクローン化しバキュロウイルスへの組み込みを今年度行い細胞への導入を行った。結果、効率はそれほど高くないが導入が認められた。またR1Bmの導入位置については、部位特異的と考えられているが実際はそれほど固定されていなかったことから、R2Bmとは異なる機構が働いているかもしれない。この問題については、R1Bm同様にORF1を持つBMC1についても検証を行うことが必要である。BMC1についてはベクター内に構築されたが引き続き導入実験を進めている段階である。我々の構築した解析系がレトロトランスポゾンを初めRNA型転移因子様配列の導入解析に極めて有効であることが再度確認できたことから、トランスポゾンのようなDNA型転移因子の解析にも利用できると考えている。

The first step is to establish a new chromosome structure. The most recent, most recent, and most recent shift factors are reported to be related to repair, and the most recent, most recent shift factors are reported to be related to repair. The analysis of the penetration mechanism of BMC1 is based on the analysis of the penetration mechanism of BMC 1. This analysis was performed by using the specific DNA sequence analysis results of R2Bm, target primed revers transcription (TPRT) reverse sequence analysis results of R2Bm, target primed revers transcription (TPRT) reverse sequence analysis results of R2Bm, Target Primed revers transcription(TPRT) reverse sequence analysis results of R2Bm, Target Primed Revers Transcription(TPRT) reverse sequence analysis results of R2Bm. In the future, we will use the following methods: ORF 1, BMC 2, BMC 3, BMC 4, BMC 5, BMC 6, BMC 7, BMC 8, BMC 9, BMC 10, BMC 10, BMC 11, BMC 12, BMC 13, BMC 14, BMC 15, BMC 16, BMC 17, BMC 18, BMC 19, BMC 19, BMC ORF1 and ORF2 are included in the PCR method. In the case of Escherichia coli, it is necessary to identify the target of the acid sequence in the GC and to identify the target of the acid sequence. ORF1 is a DNA specific gene that can be introduced into a cell by PCR. As a result, the rate of change is high and the rate of change is high. R1Bm and R2 Bm are introduced at different positions. The problem is that R1Bm is the same as ORF1 and BMC1. BMC1 is the most important part of the project. The analysis of DNA type shift factors is based on the analysis of DNA type shift factors.