ORFの存在しないシロイヌナズナ発生分化関連突然変異遺伝子の解析

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シロイヌナズナacaulis2突然変異体は、花茎伸長欠損を示す。3型メタマーのみに欠損を持つユニークな変異であり解析に値すると考えている。今までの遺伝子分析により、1番染色体100遺伝子地図単位の300kb領域に一塩基置換を見出している。しかし、ここには有意なORFはない。この野生型DNA断片を変異体に導入すると、全てではないが一定の頻度で変異表現型を回復した。この頻度につき詳しく検討したが、配列と回復頻度に有意な差は見出せなかった。以上のような状況から、この現象にはタンパク質をコードしないRNAが本変異に関わっている可能性がある。RACE法により、この領域の転写産物を詳細に分析して、いくつかの産物を発見した。この変異点の両方のDNA鎖から転写され、両方の産物に変異部位の塩基が存在した。さらに、既に役割の分かっているsmallRNAに相当する分子種も存在し、いくつかは変異点を含んでいた。したがって、ACL2遺伝子の働き方は、なんらかのnon-coding RNA分子として機能していることが推定された。遺伝子機能をさらに推定するために、下流の遺伝子発現を探索して、病原遺伝子群の上昇が起こっていることを発見した。病原遺伝子とのなんらかの関わりが推定された。また、酷似した変異表現型の関与遺伝子SLS1遺伝子との相互作用をさらに詳細に検討したが、直接的な相互作用は、見出されなかった。