蛇紋岩水系に優占する新規微生物の好アルカリ機構に関与する遺伝子群の網羅的解析

蛇纹岩水系统中占主导地位的新微生物嗜碱机制相关基因的综合分析

• 批准号: 15H06907
• 负责人: 鈴木 志野
• 金额: $ 0.92万
• 依托单位: Japan Agency for Marine-Earth Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• 财政年份: 2015
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2015-08-28 至 2016-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15H06907/
• 关键词: 蛇紋岩化作用; 好アルカリ性微生物; 比較ゲノミクス; Serpentinomonas

おおむね順調に遂行した。１．Comamonadaceae科に属する微生物の比較ゲノミクスによる好アルカリ性Serpentinomonas属菌特異遺伝子群の抽出The Cedars蛇紋岩水系から単離されたSerpentinomonas A1、B1、H1株はpH11を至適pHに持つ好アルカリ性微生物である。ゲノム解析の結果、未知の好アルカリ性機構を有していると考えられた。よって、好アルカリ性Serpentinomonasと近縁の好中性菌を比較ゲノミクスすることで、Serpentinomonas属菌の好アルカリ性に関与する遺伝子群を明らかにすることにした。まずSerpentinomonas属菌のゲノム近縁の好中性菌の約半分であることが分かった。また、詳細な遺伝子解析では陽イオンやリン酸の輸送蛋白をコードする遺伝子群において、顕著な違いが見られた。このことは高アルカリ環境に適応するため、特殊な陽イオンの濃度勾配によるエネルギー代謝機構を獲得し、また、エネルギー、リン酸利用を最小化するため、ゲノムを縮小した姿が浮かび上がった。２．Serpentinomonas属菌の陽イオン勾配に関する生理学的解析陽イオン濃度勾配を考える上で、まずpHと生育の詳細な理解が必要となる。培養瓶による回分培養ではpHを安定させることが不可能であるため不適切である。よって共同研究者らと連続培養槽を用いて解析した結果、少なくともpH12.5までは非常に良好に生育することが分かった。さらに高いpHでも生育する可能性が高いが、12.5を超えると、連続培養槽内で安定したpHを維持することが困難であった。今後、この連続培養系を用い、各種カチオンがSerpentinomonasの生育に与える影響を調べ、かつ、１．の課題で抽出された好アルカリ性特異遺伝子群の発現解析を行うことで、この菌の好アルカリ性機構の解明を目指す。

It's a good idea to do it. 1. Comparison of microorganisms belonging to The genus Comamonadaceae and isolation of Serpentinomonas specific genetic subgroups from the Cedars serpentine water system. Serpentinomonas A1, B1, H1 strains are isolated from Serpentinomonas at pH11. The results of the analysis, the unknown and the good quality of the organization have been examined. A comparison between Serpentinomonas and Neonatal Serpentinomonas shows that Serpentinomonas has a high degree of specificity and a low degree of specificity. Serpentinomonas spp. is a genus of bacteria that is close to the genus Serpentinomonas. It is a genus of neutral bacteria. For example, if you want to find out more about this protein, you can find out more about this protein. This is the first time that a person has ever been involved in an activity involving the production of a substance. 2. The physiological analysis of Serpentinomonas is necessary for the detailed understanding of pH and fertility. Culture flasks are not suitable for pH stability The co-investigator analyzed the results of the culture tank and found that the pH of the solution was 12.5. The possibility of fertility at high pH is high, 12.5 is high, and it is difficult to maintain stable pH in the culture tank. In the future, the use of this culture system, the regulation of the effects of various cultures on the growth and development of Serpentinomonas, and the analysis of the development of specific gene groups in Serpentinomonas were discussed.

项目成果

University of Southern California(米国)

南加州大学（美国）