骨髄系腫瘍における網羅的エクソーム・ゲノム解析

骨髓肿瘤的综合外显子组/基因组分析

• 批准号: 15H06324
• 负责人: 牧島 秀樹
• 金额: $ 1万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• 财政年份: 2015
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2015-08-28 至 2016-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15H06324/
• 关键词: 骨髄系腫瘍; ゲノム解析

平成27年度には、MDSおよびMDS関連疾患（MDS/MPN・二次性AML）において、たんぱく質をコードするゲノム領域の体細胞変異をターゲットとして全エクソームシーケンスを行った。これまで解析済の検体に加えて、合計で100例以上を解析したのち、48遺伝子にドライバー変異を発見した。続いて、ドライバー遺伝子に基づいて標的遺伝子深度シーケンスのパネルを作成し、コホートをさらに拡大して体細胞変異を検索した。この際、遺伝子変異の各フェノタイプにおける頻度がエクソームシーケンスと標的シーケンスで再現できるかを確認し、結果の妥当性を確保した。さらに、エクソームおよび標的シーケンスを用いて経時的な解析を行い、①病初期に獲得される変異と進展期に獲得される変異を分類(TET2, DNMT3Aなど)。②サブクローンのうち進展期に腫瘍全体を占めまでに増加する変異を同定（PHF6、IDH2など）。③経過中に治療などにより消失する変異の特徴を検討。④病期が進展しない症例を対照とすることにより、真に病期進行に帰する遺伝子変異を決定した（NRAS, PTPN11）。全ゲノムシーケンスに関しては体細胞、胚細胞DNAの2ペアをMDSにおいて解析した。初期は、低深度スクリーニング（X20）にて構造異常を含めたスクリーニングを行い、さらに高深度（X30以上）シーケンスにて体細胞変異を確認した。全エクソンシーケンスにより認められた複数の体細胞変異には、シーケンス深度を含めたベイジアンディリクレモデルを当てはめ、多様なクローン構造と腫瘍内多様性を正確に評価した。以上により、遺伝子解析に基づいて、MDS関連疾患の病態の本質である、ドライバー遺伝子の抽出、腫瘍内多様性および階層性を明らかにすることが可能であった。

In Pingcheng, in the year 27, there was an increase in the number of patients with MDS diseases (MDS/ MPN secondary AML). In the year 27, Pingcheng suffered from diseases (secondary AML). A total of more than 100 cases were analyzed and analyzed, and 48 cases were analyzed. The depth of the child, the depth of the body, the depth of the body, the body cell, the body, the body, the Please make sure that you are sure that it is appropriate to make sure that it is appropriate to make sure that you are in good condition. In the early stage of the disease, the patients in the early stage of the disease received the TET2, DNMT3A classification. 2. During the advanced period, all participants will be responsible for the same decision (PHF6, IDH2 agreement). 3. In the middle of the treatment, you will disappear. You will have a special problem. (4) the cases of progressive symptoms during the disease stage and the real disease stage were examined by NRAS (PTPN11). The whole body cell, embryo cell, DNA cell, embryo cell, MDS cell, somatic cell and embryo cell were analyzed. In the early stage and in the low depth (X20), the system usually contains the information of the high depth (above X30), the high depth (above X30), the body cell and the confirmation. In the whole system, you need to know that the number of cells is different, and that the depth of the data contains information about the number of cells, the number of cells, the depth, the depth, the number of cells, the depth, the depth, the number of cells, the depth of data, the number of cells, the depth of data, the number of cells, the number of cells, the number of cells. The above information is analyzed in terms of basic symptoms, MDS diseases, symptoms, signs of disease, symptoms, signs, signs, signs,

项目成果

骨髄腫瘍における多様なゲノム異常とその臨床的意義

骨髓肿瘤的多种基因组异常及其临床意义

• 发表时间: 2016
• 作者: lo M;Husseinzadeh H;Makishima H;Przychodzen B;Ashkar M;Koyutürk M;Maciejewski JP;LaFramboise T.;K. Abe;Ryou Kubota;牧島秀樹
• 通讯作者: 牧島秀樹

Clonal dynamics in myelodysplastic syndromes.

骨髓增生异常综合征的克隆动力学。

• 发表时间: 2016
• 作者: Hiromura Munenori;Nohtomi Kyoko;Mori Yusaku;Kataoka Hideo;Sugano Marika;Ohnuma Kei;Kuwata Hirotaka;Hirano Tsutomu;Nagai Y.;高橋 裕;Hideki Makishima.
• 通讯作者: Hideki Makishima.

骨髄異形成症候群(MDS)の基礎と臨床 基礎1 ゲノム解析により明らかとなったMDSと再生不良性貧血との境界

骨髓增生异常综合征（MDS）的基础知识和临床基础1：基因组分析揭示MDS与再生障碍性贫血的界限

• 发表时间: 2015
• 作者: 小川拓哉;田中麻子;Nittikarn Suwanawat;川本 純;栗原達夫;牧島秀樹 小川誠司
• 通讯作者: 牧島秀樹 小川誠司

Cleveland Clinic(米国)

克利夫兰诊所（美国）

Aberrant DNA Methylation Is Associated with a Poor Outcome in Juvenile Myelomonocytic Leukemia.

• DOI: 10.1371/journal.pone.0145394
• 发表时间: 2015
• 期刊: PloS one
• 影响因子: 3.7
• 作者: Sakaguchi H;Muramatsu H;Okuno Y;Makishima H;Xu Y;Furukawa-Hibi Y;Wang X;Narita A;Yoshida K;Shiraishi Y;Doisaki S;Yoshida N;Hama A;Takahashi Y;Yamada K;Miyano S;Ogawa S;Maciejewski JP;Kojima S
• 通讯作者: Kojima S