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イメージングマスによる肺癌及び特発性肺線維症の発症・進展の分子機構に関する検討

利用影像质量研究肺癌及特发性肺纤维化发病进展的分子机制

基本信息

批准号：
17659244
负责人：
柳澤聖
金额：
$ 1.54万
依托单位：
Nagoya University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至 2006
项目状态：
已结题

项目摘要

ヒト肺癌の発症・進展の分子機構の解明に寄与する事を目指して、本年度は以下の成果を得た。1.マトリクス支援レーザー脱離イオン化質量分析器(MALDI MS)を応用し、174症例の非小細胞肺癌(NSCLC)から手術摘出された腫瘍組織(training cohort;116検体,test cohort 58検体)及び正常肺組織(27検体)計201検体を用いた直接的網羅的タンパク発現プロファイル解析を遂行し、training cohortにおける検討結果から、2600種類以上の異なるタンパク発現情報を取得した。2.取得したタンパク発現情報に基づき、NSCLC術後予後予測を可能とするプロファイルの抽出を、バイオインフォマティクス手法を最大限に活用する事により行い、NSCLC術後予後に有意に関連の認められる178個のタンパクからなる発現プロファイルを見出した。3.上述の予後関連タンパク発現プロファイルに基づき、NSCLC術後予後予測モデルの構築を目指し、weighted voting法を応用し、10-fold cross validationによるモデル最適化を行った結果、25個のシグナルを用いた予測モデルの構築に至った。この予測モデルの汎用性の検証を、58症例からなるtest cohortから取得されたデータセットを用いて行った結果、予測モデルを用いた判別に基づくoverall survivalは、High-risk群(中間生存=24か月)と、Low-risk群(中間生存=未達)との間で統計的学的有意差を認め(P<0.001)、その高い予測精度が独立したデータセットにおいても確認された。これらの成果は、MALDIMSを用いたタンパク発現プロファイル解析が、臨床試料に応用可能であり、予防・診断・治療法の開発に向けた分子標的の探索に有用である可能性を示すものと考えた。

The molecular structure of lung cancer and its progress have been explained and reported, and the following results have been obtained this year. 1. MATLAB supports the use of MALDI mass analyzer (MALDI MS) and surgical removal of tumor tissue from 174 cases of non-small cell lung cancer (NSCLC) (training cohort; 116 patients, test cohort) 58 bodies) and normal lung tissue (27 bodies), 201 bodies were analyzed and carried out by direct analysis and training The results of the cohort study are available, and the current information on more than 2,600 types of different items is obtained. 2. Obtain clinical information and post-operative prognosis for NSCLC Possible extraction technique Make the most of your work, use it to the best of your ability, and be interested in the post-operative care for NSCLC. Recognize められる178 のタンパクからなる発appear プロファイルを见出した. 3. The above-mentioned post-pregnancy correlation test, post-pregnancy prediction test for NSCLC, weighted voting method, and 10-fold cross The results of the optimization of the validation system and the prediction of the system using 25 のシグナルを and the construction of the system.この Prediction of モデルのGeneral-purpose の検 syndrome を, 58 cases of からなるtest Cohort acquisition results, prediction results, and predictions of the results and judgments of the cohort overall survival, High-risk group (median survival = 24 months), Low-risk group (median survival = not yet reached), There is no significant statistical difference between the two statistics (P<0.001), and the prediction accuracy is high and the prediction accuracy is independent. The results of MALDIMS are analyzed, the results of MALDIMS are analyzed, and the use of clinical samples is possible. The development of preventive, diagnostic, and therapeutic methods has led to the exploration of molecular targets and the possible use of them.