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DNAメチル化がTDP-43の自己調節に与える影響に着目したALS病態の解明

DNAメチル化がTDP-43の自己調節に与える影響に着目したALS病態の解明
阐明 ALS 病理学,重点关注 DNA 甲基化对 TDP-43 自身调节的影响
批准号:
19K23961
负责人:
小池 佑佳
金额:
$1.83万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
财政年份:
2023
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2023-02-26 至 2024-03-31

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
私は,TARDBP 3’UTR のDNAメチル化状態が選択的スプライシング機構を介し,TARDBPの発現量を規定するのではないかと推測した.まずはゲノム編集の手法により,HEK293T細胞のTARDBP 3 'UTR にあるCpG部位を特異的に脱メチル化させ,TARDBPの選択的スプライシング効率とmRNA発現量を評価した.次に,非中枢神経疾患患者 8例由来の凍結剖検脳組織 (運動野皮質,後頭葉皮質および小脳半球) を用いて,TARDBP 3 'UTR のCpG部位のメチル化状態を解析した.さらに,運動野皮質において,TARDBP 3’UTRのDNAメチル化率と選択的スプライシング効率の関連を検討した.TARDBP 3’UTRの15か所のCpG部位を標的特異的に脱メチル化させた細胞では,コントロール細胞と比べ,TARDBP pre-mRNAの選択的スプライシング効率が減弱し,TARDBP mRNA 発現量は約2倍に増加した.剖検脳組織の解析では,TARDBP 3'UTRのDNAメチル化率は,脳領域に依存して異なっていた.運動野皮質では,これらのCpG部位のDNAメチル化率は,年齢とともに減少していた.さらに,運動野皮質において,TARDBP 3'UTRの一部のCpG部位のDNAメチル化率は選択的スプライシング効率と有意に正の相関を示した.これまでの研究において,TARDBP 3'UTRのDNAメチル化状態が,TARDBP mRNAの発現量を規定することを示した.また,健常脳組織の解析から,TARDBP 3'UTRのDNAメチル化状態は,脳領域や加齢による影響を受けやすいことが示唆された.ALS病態におけるエピジェネティクスの寄与を明らかにするため,研究再開後は,孤発性ALS患者脳を用いて,TARDBP 3’UTRのDNAメチル化状態が変容しているか,調べる予定である.
英文摘要
私は,TARDBP 3’UTR のDNAメチル化状態が選択的スプライシング機構を介し,TARDBPの発現量を規定するのではないかと推測した.まずはゲノム編集の手法により,HEK293T細胞のTARDBP 3 'UTR にあるCpG部位を特異的に脱メチル化させ,TARDBPの選択的スプライシング効率とmRNA発現量を評価した.次に,非中枢神経疾患患者 8例由来の凍結剖検脳組織 (運動野皮質,後頭葉皮質および小脳半球) を用いて,TARDBP 3 'UTR のCpG部位のメチル化状態を解析した.さらに,運動野皮質において,TARDBP 3’UTRのDNAメチル化率と選択的スプライシング効率の関連を検討した.TARDBP 3’UTRの15か所のCpG部位を標的特異的に脱メチル化させた細胞では,コントロール細胞と比べ,TARDBP pre-mRNAの選択的スプライシング効率が減弱し,TARDBP mRNA 発現量は約2倍に増加した.剖検脳組織の解析では,TARDBP 3'UTRのDNAメチル化率は,脳領域に依存して異なっていた.運動野皮質では,これらのCpG部位のDNAメチル化率は,年齢とともに減少していた.さらに,運動野皮質において,TARDBP 3'UTRの一部のCpG部位のDNAメチル化率は選択的スプライシング効率と有意に正の相関を示した.これまでの研究において,TARDBP 3'UTRのDNAメチル化状態が,TARDBP mRNAの発現量を規定することを示した.また,健常脳組織の解析から,TARDBP 3'UTRのDNAメチル化状態は,脳領域や加齢による影響を受けやすいことが示唆された.ALS病態におけるエピジェネティクスの寄与を明らかにするため,研究再開後は,孤発性ALS患者脳を用いて,TARDBP 3’UTRのDNAメチル化状態が変容しているか,調べる予定である.
