歯髄からのミトコンドリアDNAの多型解析

牙髓线粒体DNA多态性分析

• 批准号: 17659665
• 负责人: 小室 歳信
• 金额: $ 1.66万
• 依托单位: Nihon University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17659665/
• 关键词: 歯科法医学; 歯髄; ミトコンドリアDNA; hypervariable region; 構造解析; C-stretch

室内に1〜23年間保存された日本人永久歯140例から抽出した歯髄mtDNAを試料とし、D-loop領域に位置する高変異領域(hypervariable region、HV領域)の多型解析を行った。まず、HV1領域(nt16081-16390)において、塩基置換や挿入あるいは欠失などの変異は77ヵ所(24.8%)に認められた。最も頻度が高かった変異はnt16223においてCがTへ置換する例で、109例(77.9%、C16223T)に認められた。C連続の配列パターン(C-stretch)は14通り出現し、最も頻度の高かったパターンはCCCCCTCCCC(5C1T4C)で81例(57.9%)に認められた。この配列はAndersonらと同じ構造を示すものであった。つぎに、HV2領域(nt73-354)の変異について検討したところ、56ヵ所(19.9%)に認められた。A263Gがすべての試料で認められた。また、nt315とnt316の間に1塩基Cの挿入した例(nt315.1C)が135例(96.4%)出現した。両所見は日本人集団の特徴的な所見と思われる。nt248やnt316などでは塩基の欠失例が出現(0.7%)し、個人識別にはむしろ有効な所見と思われた。C-stretchは7通り出現し、8C1T6Cが63例(45.0%)出現した。Andersonらと同じ構造を示す例は認められなかった。さらに、HV3領域(nt438-594)における変異は21ヵ所(13.4%)に認められた。T489C(64.3%)が最も頻度は高かった。C-stretchは5通り出現し、最も頻度の高かったパターンは6C(Andersonらと同じ構造)で130例(92.9%)出現した。歯髄mtDNA140例はHV1-3領域の配列パターンによって128型に分類され、法医鑑識領域における個人識別に有用であることが判明した。

140 samples of Japanese permanent dentition preserved indoors for 1 ~ 23 years were extracted and analyzed for polymorphism in hypervariable region (HV region) in D-loop region. 77 (24.8%) of the total number of cases in the HV1 domain (nt16081-16390) were identified. The highest frequency was found in 109 cases (77.9%, C16223T). C-stretch (C-stretch) was found in 81 cases (57.9%) of CCCCCC (5C1T4C). The same structure as Anderson. In the HV2 domain (nt73-354), 56 percent (19.9%) of the respondents were identified. A263G is a test sample. In the interval between nt315 and nt316, 135 cases (96.4%) of the cases with 1-D base C were found (nt 315.1C). What I see is the characteristics of the Japanese group. Nt248 and nt316 are missing (0.7%), and personal identification is missing (0.7%). C-stretch 7, 8 1 6 63 cases (45.0%) appeared. Anderson's similar structure is shown in this example. In addition, HV3 fields (nt438-594) were different from 21 fields (13.4%). T489C (64.3%) was the most frequent. C-stretch is the most frequent occurrence in 130 cases (92.9%). 140 cases of mtDNA in HV1-3 domain are classified and identified as useful in forensic identification.