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発疹の分布に関与する表皮モザイクと遺伝子メチル化の研究

皮疹分布中表皮嵌合和基因甲基化的研究

基本信息

批准号：
15659260
负责人：
榊原章浩
金额：
$ 2.11万
依托单位：
Nagoya University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2003
资助国家：
日本
起止时间：
2003 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15659260/
关键词：
モザイクメチル化 SNP ダイレクトシークエンス

项目摘要

本研究の目的は皮膚においてDNAのメチル化がどのようにモザイク分布し、その結果どのような皮膚の状態変化を引き起こすかを明らかにすることである。平成15年度にはメチル化の解析を開始する予定であったが、健常者サンプルの収集が未だ不十分であった。一方、本講座で行割れているモザイク様の色素斑、脱色素斑を形成する疾患である遺伝性対側性色素異常症(Dyschromatosis Symmetrica Hereditaria以下DSHと略。)の研究の進展により、DSHの発症にメチル化のモザイクが関与するのではないかとの発想に至った。そこで平成15年度は、加齢によりモザイク状に現れる色素斑、脱色素斑とDNAメチル化モザイクに関して明らかにする前段階として、DSHの原因遺伝子の発見を目的とした研究をおこなった。具体的にはDSH原因遺伝子の発見のため、DSH候補領域内に存在しDSHの原因と考えられそうな遺伝子配列を、Beckman社のDTCS kitと同社のCEQ2000XL Genetic Analyzerを用いてダイレクトシーケンスを行い、変異及びSNPに関して調べた。また、DSH候補領域内の既知SNPに関しては、ABI社のHuman Assays-on-Demand^<TM> SNP Genotyping Productsと、同社のABI PRISM【○!R】 7700 Sequence Detection Systemを用い、判定を行った。その結果変異こそ見つからなかったものの、SNPとこれまで調べられたハプロタイプ及び家系のデータを統合することで、約800kbであったDSH原因遺伝子の候補領域を約350kbに縮めることができた。

The purpose of this study was to investigate the distribution of DNA in the skin and to investigate the changes in the skin state. In 2015, the analysis of the group began to be determined, and the group of healthy people was not divided into ten groups. One side, this lecture is divided into three parts: pigment spots, depigmentation spots, formation of diseases such as Dyschromatosis Symmetrica Hereditaria (DSH). The progress of research, development of DSH, development of DSH, development of DSH, In 2015, the study of pigment spots, depigmentation spots and DNA transformation in the early stages of DSH was carried out. Specific DSH cause gene discovery, DSH candidate domain existence, DSH cause gene discovery, Beckman DTCS kit and CEQ2000 XL Genetic Analyzer are used to determine the relationship between DSH cause gene discovery, DSH cause gene discovery, DSH candidate domain existence, and SNP. SNP Genotyping Products, ABI PRISM, ABI Human Assays-on-Demand<TM>, ABI Human Assays-on-Demand R] 7700 Sequence Detection System The results are different. The candidate fields for DSH cause gene are about 800kb. The candidate fields for SNP and family are about 350kb.