期刊论文(3)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
小池 佑佳,加藤 泰介,廣川 祥子,小林 憲太,辻 省次,小野寺 理
小池佑香、加藤大辅、广川翔子、小林健太、辻庄二、小野寺修
DOI: --
发表时间: 2019
期刊:
影响因子: --
作者: [Yuka Koike, Akihiro Sugai, Akio Yokoseki, Tomohiko Ishihara, Norikazu Hara, Junko Ito, Takeshi Ikeuchi, Akiyoshi Kakita, Osamu Onodera, Therapeutic strategy based on genome editing for dentatorubral-pallidoluysian atrophy., 歯状核赤核・淡蒼球ルイ体萎縮症モデルマウスに対するゲノム編集効果]
通讯作者: 歯状核赤核・淡蒼球ルイ体萎縮症モデルマウスに対するゲノム編集効果
Alteration of TDP-43 autoregulation-relevant splicing by DNA methylation status of TARDBP DNA
TARDBP DNA 的 DNA 甲基化状态改变 TDP-43 自身调节相关剪接
DOI: --
发表时间: 2019
期刊:
影响因子: --
作者: [Yuka Koike, Akihiro Sugai, Akio Yokoseki, Tomohiko Ishihara, Norikazu Hara, Junko Ito, Takeshi Ikeuchi, Akiyoshi Kakita, Osamu Onodera]
通讯作者: Osamu Onodera
Yuka Koike,Taisuke Kato,Sachiko Hirokawa,Kenta Kobayashi,shoji Tsuji, Osamu Onodera
小池佑香、加藤大辅、广川幸子、小林健太、辻庄司、小野寺修
DOI: --
发表时间: 2019
期刊:
影响因子: --
作者: [Yuka Koike, Akihiro Sugai, Akio Yokoseki, Tomohiko Ishihara, Norikazu Hara, Junko Ito, Takeshi Ikeuchi, Akiyoshi Kakita, Osamu Onodera, Therapeutic strategy based on genome editing for dentatorubral-pallidoluysian atrophy.]
通讯作者: Therapeutic strategy based on genome editing for dentatorubral-pallidoluysian atrophy.
DNAメチル化の摂動とDNA損傷・修復応答に着目した孤発性ALSの病態解明
  • 批准号:
    24K10635
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 资助金额:
    $2.91万
  • 财政年份:
    2024
  • 负责人:
    小池 佑佳
  • 依托单位:
国内基金
海外基金
TDP-43通过CXCL10/CXCR3重塑星形胶质细胞-突触对话介导偏头痛认知障碍机制研究
  • 批准号:
    2025JJ60697
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    --
  • 批准年份:
    2025
  • 负责人:
    龚俏宇
  • 依托单位:
知母皂苷AⅢ靶向TDP-43激活cGAS/STING信号轴介导免疫原性细胞死亡发挥抗肿瘤免疫的分子机制研究
  • 批准号:
    2024A02018
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    --
  • 批准年份:
    2024
  • 负责人:
    李泽荣
  • 依托单位:
TDP-43 通过抑制线粒体自噬激活 mtDNA-cGAS/STING 通路调控细胞焦亡在慢 加急肝衰竭的机制研究
  • 批准号:
    Q24H030017
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    --
  • 批准年份:
    2024
  • 负责人:
    张晓倩
  • 依托单位:
TDP-43/ALKBH5通过调控CDC25A外显子跳跃介导胶质母细胞瘤瘤内异质性
  • 批准号:
    82303932
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    30万元
  • 批准年份:
    2023
  • 负责人:
    谢思迪
  • 依托单位: