パスウェイバーデン解析に基づく多発性硬化症リスク遺伝子の疾患多様性への寄与の解明
パスウェイバーデン解析に基づく多発性硬化症リスク遺伝子の疾患多様性への寄与の解明
批准号:
17H06938
负责人:
磯部 紀子
金额:
$1.75万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
财政年份:
2017
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2017-08-25 至 2019-03-31
中文摘要
本研究では、多発性硬化症(multiple sclerosis; MS)における疾患感受性遺伝子の多様性と疾患表現型の多様性と関連性を明らかにすることを目的とした。これまでの研究によりMSの病態への寄与が示唆され、本研究で注目する遺伝子機能分類(gene ontology)12個を決定し、MS患者それぞれに対し、各gene ontologyについてどの程度遺伝的負荷を有しているかを示す、MSパスウェイバーデン(MSPB)を算出した。どのような役割を持つ遺伝子群が発症年齢や重症度といった各疾患表現型の多様性に寄与しているのかを解明するため、各MSPBと疾患表現型との相関について統計学的に解析した。米国カリフォルニア大学サンフランシスコ校(UCSF)における630例のMS症例コホートデータと、最新の国際MS遺伝子解析コンソーシアムの研究において同定されたMSリスク関連一塩基多型(SNP)200個を基に、12個のMSPBを算出した。それぞれについて、MSPBの凝集度と臨床的パラメータ―やMRI画像における各解剖学的容積との関連を解析した。結果、加齢に関わるMSPBが高い程、MSの発症が早く、NFkBシグナリングに関わるMSPBが高い程、頭部MRIにおける皮質下灰白質容積が小さいことが、統計学的有意差を持って示された。これにより、加齢に関わる遺伝的要因が発症時期に寄与し、NFkBシグナリングの遺伝的負荷量が大脳の特定の領域における萎縮度に関与していることが示唆された。得られた成果について、国内外の学会で発表を行った。
英文摘要
本研究では、多発性硬化症(multiple sclerosis; MS)における疾患感受性遺伝子の多様性と疾患表現型の多様性と関連性を明らかにすることを目的とした。これまでの研究によりMSの病態への寄与が示唆され、本研究で注目する遺伝子機能分類(gene ontology)12個を決定し、MS患者それぞれに対し、各gene ontologyについてどの程度遺伝的負荷を有しているかを示す、MSパスウェイバーデン(MSPB)を算出した。どのような役割を持つ遺伝子群が発症年齢や重症度といった各疾患表現型の多様性に寄与しているのかを解明するため、各MSPBと疾患表現型との相関について統計学的に解析した。米国カリフォルニア大学サンフランシスコ校(UCSF)における630例のMS症例コホートデータと、最新の国際MS遺伝子解析コンソーシアムの研究において同定されたMSリスク関連一塩基多型(SNP)200個を基に、12個のMSPBを算出した。それぞれについて、MSPBの凝集度と臨床的パラメータ―やMRI画像における各解剖学的容積との関連を解析した。結果、加齢に関わるMSPBが高い程、MSの発症が早く、NFkBシグナリングに関わるMSPBが高い程、頭部MRIにおける皮質下灰白質容積が小さいことが、統計学的有意差を持って示された。これにより、加齢に関わる遺伝的要因が発症時期に寄与し、NFkBシグナリングの遺伝的負荷量が大脳の特定の領域における萎縮度に関与していることが示唆された。得られた成果について、国内外の学会で発表を行った。
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Emerging importance of big data in neuroimmunological research
大数据在神经免疫学研究中日益显现的重要性
DOI:
10.1111/cen3.12451
发表时间:
2018
期刊:
Clin Exp Neuroimmunol
影响因子:
--
作者:
[Canto E, MS-EPIC Study Group、Isobe N, Didonna A, Hauser SL, Oksenberg JR., Isobe N.]
通讯作者:
Isobe N.
パスウェイバーデン解析による多発性硬化症リスク遺伝子の疾患多様性への寄与の検討
通过途径负荷分析检查多发性硬化症风险基因对疾病多样性的贡献
DOI:
--
发表时间:
2018
期刊:
影响因子:
--
作者:
[磯部紀子, UCSF MS EPIC team]
通讯作者:
UCSF MS EPIC team
Genetic descriptors of a multiple sclerosis cohort
多发性硬化症队列的遗传描述符
DOI:
--
发表时间:
2018
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Isobe N, for the University of California San Francisco MS-EPIC team.]
通讯作者:
for the University of California San Francisco MS-EPIC team.
DOI:
10.1111/cen3.12443
发表时间:
2018-02
期刊:
Clinical and Experimental Neuroimmunology
影响因子:
--
作者:
[N. Isobe]
通讯作者:
N. Isobe
Genetic risk factors for MS in non-Caucasian populations.
非白人人群中多发性硬化症的遗传危险因素。
DOI:
--
发表时间:
2018
期刊:
影响因子:
--
作者:
[三上友理恵, 藤井慎介, 永田健吾, 和田裕子, 長谷川佳那, 安部みさき, 吉本怜子, 中村誠司, 清島保, Isobe N.]
通讯作者:
Isobe N.
共 9 条
中枢神経系自己免疫性疾患における炎症調節機構の解明
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批准号:24K02371
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.81万
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财政年份:2024
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负责人:磯部 紀子
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依托单位:
Identification of interaction between sex chromosomes and HLA in central nervous system autoimmune diseases
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批准号:21K07464
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.66万
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财政年份:2021
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负责人:磯部 紀子
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依托单位:
脱髄性神経疾患における疾患感受性および病態進行に関わる遺伝学的要因の解明
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批准号:14J03139
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.75万
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财政年份:2014
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负责人:磯部 紀子
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依托单位:
海外基金