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エージェントの協調による染色体画像からの領域抽出・同定法に関する研究

Agent协作的染色体图像区域提取与识别方法研究

基本信息

批准号：
18650075
负责人：
阿部亨
金额：
$ 2.05万
依托单位：
Tohoku University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至 2007
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18650075/
关键词：
バイオインフォマティクス染色体画像処理エージェント

项目摘要

本研究課題は,画像から染色体領域を抽出し,各染色体領域を同定する二つの処理を高精度に行う新たな手法『1本の染色体領域を複数の部分領域の連なりと見なし,画像中で各部分領域を特異的に探索するエージェントを相互に協調させ,染色体領域の抽出・同定を同時に行う』の確立を目指している.本年度は,より多様な染色体画像へ提案手法を適応させるたに以下の検討を行い,その結果を,前年度実装した試作システムへ反映し,提案手法に対する評価実験を実施した.●小領域の探索精度は,染色体のフェーズ,染色状態など種々の要因に左右される.そこで,これらの要因が探索精度に与える影響を分析し,参照用部分バンドパターンを補正する手法を検討した.具体的には,対象画像の状態に応じ,探索に用いる参照用部分バンドパターンの輝度値と長さを補正する手法を提案した.●探索に用いる参照用部分バンドパターンは,分割の仕方により種々のものが考えられ,その中のどれを探索に用いるかは探索精度に大きな影響を与える.そこで,ある参照用部分バンドパターンを対象画像に適用した場合の探索誤りを事前に推定する手法を検討した.これに基づき,対象画像に応じて,探索に適した参照用部分バンドパターンを事前に推定する手法の提案を行った.●改良・拡張を行った試作システムを用いて,種々の状態(染色体領域が相互に重なる場合,染色体に構造異常が生じている場合など)をシミュレートした画像を対象とした評価実験を実施し,それらの画像に対する提案手法の有効性を確認した.

This research topic is to extract chromosome domain from image, to determine the identity of each chromosome domain, to deal with the two domains with high precision, to establish a new method of "connecting multiple partial domains in one chromosome domain, to explore the identity of each partial domain in image, to coordinate each other, and to extract and determine the identity of chromosome domain simultaneously." This year, the following tests were conducted on the proposed methods for multiple chromosome profiling, and the results were compared with those of the previous year.● Small field of exploration accuracy, chromosome, staining status, species and important factors. The main reason for this is to analyze the influence of exploration accuracy, and to discuss the method of correction with reference to some parts. Specifically, the state of the image, explore the use of the reference part of the luminance value of the proposal● Search for the middle of the reference part of the text, partition the official side of the text, search for the middle of the text, search for the middle of the text, search for the accuracy of the text. The method of searching for errors in advance is discussed. This is the first time that I have ever seen a picture of myself.● The improvement of the chromosome structure and the status of the chromosome structure (in the case where the chromosome domain overlaps each other).