人工呼吸誘発多臓器不全メカニズムの遺伝子発現解析とシステム論的解明

机械通气致多器官衰竭机制的基因表达分析和系统理论阐明

• 批准号: 16650112
• 负责人: 野城 真理
• 金额: $ 2.18万
• 依托单位: Kitasato University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 2005
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16650112/
• 关键词: 人工呼吸; VALI; 伸展刺激; 肺動脈内皮細胞; 網羅的遺伝子発現解析; IL-8; 肺損傷; アポトーシス; サイトカイン; 二酸化炭素; pH

正常ヒト肺動脈内皮細胞(normal human pulmonary endothelial cells:HPAEC)を培養細胞伸縮装置(Flexercell, Tension Plus System : FX-4000T)によって24時間伸展し、伸展しない細胞を対照として用いて、網羅的遺伝子発現解析を行った。同解析にはAffymetrix社製のDNAマイクロアレイ(GeneChip, Human Genome Focus Array)および、解析システムGeneChipR Scanner 3000 with Workstationを用いた。伸展刺激の有無によって生存細胞数に変化はなかった。しかし、伸展刺激負荷の細胞から抽出できたmRNAの量が刺激なしの細胞より少なかったことから、伸展刺激負荷によって細胞に影響があったと考えられる。また、伸展によってIL-8が有意に増加した。DNAマイクロアレイによる網羅的遺伝子発現解析では、伸展刺激を加えた細胞では細胞周期に関連するmRNAの発現が特に増加した。具体的には、細胞周期のコントロールに関与するcyclinやcyclin dependent kinase(CDK)、細胞周期の調節に大きな役割を持ちアポトーシスを促進するtumor protein p53(TP53)などの増加が見られた。またKyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG:http://www.genome.jp/kegg)のパスウエイデータベースを用い発現変化を解析すると、伸展刺激によって変化の生じたmRNAはCell Cycle、Calcium signaling pathway、Apoptosis、Regulation of actin cytoskeletonなどのパスウエイに多く含まれることがわかった。これらより、伸展刺激によってDNAになんらかの障害が生じ、それを排除・修復する方向に遺伝子の発現が変化していることが考えられる。

Normal human pulmonary endothelial cells (HPAEC) were cultured in Flexercell (Tension Plus System : FX-4000T) for 24 hours to stretch, stretch, and analyze the expression of genes in cultured cells. The GeneChip Scanner 3000 with Workstation is used in the same way as the GeneChip, Human Genome Focus Array. The number of cells in the cell line was increased by the extension stimulation. The amount of mRNA extracted from the cells under the stress of stretch stimulation affects the cells under the stress of stretch stimulation. IL-8 was intentionally increased. The expression of mRNA related to cell cycle was significantly increased due to the increase of DNA stretch stimulation. Specific cell cycle regulation related to cyclin and cyclin dependent kinase(CDK), cell cycle regulation related to tumor protein p53(TP53), and increase in tumor protein p53(TP53). The Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG:http://www.genome.jp/kegg) contains the following information: Cell Cycle, Calcium signaling pathway, Apoptosis, Regulation of actin cytoskeleton, etc. In addition, the development of DNA damage caused by stretch stimulation and the development of DNA damage caused by removal and repair of DNA damage caused by stretch stimulation are examined.

项目成果

Medical diagnosis and prognosis based on the DNA microarray technology(B.G.Silverman, A.Jain A.Ichalkaranje, L.C.Jain eds.)Intelligent Paradigms in Healthcare Enterprisis

基于 DNA 微阵列技术的医学诊断和预后（B.G.Silverman、A.Jain A.Ichalkaranje、L.C.Jain 编辑）医疗保健企业的智能范式

• 发表时间: 2005
• 作者: Y.Fukuoka;H.Inaoka;I.S.Kohane
• 通讯作者: I.S.Kohane

Inter-species differences of co-expression of neighboring genes in eukarvotic venomes

真核毒液中邻近基因共表达的种间差异

• 期刊: BMC Genomics
• 影响因子: 4.4
• 作者: Fukuoka Y;Inaoka H;Kohane IS
• 通讯作者: Kohane IS

Local and systemic expression of inducible nitric oxide synthase in comparison with that of cyclooxygenase-2 in rat carrageenin-induced pleurisy.

大鼠角叉菜胶诱导的胸膜炎中诱导型一氧化氮合酶的局部和全身表达与环氧合酶-2 的比较。

• 发表时间: 2005
• 期刊: Nitric Oxide-Biol Chem 12
• 作者: Fujisawa H;Nakagawa S;Ohkubo Y;Matsui M;Yamaguchi S;Kawamura M;Hatanaka K;Kawakubo Y;Hiramoto Y;Kobayashi H;Harada Y
• 通讯作者: Harada Y

Lower expression of genes near microRNA in C-elegans germline

• DOI: 10.1186/1471-2105-7-112
• 发表时间: 2006-03-06
• 期刊: BMC BIOINFORMATICS
• 影响因子: 3
• 作者: Inaoka, H;Fukuoka, Y;Kohane, IS
• 通讯作者: Kohane, IS

Invasive meningioma is associated with a low expression of E-cadherin and β-catenin

侵袭性脑膜瘤与 E-钙粘蛋白和 β-连环蛋白的低表达有关

• 发表时间: 2005
• 期刊: Clin Neuropathol 24
• 作者: Umemura S;Takekoshi;Suzuki Y;Saitoh Y;Tokuda Y;Osamura RY.;Utsuki S
• 通讯作者: Utsuki S