PCR法による歯石からのHLADQα型,PM^R型およびSTR型分析について

关于利用PCR法分析牙结石的HLADQα型、PM^R型和STR型

• 批准号: 07672238
• 负责人: 小室 歳信
• 金额: $ 1.41万
• 依托单位: Nihon University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
• 财政年份: 1995
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1995 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-07672238/
• 关键词: 歯科法医学; 個人識別; 歯髄; 歯石; HLADQα型; PM^R型; 遺伝子型頻度; 遺伝子頻度

歯髄および歯石を試料として,PCR法によるHLADQα型(239/242bp)およびPolymarker(PM^R:LDLR(214bp),GYPA(190bp),HBGG(172bp),D7S8(151bp),GC(138bp))型検査を行い,それぞれの遺伝子型および遺伝子の出現頻度について検討した。また各ローカスの組合せによる個人識別の有用性についても検討した。【試料・方法】試料は歯科治療時に採取した新鮮歯髄76例・新鮮歯石10例,および1〜10年間室内に放置した歯から採取した陣旧歯髄19例である。DNA抽出は歯髄は洗浄・乾燥した後に細切し,また歯石は洗浄・0.5M EDTAで半日脱灰した後,通法に従い行った。PCR増幅は,HLADQα座位ではパーキンエルマ-社のAmplitype^<TM>キットに,またPM^R座位では同社のAmplitype^RPMキットのプロトコールに準じた。DNA型検出はリバース・ドットブロット・ハイブリダゼーション法により行った。【成績・考察】歯髄95例および歯石10例についてHLADQα型およびPM^R型検査を行ったところ,すべての例で型検出は可能であった。HLADQα型の遺伝子型は21タイプのうち11タイプが出現した。1.3-3型が24.2%と最も多く,ついで3-3型21.1%,1.2-3型18.9%および3-4型13.7%の順であった。遺伝子の出現頻度は3が52.6%と最も多く,ついで1.3が16.8%,1.2が13.7%,4が12.1%および1.1が4.7%の順であり,2の遺伝子は認められなかった。ある集団の中で任意の2人を選んだ時,その2人の型が異なって判定される識別率(power of discrimination, PD)を算出した結果,0.8302であった。一方,PM^R型検査では,各ローカスの遺伝子数は2ないしは3個であるために,各ローカスの遺伝子型数による各PDは低いが,PM^R型としてのPDは0.9925であった。HLADQα型およびPM^R型による総合PDは0.9987であり,個人識別能は極めて向上した。以上,各遺伝子座位のallele sizeは小さいことから,低分子化したDNAの型検出には適していると考えられた。STR(short tandem repeat)型分析は,現在,実験継続中である。

HLADQα (239/242bp) and Polymarker(PM^R:LDLR(214bp),GYPA(190bp),HBGG(172bp), D7S8 (151bp),GC(138bp)) types were detected by PCR in order to detect the frequency of occurrence of these gene types. The usefulness of personal identification is discussed in the context of the combination of each category. [Sample·Method] 76 fresh teeth were taken during dental treatment, 10 fresh teeth were taken, and 19 old teeth were taken during 1 ~ 10 years of indoor treatment. DNA was extracted and washed, dried and then cut into fine pieces. After washing with 0.5M EDTA and half a day's ashing, the sample was processed. PCR amplification,HLADQ alpha <TM>position The DNA type of the virus was detected by DNA sequencing. 95 cases of HLADQα-type and PM^R type were detected in 10 cases of HLADQα-type and PM^R type, and some cases of HLADQα-type and PM ^R type were detected in 10 cases. HLADQα-type genetic variants are found in 21 and 11 regions. 1.3-3 The most common type is 24.2%, the most common type is 3-3 21.1%, the most common type is 1.2 -3 18.9%, the most common type is 3-4 13.7%. The frequency of the occurrence of the missing seed is 3: 52.6% and the most frequent, 1.3: 16.8%, 1.2: 13.7%, 4: 12.1%: 1.1: 4.7% and 2:2. When any two people in the group are selected, the power of discrimination (PD) of the two people is calculated, and the result is 0.8302. One side,PM^R type check, the number of descendants of each type is 2, 3, the number of descendants of each type is low,PM^R type PD is 0.9925. HLADQα-type PM^R-type PD = 0.9987 The allele size of each gene locus is small, and the molecular weight of DNA is low. STR(short tandem repeat) type analysis, now,.

项目成果

堤 博文: "歯からのPM^R型およびHLADQα型検出について" DNA多型 Vol. 3. 328-332 (1995)

Hirofumi Tsutsumi：“从牙齿中检测 PM^R 型和 HLADQα 型”DNA 多态性 Vol. 3. 328-332 (1995)

小室 歳信: "DNA型検査による歯からの個人識別" 東京都歯科医師会雑誌. 44(発表予定). (1996)

Toshinobu Komuro：“使用 DNA 类型测试进行牙齿个人鉴定”，东京牙科协会杂志 44（待出版）。