抗体の特異性を利用したタンパク質の一次構造解析

使用抗体特异性进行蛋白质一级结构分析

• 批准号: 15655066
• 负责人: 森山 昭彦
• 金额: $ 1.98万
• 依托单位: Nagoya City University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 2005
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15655066/
• 关键词: 抗体; タンパク質の一次構造; 化学修飾; 一次構造; モノクローナル抗体; アミノ酸配列分析

トリペプチド配列を特異認識する抗体の作成を2年連続して試みたが、トリペプチドの配列の前後に隣接するアミノ酸残基により抗体のエピトープに対する親和性が大きく影響されるため、トリペプチドだけをエピトープとして認識する抗体も作成できなかった。また、疎水性の高い3アミノ酸が連続する配列を認識する特異抗体を作成することもできなかった。従って、抗体ライブラリーでプロテインチップを作成しても、抗体との反応性のみ(すなわちチップの反応性のパターンだけ)からペプチドの一次構造を推定することは困難と思われた。タンパク質のアミノ基FITCを用いて化学修飾し、プロテアーゼで消化後にさらにPITCにより新出のアミノ基を化学修飾し、抗PITC抗体カラムに通じることにより、アミノ末端由来ペプチドを得る事は可能であったが、抗体カラムが安定性でないこと、再利用も困難なことから実用化にはさらなる工夫が必要と考えられる。検出系としてMALDI-TOFを用いることの可能な系(ゲノムデータベース等により質量数からだけでもある程度配列分析が可能な場合)では、比較的微量サンプルに対する化学修飾の条件を標準化することができれば、実用化もある程度可能であると思われた。また、微量化するには反応条件のさらなる検討が必要であるが、抗体カラムの代わりに固相化された活性カルボキシル基とODSカラムを併用して、アミノ基のブロックされたペプチドを選択的に濃縮することも可能であり、今後の検討課題である。

ト リ ペ プ チ ド match column を specific know す る antibody の made を 2 years even 続 し て try み た が, ト リ ペ プ チ ド の arrangement before and after の に 隣 meet す る ア ミ ノ acid residues に よ り antibody の エ ピ ト ー プ に す seaborne る affinity が big き く influence さ れ る た め, ト リ ペ プ チ ド だ け を エ ピ ト ー プ と し て know す る antibody も made で き な か っ た. High い ま た, water-based 疎 の 3 ア ミ ノ acid が even 続 す る match column を know す る specific antibodies を made す る こ と も で き な か っ た. 従 っ て, antibody ラ イ ブ ラ リ ー で プ ロ テ イ ン チ ッ プ を made し て も, antibody と の anti 応 sex の み (す な わ ち チ ッ プ の anti 応 sex の パ タ ー ン だ け) か ら ペ プ チ ド の a presumption tectonic を す る こ と は difficult と think わ れ た. タ ン パ ク qualitative の ア ミ ノ base FITC を with い て chemically modified し, プ ロ テ ア ー ゼ で after digestion に さ ら に PITC に よ り new の ア ミ ノ base を chemically modified し, PITC antibody カ ラ ム に tong じ る こ と に よ り, ア ミ ノ end origin ペ プ チ ド る matter は を could で あ っ た が, antibody カ ラ ム が stability で な い こ と, again To make it difficult, な, と, ら, practical, に, さらなる, time-consuming, が, necessary, と, test えられる. 検 out department と し て MALDI - TOF を with い る こ と の may have な department (ゲ ノ ム デ ー タ ベ ー ス etc に よ り mass number か ら だ け で も あ る degree with column analysis may が な) で は, comparison of trace サ ン プ ル に す seaborne る chemically modified の conditions を standardized す る こ と が で き れ ば, be use も あ る degree of で あ る と think わ れ た. ま た, trace amount す る に は anti 応 conditions の さ ら な る beg が 検 necessary で あ る が, antibody カ ラ ム の generation わ り に solid phase change さ れ た active カ ル ボ キ シ ル base と ODS カ ラ ム を and し て, ア ミ ノ base の ブ ロ ッ ク さ れ た ペ プ チ ド を sentaku に concentrated す る こ と も may で あ り, future の 検 for subject で あ る.